WikiDer > BOSS (molekulyar mexanika)
BOSS (molecular mechanics)
| Asl muallif (lar) | Uilyam L. Yorgensen |
|---|---|
| Tuzuvchi (lar) | Jorgensen tadqiqot guruhi, Yel universiteti |
| Dastlabki chiqarilish | 1987 |
| Barqaror chiqish | 4.9 / 2013 yil yanvar |
| Yozilgan | Fortran |
| Operatsion tizim | Unix, Linux, Windows |
| Platforma | x86, x86-64 |
| Mavjud: | Ingliz tili |
| Turi | Molekulyar modellashtirish |
| Litsenziya | Mulkiy |
| Veb-sayt | zarbi |
Biokimyoviy va organik simulyatsiya tizimi (BOSS) amalga oshiradigan umumiy maqsadli molekulyar modellashtirish dasturi molekulyar mexanika hisob-kitoblar, Metropolis Monte-Karlo statistik mexanika simulyatsiyasi va yarimempirik Ostin Model 1 (AM1), PM3va PDDG / PM3 kvant mexanikasi hisob-kitoblar.[1] Molekulyar mexanika hisob-kitoblari energiyani minimallashtirish, normal rejimni tahlil qilish va suyuq simulyatsiyalar uchun optimallashtirilgan potentsial bilan konformatsion qidirishni o'z ichiga oladi (OPLS) kuch maydonlari. BOSS prof. Uilyam L. Yorgensen da Yel universiteti, va Cemcomco, MChJ va Shredinger, Inc.
Asosiy xususiyatlar
- OPLS kuch maydoni ixtirochi
- Geometriyani optimallashtirish
- Yarimempirik kvant kimyosi
- Sof suyuqliklar, eritmalar, klasterlar yoki gaz fazali tizimlar uchun MC simulyatsiyalari
- Erkin energiya statistik bezovtalikdan hisoblanadi (erkin energiya buzilishi (FEP)) nazariyasi
- TIP3P, TIP4P va TIP5P suv modellari
Shuningdek qarang
- Molekulyar modellashtirish
- Molekulyar grafikalar
- Molekula muharriri
- Molekulyar dizayn dasturi
- Monte-Karlo molekulyar modellashtirish uchun dasturiy ta'minot ro'yxati
- Molekulyar grafik tizimlar ro'yxati
- Molekulyar mexanikani modellashtirish uchun dasturiy ta'minotni taqqoslash
- Abalone (molekulyar mexanika)
- AMBER
- Ascalaph Designer
- CHARMM
- GROMACS
- MDynaMix
- NAMD
- Tinker (dasturiy ta'minot)
Adabiyotlar
- ^ Yorgensen, U.L.; Tirado-Rives, J. (2005). "BOSS va MCPRO yordamida organik va biomolekulyar tizimlarni molekulyar modellashtirish". J. Komput. Kimyoviy. 26 (16): 1689–1700. doi:10.1002 / jcc.20297. PMID 16200637.