WikiDer > Lumika - Vikipediya

Lumican - Wikipedia
LUM
Identifikatorlar
TaxalluslarLUM, LDC, SLRR2D, lumikan
Tashqi identifikatorlarOMIM: 600616 MGI: 109347 HomoloGene: 37614 Generkartalar: LUM
Gen joylashuvi (odam)
Xromosoma 12 (odam)
Chr.Xromosoma 12 (odam)[1]
Xromosoma 12 (odam)
LUM uchun genomik joylashuv
LUM uchun genomik joylashuv
Band12q21.33Boshlang91,102,629 bp[1]
Oxiri91,111,494 bp[1]
RNK ekspressioni naqsh
PBB GE LUM 201744 s da fs.png
Qo'shimcha ma'lumotni ifodalash ma'lumotlari
Ortologlar
TurlarInsonSichqoncha
Entrez

4060

17022

Ansambl

ENSG00000139329

ENSMUSG00000036446

UniProt

P51884

P51885

RefSeq (mRNA)

NM_002345

NM_008524

RefSeq (oqsil)

NP_002336

NP_032550

Joylashuv (UCSC)Chr 12: 91.1 - 91.11 MbChr 10: 97.57 - 97.57 Mb
PubMed qidirmoq[3][4]
Vikidata
Insonni ko'rish / tahrirlashSichqonchani ko'rish / tahrirlash

Lumika, shuningdek, nomi bilan tanilgan LUM, bu hujayradan tashqari matritsa oqsil odamlarda bu kodlangan LUM gen 12-xromosomada.[5][6]

Tuzilishi

Lumikan - bu proteoglikan Leysinga boy bo'lgan kichik proteoglikan (SLRP) oilasining II sinf a'zosi dekor, katta, fibromodulin, keratokan, epifikanva osteoglisin.[7]

Boshqa SLRP-lar singari lumikanning molekulyar og'irligi taxminan 40 kiloDaltonga teng va to'rtta asosiy molekula ichidagi domenlarga ega:[8]

  1. 16 signal peptidi aminokislota qoldiqlar;
  2. sulfat tirozin va disulfid bog'lanish (lar) ni o'z ichiga olgan salbiy zaryadlangan N-terminal domeni;
  3. lumikanni kollagen kabi boshqa hujayradan tashqari tarkibiy qismlar bilan bog'lashga imkon beradigan o'n tandem lösinga boy takrorlash;
  4. 50 ta aminokislota qoldig'idan iborat 32 ta qoldiq sisteinni o'z ichiga olgan karboksil terminal terminali.

Leytsinga boy takroriy domen ichida to'rtta N-bog'langan sayt mavjud oqsil bilan almashtirilishi mumkin bo'lgan yadro keratan sulfat. Lumikanning asosiy oqsili (shunga o'xshash) dekor va fibromodulin) taqa shaklida. Bu uni bog'lashga imkon beradi kollagen kollagen fibrilidagi molekulalar, shu bilan qo'shni fibrillalarni bir-biridan uzoqlashtirishga yordam beradi.[9]

Funktsiya

Lumikan - bu mayor keratan sulfat proteoglikan shox parda, ammo hamma joyda mezenximal to'qimalarda tanada tarqaladi.[10] Lumikan kollagen fibrilining tashkil etilishida va atrof-muhit o'sishida ishtirok etadi, kornea shaffoflik va epiteliya hujayralarining migratsiyasi va to'qimalarni tiklash.[5] Kornea shaffofligi aniq hizalanishi tufayli mumkin kollagen lumikan tomonidan tolalar (va keratokan) intrafibrillyar bo'shliqda.

Klinik ahamiyati

Lumikan geni nokaut qilingan (Lum - / -) sichqonlar shox parda ikkala ko'zda va mo'rt teri.[11] Lumikan (LUM) geni yuqori darajadagi nomzodlarning sezgirligi geni deb hisoblangan miyopi; ammo, meta-tahlil LUM polimorfizmi va o'rganilgan barcha genetik modellarda yuqori miyopi sezuvchanligi o'rtasida bog'liqlikni ko'rsatmadi.[12]

Lom nokautli sichqonlarda ham anormallik mavjud kollagen ularning ichida yurak kamroq va qalinroq fibrillalar bilan to'qima.[13] Ikkala lumikan va fibromodulin og'ir rivojlanmoq tendinopatiya (tendon patologiya), ushbu SLRP-larni to'g'ri o'lchamdagi va tekislangan holda ishlab chiqilishidagi ahamiyatini ochib beradi kollagen tolalar tendon.[14] Boshqalar bilan bir qatorda hujayradan tashqari matritsa komponentlar, lumikan ekspressioni otda ko'paytirildi fleksor tendonlar jarohatdan olti hafta o'tgach.[15]

Lumikan mavjud hujayradan tashqari matritsa serhosil ayollarda uteral to'qimalarning.[16] Ko'payishning sekretor fazasiga qadar lumikan ko'payishi kuzatiladi endometrium. Menopozal endometriyal to'qimalarda lumikan ekspression darajasi pasayadi va normal holatga nisbatan patologik jihatdan past bo'ladi. endometrium.

Lumikan plevral effuziyalarda yuqori darajada namoyon bo'ladi (o'pka suyuqligi) bo'lgan bemorlar adenokarsinoma.[17] Uning ifodasi past edi saraton hujayralar, lekin tarkibida yuqori hujayradan tashqari matritsa atrofida o'sma. Lumikan ekspressioni o'smaning darajasi yoki bosqichi bilan bog'liq emas edi. Pankreatik kanalli bemorlarning taxminan yarmida adenokarsinoma sinovdan o'tgan,[18] lumikan hujayradan tashqari matritsa atrofida o'sma operatsiyadan keyin metastatik takrorlanishning pasayishi va stromal lumikan bo'lmagan bemorlarga qaraganda uch baravar uzoqroq yashash bilan bog'liq edi. Lumikan to'g'ridan-to'g'ri bog'lanib, inhibe qilishi mumkin matritsali metalloproteinaza-14 (MMP14), lumikan o'smaning rivojlanishini oldini olish orqali cheklashi mumkin hujayradan tashqari matritsa kollagen proteoliz shu bilan ferment.[19]

Adabiyotlar

  1. ^ a b v GRCh38: Ensembl relizi 89: ENSG00000139329 - Ansambl, 2017 yil may
  2. ^ a b v GRCm38: Ensembl relizi 89: ENSMUSG00000036446 - Ansambl, 2017 yil may
  3. ^ "Human PubMed ma'lumotnomasi:". Milliy Biotexnologiya Axborot Markazi, AQSh Milliy Tibbiyot Kutubxonasi.
  4. ^ "Sichqoncha PubMed ma'lumotnomasi:". Milliy Biotexnologiya Axborot Markazi, AQSh Milliy Tibbiyot Kutubxonasi.
  5. ^ a b "Entrez Gene: LUM lumican".
  6. ^ Chakravarti S, Stallings RL, SundarRaj N, Cornuet PK, Hassell JR (iyun 1995). "Odam lumikanining birlamchi tuzilishi (keratan sulfat proteoglikan) va genni (LUM) 12q21.3-q22 xromosomalariga lokalizatsiyasi". Genomika. 27 (3): 481–8. doi:10.1006 / geno.1995.1080. PMID 7558030.
  7. ^ Iozzo RV, Schaefer L (2015 yil mart). "Proteoglikan shakli va funktsiyasi: proteoglikanlarning keng nomenklaturasi". Matritsa biologiyasi. 42: 11–55. doi:10.1016 / j.matbio.2015.02.003. PMC 4859157. PMID 25701227.
  8. ^ Kao WW, Funderburgh JL, Xia Y, Liu CY, Conrad GW (yanvar 2006). "Molekulalarga e'tibor: lumikan". Ko'zlarni eksperimental tadqiq qilish. 82 (1): 3–4. doi:10.1016 / j.exer.2005.08.012. PMC 2876311. PMID 16213485.
  9. ^ Scott JE (1996). "Proteodermatan va proteokeratan sulfat (decorin, lumican / fibromodulin) oqsillari taqa shaklida. Ularning kollagen bilan o'zaro ta'siri". Biokimyo. 35 (27): 8795–9. doi:10.1021 / bi960773t. PMID 8688414.
  10. ^ Chakravarti S (2002). "Lumikan va fibromodulinning funktsiyalari: nokaut sichqonlaridan darslar". Glycoconjugate jurnali. 19 (4–5): 287–93. doi:10.1023 / A: 1025348417078. PMID 12975607. S2CID 3636866.
  11. ^ Chakravarti S, Magnuson T, Lass JH, Jepsen KJ, LaMantia C, Kerrol H (iyun 1998). "Lumikan kollagen fibril birikmasini tartibga soladi: terining mo'rtligi va lumikan bo'lmaganida shox pardaning xiralashishi". Hujayra biologiyasi jurnali. 141 (5): 1277–86. doi:10.1083 / jcb.141.5.1277. PMC 2137175. PMID 9606218.
  12. ^ Li M, Zhai L, Zeng S, Peng Q, Vang J, Deng Y, Xie L, Xe Y, Li T (Iyul 2014). "LUM rs3759223 polimorfizmi va yuqori miyopiya o'rtasidagi bog'liqlikning etishmasligi". Optometriya va ko'rish ilmi. 91 (7): 707–12. doi:10.1097 / OPX.0000000000000302. PMID 24927138. S2CID 27647081.
  13. ^ Mienaltovski MJ, Birk DE (2014). "Tendon va ligament tadqiqotida sichqoncha modellari". Irsiy yumshoq biriktiruvchi to'qima kasalliklarida rivojlanish. Eksperimental tibbiyot va biologiyaning yutuqlari. 802. 201-30 betlar. doi:10.1007/978-94-007-7893-1_13. ISBN 978-94-007-7892-4. PMID 24443029.
  14. ^ Dupuis LE, Berger MG, Feldman S, Ducette L, Fowlkes V, Chakravarti S, Thibaudeau S, Alcala NE, Bradshaw AD, Kern CB (2015 yil aprel). "Lumikan etishmovchiligi kollagen birikmasi o'zgargan holda kardiyomiyotsitlar gipertrofiyasiga olib keladi". Molekulyar va uyali kardiologiya jurnali. 84: 70–80. doi:10.1016 / j.yjmcc.2015.04.007. PMC 4468017. PMID 25886697.
  15. ^ Jacobson E, Dart AJ, Mondori T, Horadogoda N, Jeffcott LB, Little CB, Smith Smith (2015). "Fokal eksperimental shikastlanish genlarning ekspressioni va ot fleksor tendonlarining gistologik o'zgarishiga olib keladi". PLOS ONE. 10 (4): e0122220. Bibcode:2015PLoSO..1022220J. doi:10.1371 / journal.pone.0122220. PMC 4383631. PMID 25837713.
  16. ^ Lucariello A, Trabucco E, Boccia O, Perna A, Sellitto C, Castaldi MA, De Falco M, De Luca A, Cobellis L (2015). "Kichik lösinga boy proteoglikanlar normal va patologik endometriumda turlicha tarqaladi". Vivo shahrida. 29 (2): 217–22. PMID 25792648.
  17. ^ Cappellesso R, Millioni R, Arrigoni G, Simonato F, Caroccia B, Iori E, Guzzardo V, Ventura L, Tessari P, Fassina A (2015). "Lumikan o'pka adenokarsinomasi plevra effuziyalarida ortiqcha ta'sir qiladi". PLOS ONE. 10 (5): e0126458. Bibcode:2015PLoSO..1026458C. doi:10.1371 / journal.pone.0126458. PMC 4427354. PMID 25961303.
  18. ^ Li X, Truty MA, Kang Y, Shopin-Lali X, Chjan R, Roife D, Chatterji D, Lin E, Tomas RM, Vang X, Katz MH, Fleming JB (Dekabr 2014). "Hujayradan tashqari lumikan oshqozon osti bezi saratoni hujayralarining o'sishini inhibe qiladi va operatsiyadan keyin uzoq muddat omon qolish bilan bog'liq". Klinik saraton tadqiqotlari. 20 (24): 6529–40. doi:10.1158 / 1078-0432.CCR-14-0970. PMC 4268437. PMID 25336691.
  19. ^ Pietraszek K, Chatron-Colliet A, Brézillon S, Perreau C, Jakubiak-Augustyn A, Krotkiewski H, Maquart FX, Wegrowski Y (Nov 2014). "Lumikan: matritsali metalloproteinaza-14 faolligining yangi inhibitori". FEBS xatlari. 588 (23): 4319–24. doi:10.1016 / j.febslet.2014.09.040. PMID 25304424. S2CID 36035579.

Qo'shimcha o'qish