WikiDer > Kupe virusi

Kupe virus
Orthonairovirus
Viruslarning tasnifi e
(ochilmagan):Virus
Shohlik:Riboviriya
Qirollik:Orthornavirae
Filum:Negarnavirikota
Sinf:Ellioviritsetalar
Buyurtma:Bunyavirales
Oila:Nairoviridae
Tur:Orthonairovirus
Kuchlanish

Kupe virusi

Kupe virusi jinsdagi virus Orthonairovirus, buyurtma Bunyavirales.

Taksonomiya

Ganjam virusi Nayrobi qo'y kasalligi serogrupida joylashgan.

Tarix

Virus birlashtirilgan holda ajratilgan Shomil (Amblyomma gemma va Rhipicephalus pulchellus) mol terisidan yig'ilgan Nayrobi, Keniya, 1999 yil oktyabrda.[1] "Kupe" so'zi Kisvaxili Shomil uchun.

Genom

Genom salbiy qismli RNKning uchta bo'lagidan iborat - kichik (S), o'rta (M0 va katta (L)).

L segmenti RNK 12,330 ga teng nukleotidlar (nt) uzunlikda va 4050 aminokislotadan iborat bitta ochiq o'qish doirasini (ORF) kodlaydi. Kodlamaydigan mintaqalar mavjud: 5 n mintaqasi 40 nt va 3 ′ viloyati 137 nt. Ushbu ochiq o'qish doirasi bir nechta modullarni kodlaydi, shu jumladan RNKga bog'liq RNK polimeraza. Ehtimol, bu tarjimadan keyin bir nechta oqsillarga bo'linib ketgan, ammo bu hali ko'rsatilmagan.

M segmenti RNKning uzunligi 4818 nukleotid bo'lib, uning tarkibida 47 va 121 nukleotidlardan iborat 5 ′ va 3 c kodlanmagan mintaqalar yonma-yon joylashgan bitta ochiq o'qish doirasi mavjud. ORF 1549 ta aminokislotadan iborat oqsilni 8 ta potentsial joy bilan N ga bog'langan glikosilatsiya uchun kodlaydi. U Gn va Gc glikoprotein mintaqalarida navbati bilan 612 va 1514 aminokislotalarida noyob potentsial N-gly saytini o'z ichiga oladi.

S segmentida 1,694 nt bor va 483 aminokislotadan iborat ORFni kodlaydi. Kodlashsiz 5 ′ va 3 regions mintaqalar navbati bilan 49 nt va 193 nt.

Adabiyotlar

  1. ^ Sang R, Onyango C, Gachoya J, Mabinda E, Konongoi S, Ofula V, Dunster L, Okoth F, Coldren R, Tesh R, da Rossa AT, Finkbeiner S, Wang D, Crabtree M, Miller B (2006) Tickborne arbovirus bozordagi chorvachilikda kuzatuv, Nayrobi, Keniya. Rivojlanayotgan yuqumli kasalliklar. 2006 yil Iyul; 12 (7): 1074-1080