WikiDer > Marinobakteri gidrokarbonoklastikus - Vikipediya

Marinobacter hydrocarbonoclasticus - Wikipedia

Marinobakter gidrokarbonoklastikus
Ilmiy tasnif
Qirollik:
Bakteriyalar
Filum:
Proteobakteriyalar
Sinf:
Gammaproteobakteriyalar
Buyurtma:
Alteromonadales
Oila:
Alteromonadaceae
Tur:
Marinobakter
Binomial ism
Marinobakter gidrokarbonoklastikus
Gautier va boshq. 1992
Sinonimlar

Pseudomonas nautica Bauman va boshq. 1972
Marinobakteriya akvaeoli Nguyen va boshq. 1999

Marinobakter gidrokarbonoklastikus ning bir turidir Proteobakteriyalar uglevodorodlarni yemirishga qodir dengiz suvida uchraydi. Hujayralar bitta qutb yordamida tayoqchasimon va harakatchan flagellum.[1]

Etimologiya

"Gidrokarbonoklastik" "uglevodorodlarni demontaj qilish" degan ma'noni anglatadi. Ushbu bakteriyalar shunday nomlangan, chunki ular yog'ning asosiy tarkibiy qismlarini buzishi mumkin.[2]

Tarix

Ikkala jins Marinobakter va turlari Marinobakter gidrokarbonoklastikus birinchi bo'lib 1992 yilda Gautier va boshqalar tomonidan aniqlangan va tavsiflangan. 16sRNA DNKsi bo'yicha tahlil qilish uchun polimeraza zanjiri reaktsiyasidan foydalangan holda Gautier yangi proteobakteriyalar bilan boshqa naslni yaratish uchun etarli masofaga ega bo'lgan Proteobakteriyalarning gamma guruhining a'zosi ekanligini ko'rsatdi.[2]

2005 yilda Ispaniyadagi Sevilya universiteti Mikrobiologiya va parazitologiya bo'limidan Markes va Ventosa "taksonomik pozitsiyalarni tushunish uchun" G + C tarkibi, yog 'kislotalari tarkibi va DNK-DNKni duragaylash ... "dan foydalanganlar. Marinobakter gidrokarbonoklastikus va Marinobakteriya akvaeoli.[3] "Markes, ikkita turni bir xil nom bilan birlashtirishni taklif qiladi, chunki ular fenotipik va filogenetik xususiyatlar tufayli heterotipik sinonimlardir".[3]

2011 yilda Hamdan va Fuller buni aniqladilar Marinobakter gidrokarbonoklastus, davolash uchun ishlatiladigan COREXIT EC9500A kimyoviy dispersantiga ta'sirlanganda o'ling Deepwater Horizon neft to'kilishi.[4]

Genom tuzilishi

Ning genomi Marinobakter gidrokarbonoklastikus tarkibida 52,7% guanin + sitozin bor.[2]

Evolyutsiya va filogeniya

Marinobakter gidrokarbonoklastikus eubakteriyalarning bir turi.[2] 16sRNK DNK tahlili shuni ko'rsatadiki, bu organizmlar Proteobakteriyalarning gamma guruhiga aloqador.[2] Dastlabki 16sRNA filogenetik tahlilida yaqin qarindoshlari aniqlanmadi Marinobakter gidrokarbonoklastikus. Shu sababli, organizm o'z turiga joylashtirilgan bo'lib, olimlar bunga ishonishgan Pseudomonas aeruginosa uning eng yaqin zamonaviy qarindoshi edi.[2]

1999 yilda 16S rDNA ketma-ketligi tahlili aniqlandi Marinobakter gidrokarbonoklastikus ichida juda yaqin qarindoshi bo'lish Marinobakteriya akvaeoli.[5] Ikkala organizm tarkibida 99,4% o'xshashlik bilan 16S rDNK sekanslari mavjud.[5]

Turga kiruvchi organizmlar Marinobakter ular yashaydigan muhit jihatidan juda xilma-xilligi aniqlandi. Marinobakter turlari "gipersalinli bakterial paspaslar, Yaponiyada dengizdagi issiq suv manbalari va [Arktika va Antarktika mintaqalaridagi kabi sovuq dengiz suvlarida" topilgan.[6]

Morfologiya va tavsif

Marinobakter gidrokarbonoklastikus gramm manfiy va novda shaklida.[2] Ularning hujayralari o'rtacha 0,3-0,6 µm va uzunligi 2-3 2-3m.[2] Ularning flagella ishlab chiqarish qobiliyati ko'p jihatdan ularning atrof muhitining NaCl kontsentratsiyasiga bog'liq.[2] 0,6-1,5 M bo'lgan NaCl konsentratsiyali eritmalarda, Marinobakter gidrokarbonoklastikus ishlab chiqarish va "bitta qoplanmagan qutbli flagellum" harakati bilan harakat qilish.[2] NaCl konsentratsiyasi <0,2 yoki> 1,5 bo'lgan eritmalarda, M. gidrokarbonoklastikus flagella ishlab chiqarishga qodir emaslar va shu bilan ularning harakatlanishiga ta'sir qila olmaydilar.[2]

Metabolizm

Marinobakter gidrokarbonoklastikus hujayralar tarkibida neft uglevodorodlarining asosiy tarkibiy qismi bo'lgan aromatik halqalarni parchalash uchun asosiy ferment bo'lgan sitokrom P450 mavjud emas.[2] Ushbu organizmlar neft uglevodorodlarida keng tarqalgan tsiklsiz uzoq alkanlar bo'yicha o'sishga moslashgan.[2] Hujayralar aromatik uglevodorodlarda o'sishi mumkin, masalan, aromatik halqalarni o'z ichiga olgan uglevodorodlar.[2] Marinobakter gidrokarbonoklastikus majburiy uglevodorodoklastik organizmlar emas; ular uglevodorodlarsiz ham standart muhitda o'sishi mumkin.[2]Bundan tashqari, Marinobakter hujayralar denitrifikatsiya qilishi, azotli gaz hosil qilishi mumkin.[2] Ular nitratdan ham foydalanishlari mumkin (YO'Q3−) yoki nitrit (YO'Q2−) ularning terminallari sifatida.[2]Marinobakter gidrokarbonoklastikus hujayralar aerobik suyuq muhitda o'sishi va agarda majburiy anaeroblar emasligini ko'rsatib, agarda koloniyalar hosil qilishi mumkin.[2]

O'sish, ko'payish va o'zini tutish

Marinobakter plitalarda alohida-alohida yaxlitlangan koloniyalar hosil qiladi, bu ularning ikkilik bo'linish orqali ko'payishini bildiradi.Marinobakter gidrokarbonoklastikus kislorod ishtirokida yoki bo'lmasdan o'sishi mumkin.[2] Ularning hujayralari yuqori sho'rlanishlarga chidamli.[2] Ular 3,5 Molar NaCl gacha o'sishga qodir, ammo 0,6 Molar atrofida eng yaxshi o'sadi, bu ular izolyatsiya qilingan O'rta dengiz dengizining molaridir.[2]Ular erkin plankton yoki a ning sobit elementlari sifatida o'sishi mumkin biofilm.[6]Marinobakter gidrokarbonoklastikus hujayralar uglevodorodlarni emiradi va osmoprotektorni chiqaradi ektoin (Genoscope sayti). Ular ham ajralib chiqadilar Petrobaktin, "Fe (III) bilan bog'langanda, yorug'lik vositachiligida dekarboksilatsiya reaktsiyasini osonlikcha bajaradigan bis-katekol a-gidroksi kislotasi sideroforasi."[7]

Texnologiya va sanoatdagi ahamiyati

Marinobakter gidrokarbonoklastus neft uglevodorodlarini, shu jumladan, okean neftining to'kilmasida topilgan moddalarni buzish.[4] 2011 yilda bu aniqlandi Marinobakter gidrokarbonoklastus kimyoviy COREXIT EC9500A ta'sirida inhibe qilinadi. Ushbu kimyoviy moddalar okean moylari to'kilgandan keyin tozalashda yordam berish uchun keng ishlatiladigan dispersant hisoblanadi.[4] Hamdan va Fuller (2011) o'zlarining sinovlarida "vodorodni parchalaydigan bakteriyalar kimyoviy dispersanlar tomonidan inhibe qilinganligi va dispersanlardan foydalanish atrof muhitning to'kilmasin bioremediat qobiliyatini pasaytirishi mumkin" degan ma'lumotni olishdi.

Marinobakter gidrokarbonoklastikus suyuq kulturada va agar plitalari ustida o'sishi mumkin bo'lsa, u erda ular bej rang koloniyalarini ishlab chiqaradilar.[2] Ular yuqori sho'rlanishga chidamli bo'lib, aerob va anaerob o'sishi mumkin. Heterojen bo'lmagan muhitda o'sish qobiliyati yangi, bakteriyalarga asoslangan va okean neftining to'kilishini tozalash usullarini izlayotgan olimlar uchun foydali bo'lishi mumkin.

Adabiyotlar

  1. ^ Garrity, Jorj M. (2005). Bergining sistematik bakteriologiya qo'llanmasi, Ikkinchi jild: Proteobakteriyalar, B qism: Gammaproteobakteriyalar Nyu-York: Springer ISBN 0-387-24144-2
  2. ^ a b v d e f g h men j k l m n o p q r s t siz v Gautier; Lafay; Kristen; Fernandes; Acquaviva (1992 yil oktyabr). "Marinobacter hydrocarbonoclasticus gen. Nov., Sp. Nov., Yangi, nihoyatda halotolerant, uglevodorodni parchalaydigan dengiz bakteriyasi". Xalqaro sistematik bakteriologiya jurnali. 42 (4): 568–576. doi:10.1099/00207713-42-4-568. Olingan 5 oktyabr, 2020.
  3. ^ a b "Marinobacter aquaeolei". Mikrob Wiki. Kenyon kolleji. 2011 yil 7-iyul. Olingan 5 oktyabr, 2020.
  4. ^ a b v Xamdan, Leyla; Fulmer, Preston (2011 yil mart). "COREXIT® EC9500A ning Deepwater Horizon to'kilishi bilan yog'langan plyajdagi bakteriyalarga ta'siri" (PDF). Suv mikroblari ekologiyasi. 63 (2): 101–109. doi:10.3354 / ame01482. Olingan 5 oktyabr, 2020.
  5. ^ a b Xyu, Nguyen; Denner, Evald; Ha, Dang; Vanner, Gerxard; Stan-Lotter, Helga (1999 yil aprel). "Marinobacter aquaeolei sp. Nov., Vetnamning neft qazib oladigan qudug'idan ajratilgan halofil bakteriyasi". Xalqaro sistematik bakteriologiya jurnali. 49 (2): 367–375. doi:10.1099/00207713-49-2-367. Olingan 5 oktyabr, 2020.
  6. ^ a b Fransua Jakob biologiya instituti. "Marinobacter Hydrocarbonoclasticus ATCC49840". Genoskop - Milliy De Séquenchage markazi. Komissariyat à l´énergie atomique et aux energetika alternativalari. Olingan 5 oktyabr, 2020.
  7. ^ Barbeu, Ketrin; Chjan, Guangping; Jonli, Devid; Butler, Alison (2001 yil 27 dekabr). "Petrobaktin, yog'ni parchalovchi dengiz bakteriyasi Marinobacter hydrocarbonoclasticus tomonidan ishlab chiqarilgan fotoreaktiv siderofor". Amerika Kimyo Jamiyati jurnali. 124 (3): 378–379. doi:10.1021 / ja0119088. Olingan 5 oktyabr, 2020.

Tashqi havolalar