WikiDer > Asosiy hujayra omili C1

Host cell factor C1
HCFC1
Mavjud tuzilmalar
PDBOrtholog qidiruvi: PDBe RCSB
Identifikatorlar
TaxalluslarHCFC1, CFF, HCF-1, HCF1, HFC1, MRX3, PPP1R89, VCAF, HCF, mezbon hujayra omili C1
Tashqi identifikatorlarOMIM: 300019 MGI: 105942 HomoloGene: 3898 Generkartalar: HCFC1
Gen joylashuvi (odam)
X xromosoma (odam)
Chr.X xromosoma (odam)[1]
X xromosoma (odam)
HCFC1 uchun genomik joylashuv
HCFC1 uchun genomik joylashuv
BandXq28Boshlang153,947,557 bp[1]
Oxiri153,971,818 bp[1]
RNK ekspressioni naqsh
PBB GE HCFC1 202473 x da fs.png

Ps.Bng da PBB GE HCFC1 202474 s
Qo'shimcha ma'lumotni ifodalash ma'lumotlari
Ortologlar
TurlarInsonSichqoncha
Entrez

3054

15161

Ansambl

ENSG00000172534

ENSMUSG00000031386

UniProt

P51610

61191

RefSeq (mRNA)

NM_005334

NM_008224

RefSeq (oqsil)

NP_005325

NP_032250

Joylashuv (UCSC)Chr X: 153.95 - 153.97 MbChr X: 73.94 - 73.97 Mb
PubMed qidirmoq[3][4]
Vikidata
Insonni ko'rish / tahrirlashSichqonchani ko'rish / tahrirlash

Uy egasi omil 1 (HCFC1, HCF1, yoki HCF-1), shuningdek, nomi bilan tanilgan VP16-qo'shimcha oqsil,[5] a oqsil odamlarda kodlanganligi HCFC1 gen.[6][7]

Tuzilishi

HCF1 yuqori darajada saqlanadigan hujayra omillari oilasiga kiradi va oqsilni beshta bilan kodlaydi Kelch takrorlaydi, a fibronektinga o'xshash motifva oltita HCF takrorlanadi, ularning har biri juda aniq dekolte signalini o'z ichiga oladi. Bu yadroviy transkripsiya yadrosi bu proteolitik mumkin bo'lgan oltita saytning birida yoki bir nechtasida bo'linib, natijada an yaratiladi N-terminal zanjir va mos keladigan C-terminali zanjir. Ushbu oqsilning yakuniy shakli kovalent ravishda bog'lanmagan N- va C-terminal zanjirlaridan iborat bo'lib, ular elektrostatik kuchlar ta'sirida bo'ladi.

Funktsiya

HCF1 boshqarishda ishtirok etadi hujayra aylanishi bilan bog'liq bo'lgan ko'plab jarayonlarda tartibga soluvchi rollarga ega bo'lish transkripsiya. Bundan tashqari, model organizmlarda ishlash HCF1ni taxminiy deb ta'kidlaydi uzoq umr aniqlovchi.[8] Shu bilan bir qatorda qo'shilgan turli xil oqsil izoformlarini kodlovchi variantlar tavsiflangan; ammo, barcha variantlar to'liq tavsiflanmagan.[7]

Ushbu genning mutatsiyalari buzilishi bilan bog'liq kobalamin metabolizm.[9]

O'zaro aloqalar

Xost hujayrasi faktori C1 ga ko'rsatildi o'zaro ta'sir qilish bilan:

Adabiyotlar

  1. ^ a b v GRCh38: Ensembl relizi 89: ENSG00000172534 - Ansambl, 2017 yil may
  2. ^ a b v GRCm38: Ensembl relizi 89: ENSMUSG00000031386 - Ansambl, 2017 yil may
  3. ^ "Human PubMed ma'lumotnomasi:". Milliy Biotexnologiya Axborot Markazi, AQSh Milliy Tibbiyot Kutubxonasi.
  4. ^ "Sichqoncha PubMed ma'lumotnomasi:". Milliy Biotexnologiya Axborot Markazi, AQSh Milliy Tibbiyot Kutubxonasi.
  5. ^ HCFC1 uchun GeneCards yozuvlari, http://genecards.org Arxivlandi 2013-10-14 da Orqaga qaytish mashinasi
  6. ^ Uilson AC, LaMarco K, Peterson MG, Herr V (iyul 1993). "VP16 aksessuar oqsillari HCF - bu katta kashshof oqsilidan qayta ishlangan polipeptidlar oilasi". Hujayra. 74 (1): 115–25. doi:10.1016/0092-8674(93)90299-6. PMID 8392914.
  7. ^ a b "Entrez Gen: HCFC1 xujayraning hujayra omili C1 (VP16 aksessuar oqsili)".
  8. ^ Li J, Ebata A, Dong Y, Rizki G, Ivata T, Li SS (sentyabr 2008). "Caenorhabditis elegans HCF-1 uzoq umr ko'rishda DAF-16 regulyatori sifatida ishlaydi". PLoS biologiyasi. 6 (9): e233. doi:10.1371 / journal.pbio.0060233. PMC 2553839. PMID 18828672.
  9. ^ Yu HC, Sloan JL, Scharer G, Brebner A, Kintana AM, Achilly NP, Manoli I, Coughlin CR, Geiger EA, Schneck U, Watkins D, Suormala T, Van Hove JL, Fowler B, Baumgartner MR, Rozenblatt DS, Venditti CP, Shaikh TH (sentyabr 2013). "HCFC1 transkripsiyali yadro regulyatoridagi mutatsiyalar natijasida kelib chiqqan X-kobalamin buzilishi". Amerika inson genetikasi jurnali. 93 (3): 506–14. doi:10.1016 / j.ajhg.2013.07.022. PMC 3769968. PMID 24011988.
  10. ^ Machida YJ, Machida Y, Vashisht AA, Wohlschlegel JA, Dutta A (Dekabr 2009). "Deubiqitinatsiya qiluvchi ferment BAP1 HCF-1 bilan ta'sir o'tkazish orqali hujayralar o'sishini tartibga soladi". Biologik kimyo jurnali. 284 (49): 34179–88. doi:10.1074 / jbc.M109.046755. PMC 2797188. PMID 19815555.
  11. ^ Lu R, Yang P, Padmakumar S, Misra V (1998 yil avgust). "Herpesvirus transaktivatori VP16 HCF bilan o'zaro aloqada insonning asosiy domeni bo'lgan lösin fermuar oqsili lumanni taqlid qiladi". Virusologiya jurnali. 72 (8): 6291–7. PMC 109766. PMID 9658067.
  12. ^ Freiman RN, Herr V (1997 yil dekabr). "Virusli mimika: VP16 va LZIP hujayra oqsillari bilan HCF bilan umumiy aloqasi". Genlar va rivojlanish. 11 (23): 3122–7. doi:10.1101 / gad.11.23.3122. PMC 316754. PMID 9389645.
  13. ^ Vogel JL, Kristie TM (Fevral 2000). "Yangi koaktivator C1 (HCF) ko'p proteinli kuchaytiruvchi hosil bo'lishini muvofiqlashtiradi va GABP orqali transkripsiyani faollashtirishda vositachilik qiladi". EMBO jurnali. 19 (4): 683–90. doi:10.1093 / emboj / 19.4.683. PMC 305606. PMID 10675337.
  14. ^ a b v d e f g Wysocka J, Myers MP, Laherty CD, Eisenman RN, Herr V (2003 yil aprel). "Inson Sin3 deatsetilaza va tritoks bilan bog'liq Set1 / Ash2 gistoni H3-K4 metiltransferaza hujayralar ko'payish faktori HCF-1 tomonidan tanlab bog'lanadi". Genlar va rivojlanish. 17 (7): 896–911. doi:10.1101 / gad.252103. PMC 196026. PMID 12670868.
  15. ^ a b v Yokoyama A, Vang Z, Visokka J, Sanyal M, Aufiero DJ, Kitabayashi I, Herr V, Cleary ML (Iyul 2004). "Leykemiya proto-onkoprotein MLL menoksin bilan SET1 ga o'xshash histon metiltransferaza kompleksini hosil qiladi va Hox gen ekspressionini tartibga soladi". Molekulyar va uyali biologiya. 24 (13): 5639–49. doi:10.1128 / MCB.24.13.5639-5649.2004. PMC 480881. PMID 15199122.
  16. ^ Scarr RB, Sharp PA (Avgust 2002). "PDCD2 - bu HCF-1 (C1) ning salbiy regulyatori". Onkogen. 21 (34): 5245–54. doi:10.1038 / sj.onc.1205647. PMID 12149646.
  17. ^ La Boissière S, Xyuz T, O'Hare P (Yanvar 1999). "VP16 ning HCFga bog'liq yadroviy importi". EMBO jurnali. 18 (2): 480–9. doi:10.1093 / emboj / 18.2.480. PMC 1171141. PMID 9889203.
  18. ^ Kristie TM, Sharp PA (Mar 1993). "Herpes simplex virusi alfa-trans-indüksiyon faktori (VP16) tomonidan Oct-1 gomeodomainini barqaror tanib olish uchun zarur bo'lgan hujayra C1 omilini tozalash". Biologik kimyo jurnali. 268 (9): 6525–34. PMID 8454622.
  19. ^ Ajuh PM, Browne GJ, Hawkes NA, Cohen PT, Roberts SG, Lamond AI (Fevral 2000). "Fosfataza 1 oqsilining inson omil C1 (HCF) kompleksi bilan assotsiatsiyasi". Nuklein kislotalarni tadqiq qilish. 28 (3): 678–86. doi:10.1093 / nar / 28.3.678. PMC 102561. PMID 10637318.
  20. ^ Gunther M, Laithier M, Brison O (Iyul 2000). "Ikki gibrid skriningda aniqlangan transkripsiya faktori Sp1 bilan o'zaro ta'sir qiluvchi oqsillar to'plami". Molekulyar va uyali biokimyo. 210 (1–2): 131–42. doi:10.1023 / A: 1007177623283. PMID 10976766.
  21. ^ Piluso D, Bilan P, Capone JP (noyabr 2002). "Xost hujayra omil-1 hujayralar tsikli regulyatori Miz-1 bilan o'zaro ta'sir qiladi va transaktivatsiyani antagonize qiladi". Biologik kimyo jurnali. 277 (48): 46799–808. doi:10.1074 / jbc.M206226200. PMID 12244100.

Qo'shimcha o'qish