WikiDer > Earth BioGenome loyihasi - Vikipediya

Earth BioGenome Project - Wikipedia
Earth BioGenome loyihasi
Muddati2018 yil 1-noyabr - 2028 yil
Veb-saytwww.earthbiogenome.org

The Earth BioGenome loyihasi (EBP) - bu ketma-ketlikni va kataloglashni maqsad qilgan tashabbus genomlar hozirda tasvirlangan Yerning ökaryotik o'n yil davomida turlari.[1] Ushbu tashabbus ochiq bo'ladi DNK ma'lumotlar bazasi ilmiy tadqiqotlar uchun platforma yaratadigan va atrof-muhitni muhofaza qilish tashabbuslarini qo'llab-quvvatlovchi biologik ma'lumot.[2] Loyiha istiqbollarini taqdim etgan ilmiy maqola chop etildi PNAS 2018 yil aprel oyida,[3] va loyiha rasmiy ravishda 2018 yil 1-noyabrda boshlandi.[4]

Tarix

Ushbu tashabbus ilhomlantirildi Inson genomining loyihasiva 2015 yil noyabr oyida bo'lib o'tgan uchrashuv paytida paydo bo'ldi Xarris Leyn (UCD), Gen E. Robinson (IGB) va V. Jon Kress (Smitson instituti"s Milliy tabiiy tarix muzeyi).[3][5] 2017 yil fevral oyida Smitson instituti tomonidan tashkil etilgan genomika va bioxilma-xillik bo'yicha katta konferentsiyada va BGI yilda Vashington, Kolumbiya loyihaning 10 yillik rejasi va tashkiliy tuzilmasi qo'llab-quvvatlandi.[3]

Xulosa

Loyiha qiymati 4,7 milliard AQSh dollarini tashkil etadi.[1] Bunga i5K (hasharotlar),[6] B10K (qushlar), 10KP (o'simliklar),[7][8] va Darvin hayot daraxti, bu Buyuk Britaniyada taxmin qilingan 66000 ta eukaryotik turni ketma-ketligini maqsad qilgan.[1] Loyiha uch bosqichda taxminan 1,5 millionga teng bo'lgan eukaryotik turlarni ketma-ketligini va izohlashini, birinchi navbatda "∼9000 ta eukaryotik taksonomik oilalarning har birining kamida bitta vakili turiga izohli xromosoma miqyosidagi mos yozuvlar to'plamlarini" yaratishni maqsad qilgan.[3][8]

Ga binoan PNAS qog'oz, bir nechta ketma-ketlik markazlari, shu jumladan loyihani qo'llab-quvvatlamoqda BGI (Xitoy), Baylor Tibbiyot kolleji (AQSH), Wellcome Sanger instituti (Buyuk Britaniya), Rokfeller universiteti (AQSh), tomonidan Janubiy Amerikada loyiha uchun qo'shimcha markaz tashkil etiladi San-Paulu tadqiqot fondi.[3] Genomikadan foydalanadigan bio-rasadxonalarga kelsak, loyiha ehtiyojlarini qondiradigan misollar keltirilgan Milliy ekologik observatoriya tarmog'i, Xitoyning ekologik tadqiqotlar tarmog'i, ForestGEO va MarineGEO.[3] Bu kabi "sayyora miqyosidagi" loyihalar uchun texnik talablar va texnik talablar to'g'risida tushuncha berish uchun 10000 o'simlik genom loyihasi "Raqamlashtirish Ruili botanika bog'i"a-da o'sadigan 761 ta qon tomir o'simlik namunalarini loyihalashtirish va ajratish Botanika bog'i Janubiy G'arbiy Xitoyda.[9]

Shuningdek qarang

Adabiyotlar

  1. ^ a b v "Tabiatni muhofaza qilish uchun DNKni tahlil qilish uchun Yerdagi hayot". Tabiat. Tabiat. 563 (7730): 155-156. Noyabr 2018. doi:10.1038 / d41586-018-07323-y. PMID 30401859.
  2. ^ "Dunyo ketma-ketligi". Iqtisodchi. 2018 yil 23-yanvar. Arxivlandi asl nusxasidan 2018 yil 24 yanvarda. Olingan 3 fevral, 2018.
  3. ^ a b v d e f Lewin HA, Robinson GE, Kress WJ, Beyker WJ, Coddington J, Crandall KA va boshq. (2018 yil aprel). "Earth BioGenome loyihasi: hayotning kelajagi uchun hayotni tartiblashtirish". Amerika Qo'shma Shtatlari Milliy Fanlar Akademiyasi materiallari. 115 (17): 4325–4333. doi:10.1073 / pnas.1720115115. PMC 5924910. PMID 29686065.
  4. ^ "Olimlar har bir turning DNKlarini xaritalashga kirishmoqdalar". Prezidentning kundalik xulosasi: qiziqarli. OZY. 2018 yil 2-noyabr. Olingan 2-noyabr, 2018.
  5. ^ Deyli J (2018 yil 5-noyabr). "1,5 million turdagi genomlarni ketma-ketlashtirish bo'yicha ulkan loyiha boshlandi". Smithsonian. Olingan 3 dekabr 2018.
  6. ^ i5K konsortsiumi (2013-09-01). "I5K tashabbusi: bilim, inson salomatligi, qishloq xo'jaligi va atrof-muhit uchun artropod genomikasini rivojlantirish". Irsiyat jurnali. 104 (5): 595–600. doi:10.1093 / jhered / est050. PMC 4046820. PMID 23940263.
  7. ^ Cheng S, Melkonian M, Smit SA, Brokington S, Archibald JM, Delaux PM va boshq. (Mart 2018). "10KP: Filodiversiv genomni tartiblashtirish rejasi". GigaScience. 7 (3): 1–9. doi:10.1093 / gigascience / giy013. PMC 5869286. PMID 29618049.
  8. ^ a b Exposito ‐ Alonso, Moises; Drost, Xaj-Georg; Burbano, Ernan; Vaygel, Detlef (2020-04-01). "Earth BioGenome loyihasi: o'simliklar genomikasi va uni muhofaza qilish imkoniyatlari va muammolari". 102 (2): 222–229. doi:10.1111 / tpj.14631. Iqtibos jurnali talab qiladi | jurnal = (Yordam bering)
  9. ^ Liu H, Vey J, Yang T, Mu V, Song B, Yang T va boshq. (2019 yil yanvar). "Botanika bog'ining molekulyar raqamlashtirilishi: Ruili botanika bog'idan 689 ta qon tomir o'simlik turlarining yuqori genom sekvensiyasi". GigaScience. 8. doi:10.1093 / gigascience / giz007. PMC 6441391. PMID 30689836.

Tashqi havolalar