WikiDer > 180

Dock180
DOCK1
Mavjud tuzilmalar
PDBOrtholog qidiruvi: PDBe RCSB
Identifikatorlar
TaxalluslarDOCK1, DOCK180, ced5, Dock180, sitokinesis 1 ning dedikatori
Tashqi identifikatorlarOMIM: 601403 MGI: 2429765 HomoloGene: 55575 Generkartalar: DOCK1
Gen joylashuvi (odam)
Xromosoma 10 (odam)
Chr.Xromosoma 10 (odam)[1]
Xromosoma 10 (odam)
Genomic location for DOCK1
Genomic location for DOCK1
Band10q26.2Boshlang126,905,409 bp[1]
Oxiri127,452,517 bp[1]
Ortologlar
TurlarInsonSichqoncha
Entrez

1793

330662

Ansambl

ENSG00000150760

ENSMUSG00000058325

UniProt

Q14185

Q8BUR4

RefSeq (mRNA)

NM_001290223
NM_001380

NM_001033420

RefSeq (oqsil)

NP_001028592

Joylashuv (UCSC)Chr 10: 126.91 - 127.45 MbChr 7: 134.67 - 135.17 Mb
PubMed qidirmoq[3][4]
Vikidata
Insonni ko'rish / tahrirlashSichqonchani ko'rish / tahrirlash

180, (D.tuzuvchi of vytokinesis) sifatida ham tanilgan DOCK1, katta (~ 180 kDa) oqsil da ishtirok etish hujayra ichidagi signalizatsiya tarmoqlari.[5] Bu sutemizuvchidir orlog ning C. elegans oqsil CED-5 va ga tegishli DOCK oilasi Guaninning nukleotid almashinuvi omillari (GEF).[6]

Kashfiyot

A yordamida Dock180 aniqlandi uzoq g'arbiy blotting ning majburiy sherigi sifatida yondashuv adapter oqsili Crk bu qo'zg'atishga qodir edi morfologik o'zgarishlar yilda 3T3 fibroblastlar.[7] Keyinchalik Dock180 kichik GTP bilan bog'langan oqsilni faollashtira olganligi haqida xabar berilgan (G oqsili) Rac1[8] va keyinchalik bu GEF vazifasini bajarish qobiliyati orqali sodir bo'lganligi ko'rsatildi.[9]

Tuzilishi va funktsiyasi

Dock180 kichik G oqsillarini faollashtirish orqali uyali signalizatsiya hodisalariga hissa qo'shadigan katta oqsillar (GEF) sinfining bir qismidir. Ularning tinch holatida G oqsillari bog'langan Guanozin difosfat (YaIM) va ularni faollashtirish YaIMning ajralishini va majburiyligini talab qiladi guanozin trifosfat (GTP). GEFlar bu nukleotid almashinuvini rag'batlantirish orqali G oqsillarini faollashtiradi.

Dock180 va unga aloqador oqsillar tandemning kanonik tuzilishiga ega emasligi bilan boshqa GEFlardan farq qiladi. DH-PH nukleotid almashinuvini keltirib chiqaradigan ma'lum bo'lgan domenlar. Buning o'rniga ular a DHR2 domeni u nukleotidsiz holatida stabillashadigan Rac faollashuviga vositachilik qiladi.[9] Dock180 bilan bog'liq oqsillar shuningdek a DHR1 domeni ko'rsatilgan, in vitro, bog'lash fosfolipidlar[10] va ular bilan o'zaro aloqada bo'lishi mumkin uyali membranalar. Dock180 ning boshqa tarkibiy xususiyatlari quyidagilarni o'z ichiga oladi N-terminal SH3 domeni ELMO oqsillari bilan bog'lanishda ishtirok etadi (pastga qarang)[11] va a C-terminali prolin- boy mintaqa, qaysi Myoblast shahri (the Drosophila melanogaster ortholog Dock180), bog'lash uchun ko'rsatildi DCrk (the Drosophila ortologi Crk).[12]

Dock180 faoliyatini tartibga solish

Fiziologik sharoitda faqatgina Dock180 Racda nukleotid almashinuvini rag'batlantirishda samarasiz.[11] GEFning samarali faoliyati Dock180 va uning majburiy sherigi o'rtasida o'zaro aloqani talab qiladi ELMO. ELMO1 eng har tomonlama tavsiflangan izoform bu kichik oilaning oilasikatalitik ravishda Dock180-ni jalb qilish uchun ishlaydigan faol oqsillar plazma membranasi va GEF samaradorligini oshiradigan konformatsion o'zgarishlarni keltirib chiqaradi.[13][14][15] ELMO1 ning inhibisyoni haqida ham xabar berilgan ubikitinilatsiya Dock180 va shuning uchun uning parchalanishini oldini oling proteazomalar.[16] Qabul qiluvchi- tezkor faollashtirish RhoG (ning kichik G oqsili Rac subfamily) Dock180 GEF faoliyatining eng taniqli induktoridir. Faol (GTP bilan bog'langan) RhoG ELMO / Dock180 kompleksini plazma membranasiga jalb qiladi va shu bilan Dock180 ni uning bilan aloqa qiladi substrat, Rac.[17] Yilda o'sma Dock180 hujayralari Crk va o'z ichiga olgan kompleks bilan tartibga solinadi p130Cas bu o'z navbatida tomonidan kooperativ signalizatsiya bilan tartibga solinadi β3- tarkibida integral komplekslar va membrana bilan bog'langan oqsil uPAR.[18]

Dock180 quyi oqimidagi signalizatsiya

Dock180 - bu Rac-ga xos bo'lgan GEF va shuning uchun Rac-ga tegishli signalizatsiya hodisalarining bir qismi uchun javobgardir. Bunga quyidagilar kiradi hujayra migratsiyasi va fagotsitoz ning apoptotik hujayralar C. elegans,[19] neyrit o'sish PC12 hujayralari[20] va mioblast ichida birlashma Zebrafish embrion.[21] Yaqinda Dock180 ning DHR1 domeni bog'langanligi ko'rsatildi SNX5 (a nexinni saralash) va bu o'zaro ta'sir retrograd transportni rivojlantirdi kationdan mustaqil mannoz 6-fosfat retseptorlari uchun Trans-Golgi tarmog'i irqdan mustaqil ravishda.[22] Kattalashtirilgan ifoda Dock180 va Elmo kompaniyalari o'zlarining hissalarini qo'shganliklari haqida xabar berilgan glioma bosqin.[23]

O'zaro aloqalar

Dock180-ga ko'rsatildi o'zaro ta'sir qilish bilan:

Adabiyotlar

  1. ^ a b v GRCh38: Ensembl relizi 89: ENSG00000150760 - Ansambl, 2017 yil may
  2. ^ a b v GRCm38: Ensembl relizi 89: ENSMUSG00000058325 - Ansambl, 2017 yil may
  3. ^ "Human PubMed ma'lumotnomasi:". Milliy Biotexnologiya Axborot Markazi, AQSh Milliy Tibbiyot Kutubxonasi.
  4. ^ "Sichqoncha PubMed ma'lumotnomasi:". Milliy Biotexnologiya Axborot Markazi, AQSh Milliy Tibbiyot Kutubxonasi.
  5. ^ "Entrez Gen: sitokinezin 1 ning DOCK1 dedikatori".
  6. ^ Meller N, Merlot S, Guda S (2005 yil noyabr). "CZH oqsillari: Rho-GEFlarning yangi oilasi". J. Cell Sci. 118 (Pt 21): 4937-46. doi:10.1242 / jcs.02671. PMID 16254241.
  7. ^ Xasegawa H, Kiyokava E, Tanaka S va boshq. (1996 yil aprel). "CROC-ni bog'laydigan asosiy protein DOCK180, hujayra membranasiga o'tkazilganda hujayra morfologiyasini o'zgartiradi". Mol. Hujayra. Biol. 16 (4): 1770–76. doi:10.1128 / mcb.16.4.1770. PMC 231163. PMID 8657152.
  8. ^ Kiyokava E, Xashimoto Y, Kobayashi S va boshq. (1998 yil noyabr). "Cr1 SH3-biriktiruvchi oqsil, DOCK180 bilan Rac1 ning faollashishi". Genlar Dev. 12 (21): 3331–36. doi:10.1101 / gad.12.21.3331. PMC 317231. PMID 9808620.
  9. ^ a b Kote JF, Vuori K (2002 yil dekabr). "Guanin nukleotid almashinuvi faolligi bilan DOCK180 bilan bog'liq oqsillarning evolyutsion ravishda saqlanib qolgan superfamiliyasini aniqlash". J. Cell Sci. 115 (Pt 24): 4901-13. doi:10.1242 / jcs.00219. PMID 12432077.
  10. ^ Côté JF, Motoyama AB, Bush JA va boshq. (2005 yil avgust). "DOCK180 signalizatsiyasi uchun yangi va evolyutsion ravishda saqlanib qolgan PtdIns (3,4,5) P3 majburiy domeni zarur". Nat. Hujayra biol. 7 (8): 797–807. doi:10.1038 / ncb1280. PMC 1352170. PMID 16025104.
  11. ^ a b Brugnera E, Xeni L, Grimsli S va boshq. (Avgust 2002). "An'anaviy bo'lmagan Rac-GEF faoliyati Dock180-ELMO kompleksi orqali amalga oshiriladi". Nat. Hujayra biol. 4 (8): 574–82. doi:10.1038 / ncb824. PMID 12134158. S2CID 36363774.
  12. ^ Balagopalan L, Chen MH, Geisbrecht ER va boshq. (2006 yil dekabr). "CDM superfamily oqsil MBC fosfatidilinozitol 3,4,5-trifosfat bilan bog'lanishini talab qiladigan, ammo DCrk bilan to'g'ridan-to'g'ri o'zaro ta'sirga ega bo'lmagan mexanizm orqali miyoblast sintezini boshqaradi". Mol. Hujayra. Biol. 26 (24): 9442–55. doi:10.1128 / MCB.00016-06. PMC 1698515. PMID 17030600.
  13. ^ Lu M, Ravichandran KS (2006). "Rac aktivatsiyasida Dock180-ELMO hamkorligi". Met. Ferment. Enzimologiyadagi usullar. 406: 388–402. doi:10.1016 / S0076-6879 (06) 06028-9. ISBN 9780121828110. PMID 16472672.
  14. ^ Lu M, Kinchen JM, Rossman KL va boshq. (2004). "ELMO funktsiyalarining PH domeni transda Dock180 orqali Rac aktivatsiyasini tartibga solish ". Tabiatning strukturaviy va molekulyar biologiyasi. 11 (8): 756–62. doi:10.1038 / nsmb800. PMID 15247908. S2CID 125990.
  15. ^ Lu M, Kinchen JM, Rossman KL va boshq. (2005 yil fevral). "Dock180 GEF oilasi orqali nukleotid almashinuvini tartibga solish uchun sterik-inhibisyon modeli". Curr. Biol. 15 (4): 371–77. doi:10.1016 / j.cub.2005.01.050. PMID 15723800. S2CID 14267018.
  16. ^ Makino Y, Tsuda M, Ichixara S va boshq. (2006 yil mart). "Elmo1 Dock180 ning hamma joyda tarqalishini inhibe qiladi". J. Cell Sci. 119 (Pt 5): 923-32. doi:10.1242 / jcs.02797. PMID 16495483.
  17. ^ Katoh H, Negishi M (2003 yil iyul). "RhoG Rac1 ni Dock180 bilan bog'lovchi Elmo oqsili bilan bevosita ta'sir o'tkazish orqali faollashtiradi". Tabiat. 424 (6947): 461–64. doi:10.1038 / tabiat01817. PMID 12879077. S2CID 4411133.
  18. ^ Smit HW, Marra P, Marshall CJ (avgust 2008). "uPAR DOCK180 orqali Racni faollashtirish uchun p130Cas-Crk kompleksini shakllantirishga yordam beradi". J. Hujayra Biol. 182 (4): 777–90. doi:10.1083 / jcb.200712050. PMC 2518715. PMID 18725541.
  19. ^ Gumienny TL, Brugnera E, Tosello-Trampont AC va boshq. (Oktyabr 2001). "Fagotsitoz va hujayra migratsiyasi uchun CrkII / Dock180 / Rac yo'lining yangi a'zosi bo'lgan CED-12 / ELMO talab qilinadi" (PDF). Hujayra. 107 (1): 27–41. doi:10.1016 / S0092-8674 (01) 00520-7. PMID 11595183. S2CID 15232864.
  20. ^ Katoh H, Yasui H, Yamaguchi Y va boshqalar. (2000 yil oktyabr). "Kichik GTPase RhoG - bu PC12 hujayralaridagi neyrit o'sishi uchun asosiy regulyator". Mol. Hujayra. Biol. 20 (19): 7378–87. doi:10.1128 / MCB.20.19.7378-7387.2000. PMC 86291. PMID 10982854.
  21. ^ Mur CA, Parkin CA, Bidet Y va boshq. (2007 yil sentyabr). "Zebrafish mioblast birlashmasidagi Myoblast shahar homologlari Dock1 va Dock5 va adapter oqsillari Crk va Crk uchun rol". Rivojlanish. 134 (17): 3145–53. doi:10.1242 / dev.001214. PMID 17670792.
  22. ^ Xara S, Kiyokava E, Iemura SI va boshq. (2008 yil iyul). "DOCK180 ning DHR1 domeni SNX5 bilan bog'lanadi va kationga bog'liq bo'lmagan Mannose 6-fosfat retseptorlari tashilishini tartibga soladi". Mol. Biol. Hujayra. 19 (9): 3823–35. doi:10.1091 / mbc.E08-03-0314. PMC 2526700. PMID 18596235.
  23. ^ Jarzynka MJ, Xu B, Xui KM va boshq. (2007 yil avgust). "ELMO1 va Dock180, bipartitli Rac1 Guanin nukleotid almashinuvi omili, inson glioma hujayralarining ishg'ol qilinishini rag'batlantiradi". Saraton kasalligi. 67 (15): 7203–11. doi:10.1158 / 0008-5472. CAN-07-0473. PMC 2867339. PMID 17671188.
  24. ^ a b v Hsia DA, Mitra SK, Hauck CR, Streblow DN, Nelson JA, Ilic D, Huang S, Li E, Nemerow GR, Leng J, Spencer KS, Cheresh DA, Schlaepfer DD (Mar 2003). "FAK tomonidan hujayra harakatchanligi va invaziyasining differentsial regulyatsiyasi". J. Hujayra Biol. 160 (5): 753–67. doi:10.1083 / jcb.200212114. PMC 2173366. PMID 12615911.
  25. ^ a b Xasegawa H, Kiyokava E, Tanaka S, Nagashima K, Gotoh N, Shibuya M, Kurata T, Matsuda M (aprel 1996). "CROC-ni bog'laydigan asosiy protein DOCK180, hujayra membranasiga o'tkazilganda hujayra morfologiyasini o'zgartiradi". Mol. Hujayra. Biol. 16 (4): 1770–6. doi:10.1128 / MCB.16.4.1770. PMC 231163. PMID 8657152.
  26. ^ Nishihara H, Kobayashi S, Hashimoto Y, Ohba F, Mochizuki N, Kurata T, Nagashima K, Matsuda M (noyabr 1999). "Odamning CDM-oilasi oqsillari a'zosi DOCK2 ning yopishqoq bo'lmagan hujayralarga xos ifodasi". Biokimyo. Biofiz. Acta. 1452 (2): 179–87. doi:10.1016 / s0167-4889 (99) 00133-0. PMID 10559471.
  27. ^ Gu J, Sumida Y, Sanzen N, Sekiguchi K (Jul 2001). "Laminin-10/11 va fibronektin p130 (Cas) -CrkII-DOCK180 yo'li orqali integralga bog'liq bo'lgan Rho va Rac aktivatsiyasini differentsial ravishda tartibga soladi". J. Biol. Kimyoviy. 276 (29): 27090–7. doi:10.1074 / jbc.M102284200. PMID 11369773.
  28. ^ Matsuda M, Ota S, Tanimura R, Nakamura H, Matuoka K, Takenava T, Nagashima K, Kurata T (iyun 1996). "CRK amino-terminal SH3 domeni va uning tabiiy maqsadli oqsillari o'rtasidagi o'zaro bog'liqlik". J. Biol. Kimyoviy. 271 (24): 14468–72. doi:10.1074 / jbc.271.24.14468. PMID 8662907.
  29. ^ Gumienny TL, Brugnera E, Tosello-Trampont AC, Kinchen JM, Haney LB, Nishiwaki K, Walk SF, Nemergut ME, Macara IG, Frensis R, Schedl T, Qin Y, Van Aelst L, Hengartner MO, Ravichandran KS (Okt 2001) ). "Fagotsitoz va hujayra migratsiyasi uchun CrkII / Dock180 / Rac yo'lining yangi a'zosi bo'lgan CED-12 / ELMO talab qilinadi" (PDF). Hujayra. 107 (1): 27–41. doi:10.1016 / s0092-8674 (01) 00520-7. PMID 11595183. S2CID 15232864.
  30. ^ Brugnera E, Xeni L, Grimsli C, Lu M, Walk SF, Tosello-Trampont AC, Macara IG, Madhani H, Fink GR, Ravichandran KS (Avgust 2002). "An'anaviy bo'lmagan Rac-GEF faoliyati Dock180-ELMO kompleksi orqali amalga oshiriladi". Nat. Hujayra biol. 4 (8): 574–82. doi:10.1038 / ncb824. PMID 12134158. S2CID 36363774.

Qo'shimcha o'qish

Tashqi havolalar