WikiDer > Fenilalanin - tRNK ligaza

Phenylalanine—tRNA ligase
fenilalanin-tRNK ligaz
Identifikatorlar
EC raqami6.1.1.20
CAS raqami9055-66-7
Ma'lumotlar bazalari
IntEnzIntEnz ko'rinishi
BRENDABRENDA kirish
ExPASyNiceZyme ko'rinishi
KEGGKEGG-ga kirish
MetaCycmetabolik yo'l
PRIAMprofil
PDB tuzilmalarRCSB PDB PDBe PDBsum
Gen ontologiyasiAmiGO / QuickGO
Ferredoksin bilan katlanadigan antikodon bog'lash sohasi
PDB 1eiy EBI.jpg
dan fenilalanil-tRNA sintetazning kristalli tuzilishi Thermus thermophilus tirik tRNK bilan komplekslanganPhe
Identifikatorlar
BelgilarFDX-ACB
PfamPF03147
InterProIPR005121
SCOP21pys / QOIDA / SUPFAM

Yilda enzimologiya, a fenilalanin-tRNK ligaz (EC 6.1.1.20) an ferment bu kataliz qiladi The kimyoviy reaktsiya

ATP + L-fenilalanin + tRNKPhe AMP + difosfat + L-fenilalanil-tRNKPhe

3 substratlar bu fermentlar ATP, L-fenilalaninva tRNKPhe, uning 3 qismi mahsulotlar bor AMP, difosfat, va L-fenilalanil-tRNKPhe.

Ushbu ferment. Oilasiga tegishli ligazlar, aminoatsil-tRNK va unga aloqador birikmalarda uglerod-kislorod bog'lanishini hosil qiluvchi xususiyatlarga ega bo'lish. The sistematik ism bu fermentlar sinfiga kiradi L-fenilalanin: tRNAhegaza (AMP hosil qiluvchi). Umumiy foydalanishdagi boshqa nomlarga quyidagilar kiradi fenilalanil-tRNK sintetaza, fenilalanil-o'tkazuvchi ribonukleat sintetaza, fenilalanin-tRNK sintetaza, fenilalanil-uzatuvchi RNK sintetaza, fenilalanil-tRNK ligaza, fenilalanil-uzatuvchi RNK ligaza, L-fenilalanil-tRNK sintetazava fenilalanin translazasi. Ushbu ferment fenilalanin, tirozin va triptofan biosintezi va aminoatsil-tRNK biosintezida ishtirok etadi.

Fenilalanin-tRNA sintetaza (PheRS) eng murakkablardan biri ekanligi ma'lum fermentlar aaRS (Aminoatsil-tRNK sintetaza) oila. Bakterial va mitoxondrial PheRS-lar bilan bo'lishish a ferredoksin- katlama antikodon majburiy (FDX-ACB) domen, bu alfa + beta-ning kanonik ikkiga bo'linganligini anglatadi motif hech qanday qo'shimchalarsiz. FDX-ACB domeni odatiy ko'rinishni namoyish etadi RNKni tanib olish burmasi (RRM) to'rt qatorli tomonidan hosil qilingan antiparallel beta-varaq, ikkitadan spirallar unga qarshi qadoqlangan.[1][2][3][4][5]

Strukturaviy tadqiqotlar

2007 yil oxiriga kelib, 10 tuzilmalar bilan, bu fermentlar sinfi uchun hal qilingan PDB qo'shilish kodlari 1B70, 1B7Y, 1EIY, 1JJC, 1PYS, 2AKW, 2ALAL, 2AMC, 2CXIva 2IY5.

Adabiyotlar

  1. ^ Mosyak L, Reshetnikova L, Goldgur Y, Delarue M, Safro MG (1995 yil iyul). "Thermus thermophilus dan fenilalanil-tRNA sintetazning tuzilishi". Nat. Tuzilishi. Biol. 2 (7): 537–47. doi:10.1038 / nsb0795-537. PMID 7664121. S2CID 13042127.
  2. ^ Goldgur Y, Mosyak L, Reshetnikova L, Ankilova V, Lavrik O, Xodireva S, Safro M (yanvar 1997). "Fenilalanil-tRNK sintetazning kristalli tuzilishi tRNAPhe bilan biriktirilgan termus termofildan". Tuzilishi. 5 (1): 59–68. doi:10.1016 / s0969-2126 (97) 00166-4. PMID 9016717.
  3. ^ Rodova M, Ankilova V, Safro MG (1999 yil fevral). "Inson fenilalanil-tRNK sintetazasi: klonlash, aminokislota ketma-ketliklarining strukturaviy sohalari va alfa va beta subbirliklarining surunkali miyeloid leykemiya hujayralarida koordinatali tartibga solinadigan ifodasi bo'yicha tavsifi". Biokimyo. Biofiz. Res. Kommunal. 255 (3): 765–73. doi:10.1006 / bbrc.1999.0141. PMID 10049785.
  4. ^ Mur N, Lavrik O, Favre A, Safro M (sentyabr 2003). "Prokaryotik va eukaryotik tetramerik fenilalanil-tRNK sintetazlari tRNA (Phe) CCA uchining bog'lanish rejimini saqlaydi". Biokimyo. 42 (36): 10697–708. doi:10.1021 / bi034732q. PMID 12962494.
  5. ^ Klipcan L, Levin I, Kessler N, Mur N, Finarov I, Safro M (iyul 2008). "Inson mitoxondriyal fenilalanil-tRNA sintetazning tRNK tomonidan konformatsion faollashishi". Tuzilishi. 16 (7): 1095–104. doi:10.1016 / j.str.2008.03.020. PMID 18611382.

Qo'shimcha o'qish

  • Stulberg MP (1967). "Fenilalanil ribonuklein kislota sintetazasining Escherichia coli B dan ajratilishi va xossalari". J. Biol. Kimyoviy. 242 (5): 1060–4. PMID 5335910.
Ushbu maqola jamoat domenidagi matnlarni o'z ichiga oladi Pfam va InterPro: IPR005121