WikiDer > Kobalt xelataza

Cobalt chelatase
kobalt xelataza
EVWong CC2XVX raytraced.png
Kobalt xelataza monomeri Desulvobrio vulgaris.[1]
Identifikatorlar
EC raqami6.6.1.2
CAS raqami81295-49-0
Ma'lumotlar bazalari
IntEnzIntEnz ko'rinishi
BRENDABRENDA kirish
ExPASyNiceZyme ko'rinishi
KEGGKEGG-ga kirish
MetaCycmetabolik yo'l
PRIAMprofil
PDB tuzilmalarRCSB PDB PDBe PDBsum
Gen ontologiyasiAmiGO / QuickGO
Kobalt xelataza, CobT subbirligi
Identifikatorlar
BelgilarCobT
PfamPF06213
InterProIPR006538

Kobalt xelataza (EC 6.6.1.2) an ferment bu kataliz qiladi The kimyoviy reaktsiya

ATP + gidrogenobirin kislotasi a, c-diamid + Co2+ + H2O ADP + fosfat + kob (II) irin kislotasi a, c-diamid + H+

To'rt substratlar bu fermentlar ATP, gidrogenobirin kislotasi a, c-diamid, Co2+va H2O; uning to'rttasi mahsulotlar bor ADP, fosfat, kob (II) irin kislotasi a, c-diamidva H+.

Aerobik kobalt xelataza (aerobik kobalamin biosintezi yo'li)[2][3] CobT, CobN uchta subbirligidan iborat (InterPro: IPR003672) va CobS (InterPro: IPR006537).

The makrosikl ning vitamin B12 aerob yo'lidagi ATP ga bog'liq reaktsiyalar orqali metall bilan murakkablashishi mumkin (masalan, in Pseudomonas denitrificans) yoki ATP dan mustaqil reaktsiyalar orqali sirohidroxlorin anaerob yo'lda (masalan, ichida Salmonella typhimurium).[4][5] Tegishli kobalt xelatazalar gomologik emas. Shu bilan birga, aerobik kobalt xelataza subbirliklari CobN va CobS navbati bilan Mg-xelataza subchuniklari BchH va BchI uchun gomologik hisoblanadi.[5] CobT ham uzoq vaqtdan beri Mg-xelataza BchD ning uchinchi subbirligi bilan (bakterioxlorofil sintezida ishtirok etgan, masalan, Rodobakter kapsulatus) bog'liqligi aniqlandi.[5]

Ushbu ferment. Oilasiga tegishli ligazlar, xususan, koordinatsion komplekslarda azot-D-metall bog'lanishini hosil qiluvchi moddalar. The sistematik ism bu fermentlar sinfiga kiradi gidrogenobirin kislotasi-a, c-diamid: kobalt kobalt-ligaza (ADP hosil qiluvchi). Umumiy foydalanishdagi boshqa nomlarga quyidagilar kiradi gidrogenobirin kislotasi a, c-diamid kobaltokelataza, CobNSTva CobNCobST. Ushbu ferment kobalamin (B vitamini) ga olib boradigan biosintez yo'lining bir qismidir12) ichida aerob bakteriyalar.

Shuningdek qarang

Adabiyotlar

  1. ^ Romão, Célia V.; Ladakis, Dimitrios; Lobo, Susana A. L.; Karrondo, Mariya A.; Brindli, Amanda A.; Deeri, Evelyne; Matias, Pedro M.; Pikersgil, Richard V.; Saraiva, Ligiya M.; Uorren, Martin J. (2011 yil 4-yanvar). "Xelatazalar oilasidagi evolyutsiya faol joy assimetriyasi va oqsillar oligomerizatsiyasini joriy qilish orqali osonlashadi". Milliy fanlar akademiyasi materiallari. 108 (1): 97–102. doi:10.1073 / pnas.1014298108.
  2. ^ Crouzet J, Cameron B, Cauchois L, Rigault S, Blanche F, Guilhot C, Levy-schil S, Rouyez MC (1991). "Pseudomonas denitrificans DNK fragmentining genetik va ketma-ket tahlillari, ikkita kob genini o'z ichiga oladi". J. Bakteriol. 173 (19): 6058–6065. doi:10.1128 / jb.173.19.6058-6065.1991. PMC 208352. PMID 1917840.
  3. ^ Crouzet J, Cameron B, Blanche F, Tibo D, Debussche L, Couder M (1992). "Pseudomonas denitrificans-da koenzim B12 biosintezi paytida kobalt qo'shimchasini katalizatori bo'lgan noyob murakkab ferment - kobaltoklatazni tahlil qilish, tozalash va tavsifi". J. Bakteriol. 174 (22): 7445–7451. doi:10.1128 / jb.174.22.7445-7451.1992. PMC 207441. PMID 1429466.
  4. ^ Rot JR, Lourens JG, Bobik TA (1996). "Kobalamin (koenzim B12): sintezi va biologik ahamiyati" (PDF). Annu. Vahiy Mikrobiol. 50: 137–181. doi:10.1146 / annurev.micro.50.1.137. PMID 8905078.
  5. ^ a b v Willows RD, Al-Karadaghi S, Hansson M, Fodje MN, Hansson A, Olsen JG, Gough S (2001). "AAA moduli va integralin I domeni o'rtasidagi o'zaro bog'liqlik magnezium xelataza funktsiyasini tartibga solishi mumkin". J. Mol. Biol. 311 (1): 111–122. doi:10.1006 / jmbi.2001.4834. PMID 11469861.

Qo'shimcha o'qish

Ushbu maqola jamoat domenidagi matnlarni o'z ichiga oladi Pfam va InterPro: IPR006538