WikiDer > Ortologik MAtrix

Orthologous MAtrix
OMA
Database.png
Tarkib
Tavsiforhologiya 1000 to'liq genom orasida xulosa chiqarish.
Aloqa
LaboratoriyaETH Tsyurix
MualliflarKristof Dessimoz
Adrian Shnayder
Adrian Altenxof
Gaston H. Gonnet
Birlamchi iqtibosAltenhoff va boshq.[1]
Ishlab chiqarilish sanasi2004
Kirish
Veb-saytomabrowser.org
URLni yuklab olishhttp://omabrowser.org/All/download.html
Veb-xizmat URL manziliwsdl
Turli xil
Ma'lumotlarni chiqarish
chastota		Yiliga 2 ta nashr

OMA (Ortologik MAtrix) ning ma'lumotlar bazasi ortologlar mavjud bo'lgan to'liqdan olingan genomlar.[1][2] OMA ning ortologik bashoratlari bir necha shaklda mavjud:

  • OMA juftliklari: berilgan uchun gen, bashorat qilingan ro'yxat ortologlar boshqasida turlari taqdim etiladi.
  • OMA guruhlari: turli xil genlar to'plami turlari barchasi ortologik.
  • OMA iyerarxik guruhlari: ma'lum bir ajdod genidan kelib chiqqan barcha genlarning to'plami taksonomik oralig'i.
  • OMA Genome Pair ko'rinishi: bashorat qilinganlarning barchasi ortologlar ikkitasi o'rtasida turlari.

Shuningdek qarang

Adabiyotlar

  1. ^ a b Altenhoff, Adrian M; Shnayder Adrian; Gonnet Gaston H; Dessimoz Kristof (2011 yil yanvar). "OMA 2011: 1000 to'liq genom orasida orologiya xulosasi". Nuklein kislotalari rez. Angliya. 39 (Ma'lumotlar bazasi muammosi): D289-94. doi:10.1093 / nar / gkq1238. PMC 3013747. PMID 21113020.
  2. ^ Altenhoff, Adrian M; Glover, Natasha M; Poezd, Klement-Mari; Kaleb, Klara; Warwick Vestrocy, Alex; Dilus, Dovud; de Farias, Tarcisio M; Zile, Karina; Stivenson, Charlz; Uzoq, Jiao; Redestig, Xenning; Gonnet, Gaston H; Dessimoz, Kristof (2018). "OMA orhologiya ma'lumotlar bazasi 2018 yilda: boy veb va dasturiy interfeyslar orqali hayotning barcha sohalari o'rtasidagi evolyutsion munosabatlarni tiklash". Nuklein kislotalarni tadqiq qilish. 46 (D1): D477-D485. doi:10.1093 / nar / gkx1019. ISSN 0305-1048. PMC 5753216. PMID 29106550.