WikiDer > Lizin riboswitch

Lysine riboswitch
Lizin riboswitch
RF00168.jpg
Bashorat qilingan ikkilamchi tuzilish va ketma-ketlikni saqlash Lizin riboswitch
Identifikatorlar
BelgilarLizin
RfamRF00168
Boshqa ma'lumotlar
RNK turiCis-reg; riboswitch
Domen (lar)Bakteriyalar
SOSO: 0000035
PDB tuzilmalarPDBe

The Lizin riboswitch metabolit bilan bog'lanishdir RNK elementi aniq ichida topilgan xabarchi RNKlari aminokislota uchun aniqlik sensori bo'lib xizmat qiladi lizin. MRNK strukturasining allosterik qayta tuzilishi ligand bog'lash orqali amalga oshiriladi va bu modulyatsiyaga olib keladi gen ekspressioni.[1] Lizin riboswitch eng ko'p Firmicutes va Gammaproteobakteriyalar bu erda ular lizin biosintezi, tashish va katabolizmda ishtirok etadigan bir qator genlarning yuqori qismida joylashgan.[2][3][4] Lizin riboswitch ham mustaqil ravishda aniqlandi va L qutisi deb nomlandi.[5]

Tuzilishi

Yaqinda lizin riboswitchining tuzilishi aniqlandi.[6][7] Lizin aminokislota 5 tomonlama birikma hosil qilgan cho'ntagida bog'langan. Tuzilishi uchta spiral to'plamdan va 5 tomonli birikma bilan birlashtirilgan ikkita spiral to'plamdan iborat. 1 va 2-vertolyotlar 4 va 5-spirallar singari kolinear tarzda to'plangan.

  • Lizin riboswitchining fazoviy to'lg'azish sohalarida ko'rsatilgan bog'langan lizin molekulasi bilan 3D tasviri.[6]

Adabiyotlar

  1. ^ Mandal, M; Bese B; Barrick JE; Winkler WC; Breaker RR (2003). "Riboswitches Bacillus subtilis va boshqa bakteriyalardagi asosiy biokimyoviy yo'llarni nazorat qiladi". Hujayra. 113 (5): 577–586. doi:10.1016 / S0092-8674 (03) 00391-X. PMID 12787499.
  2. ^ Sudarsan, N; Vikiser JK; Nakamura S; Ebert MS; Breaker RR (2003). "Lizinni bog'lash orqali gen ekspressionini boshqaruvchi bakteriyalardagi mRNK tuzilishi". Genlar Dev. 17 (21): 2688–2697. doi:10.1101 / gad.1140003. PMC 280618. PMID 14597663.
  3. ^ Rodionov, DA; Vitreschak AG; Mironov AA; Gelfand MS (2003). "Bakteriyalarda lizin biosintezi va transport genlarini tartibga solish: yana bir RNK riboswitch?". Nuklein kislotalari rez. 31 (23): 6748–6757. doi:10.1093 / nar / gkg900. PMC 290268. PMID 14627808.
  4. ^ Mukherji, S; Barash D; Sengupta S (2017). "Bakteriyalarda lizin riboswitch taqsimotining qiyosiy genomikasi va filogenomik tahlillari". PLOS ONE. 12 (9): e0184314. doi:10.1371 / journal.pone.0184314. PMC 5584792. PMID 28873470.
  5. ^ Grundy, FJ; Lehman SC; Henkin TM (2003). "L qutisi regulyatori: bakteriyalar lizini biosintezi genlarining etakchi RNKlari tomonidan lizinni sezish". Proc Natl Acad Sci AQSh. 100 (21): 12057–12062. doi:10.1073 / pnas.2133705100. PMC 218712. PMID 14523230.
  6. ^ a b Serganov A, Xuang L, Patel DJ (2008). "Lizin riboswitch tomonidan aminokislotalarni bog'lash va genlarni nazorat qilish bo'yicha tarkibiy tushunchalar". Tabiat. 455 (7217): 1263–1267. doi:10.1038 / nature07326. PMC 3726722. PMID 18784651.
  7. ^ Garst AD, Héroux A, Rambo RP, Batey RT (avgust 2008). "Lizin riboswitch regulyatori mRNA elementining kristalli tuzilishi". Biologik kimyo jurnali. 283 (33): 22347–22351. doi:10.1074 / jbc.C800120200. PMC 2504901. PMID 18593706.

Tashqi havolalar