WikiDer > Xantal ma'lumotlar bazasi

Mustard Database
Xantal
Tarkib
TavsifMetagenomikadan aniqlangan AR determinantlari va kuratilgan AR genlarini o'z ichiga oladi
Ma'lumot turlari
qo'lga olindi		Antimikrobiyal qarshilik genlari va ARni aniqlovchi moddalar
OrganizmlarBakteriyalar
Aloqa
Birlamchi iqtibosPMID 30478291
Kirish
Veb-saytmgps.EI/ Xantal/
URLni yuklab olishYuklash
Turli xil
Xatcho'plar
sub'ektlar		ha

Xantal kuzatib boradigan ma'lumotlar bazasi Antimikrobiyal qarshilikni aniqlash (ARDS). ARD-larni kuzatib borish usuli oqsil homologiyasini modellashtirishga moslangan o'zaro usulidan foydalangan holda, Pairwise Comparative Modeling (PCM) deb nomlangan bo'lib, ular oqsilni bashorat qilishni kuchaytiradi, ayniqsa uzoqdan bog'liq bo'lgan protein homologlari uchun.[1] PCM yordamida inson ichagi mikrobiotasidagi 20 ta oiladan 6095 ARD. Antibiotiklarga qarshilik ko'rsatadigan ma'lumotlar bazalari ishlatilgan ResFinder,[2] ARG-ANNOT,[3] hozirda ishlamay qolgan Lahey klinikasi,[4] Tetratsiklin va makrolidga chidamli genlar uchun Merilin Roberts veb-sayti[5] va metagenomika.[6][7][8]

Shuningdek qarang

Adabiyotlar

  1. ^ Erlich, S. Dusko; Kennedi, Shon P.; Dore, Joel; Xaymet, Florensiya; Vaytser, Kevin; Levenes, Florensiya; Letur, Aline; Lejard, Veronik; Leonard, Per (2019 yil yanvar). "Ichak rezistomini uch o'lchovli tuzilishga asoslangan usul bilan bashorat qilish" (PDF). Tabiat mikrobiologiyasi. 4 (1): 112–123. doi:10.1038 / s41564-018-0292-6. ISSN 2058-5276. PMID 30478291. S2CID 53757858.
  2. ^ Zankari, E .; Xasman, H .; Cosentino, S .; Vestergaard, M .; Rasmussen, S .; Lund, O .; Aarestrup, F. M .; Larsen, M. V. (2012-07-10). "Olingan antimikrobiyal qarshilik genlarini aniqlash". Antimikrobiyal kimyoterapiya jurnali. 67 (11): 2640–2644. doi:10.1093 / jac / dks261. ISSN 0305-7453. PMC 3468078. PMID 22782487.
  3. ^ Gupta, Sushim Kumar; Padmanabhan, Babu Roshan; Diene, Seydina M.; Lopez-Rojas, Rafael; Kempf, Mari; Landraud, Lyus; Rolain, Jan-Mark (2013-10-21). "ARG-ANNOT, bakteriyalar genomlarida antibiotiklarga chidamlilik genlarini kashf etishning yangi bioinformatik vositasi". Mikroblarga qarshi vositalar va kimyoviy terapiya. 58 (1): 212–220. doi:10.1128 / aac.01310-13. ISSN 0066-4804. PMC 3910750. PMID 24145532.
  4. ^ "RED-DB". Olingan 27 iyul, 2019.
  5. ^ "Merilin Robertsning veb-sayti".
  6. ^ Allen, Xezer K; Moe, Lyuk A; Rodbumrer, Jitsupang; Gaarder, Andra; Handelsman, Jo (2008-10-09). "Funktsional metagenomika uzoq Alaskan tuprog'ida turli xil b-laktamazalarni aniqlaydi". ISME jurnali. 3 (2): 243–251. doi:10.1038 / ismej.2008.86. ISSN 1751-7362. PMID 18843302. S2CID 16496336.
  7. ^ Mur, Aimée M.; Patel, Sanket; Forsberg, Kevin J.; Vang, Bin; Bentli, Geyl; Raziya, Yasmin; Tsin, Xuan; Tarr, Fillip I.; Dantas, Gautam (2013-11-13). "Bolalardagi najasli mikrobiota porti turli xil va yangi antibiotiklarga chidamlilik genlari". PLOS ONE. 8 (11): e78822. doi:10.1371 / journal.pone.0078822. ISSN 1932-6203. PMID 24236055.
  8. ^ Sommer, M. O. A .; Dantas, G.; Cherkov, G. M. (2009-08-27). "Odam mikroflorasidagi antibiotiklarga chidamli suv omborining funktsional tavsifi". Ilm-fan. 325 (5944): 1128–1131. doi:10.1126 / science.1176950. ISSN 0036-8075. PMC 4720503. PMID 19713526.