WikiDer > Vakillar ketma-ketligi

Representative sequences

Vakillar ketma-ketligi ichida joylashgan qisqa mintaqalar oqsillar ketma-ketligi taxminan taxmin qilish uchun ishlatilishi mumkin evolyutsion munosabatlar bu oqsillar yoki ular kelib chiqqan organizmlar. Vakillik ketma-ketliklari - bu tutashgan ketma-ketliklar (odatda 300 ta) qoldiqlar) dan hamma joyda, konservalangan oqsillar, har biri shunday ortologik yolg'iz olingan vakillik ketma-ketliklari oilasi a beradi masofa matritsasi konsensus matritsasi bilan yaqin kelishilgan holda.[1]

Foydalanish

Proteinlar ketma-ketligi haqida ma'lumot taqdim etishi mumkin biologik funktsiya va evolyutsiya oqsillar va protein domenlari. Shuning uchun oqsillar ketma-ketligini guruhlash va o'zaro bog'lash ham insonning biologik jarayonlari, ham er yuzidagi biologik jarayonlarning evolyutsion rivojlanishi haqida ma'lumot beradi; shunday ketma-ketlik klasterlari ketma-ketlik maydonini samarali qamrab olishga imkon beradi. Ketma-ketlik klasterlari ketma-ketliklarning katta ma'lumotlar bazasini kichikroq to'plamga qisqartirishi mumkin ketma-ketlik vakillari, ularning har biri o'z klasterini ketma-ketlik darajasida aks ettirishi kerak. Ketma-ketlik vakillari asl ma'lumotlar bazasini kamroq ketma-ketliklar bilan samarali qamrab olishga imkon beradi. Ketma-ketlik vakillarining ma'lumotlar bazasi deyiladi ortiqcha emas, shunga o'xshash (yoki ortiqcha) ketma-ketliklar ma'lum bir o'xshashlik chegarasida olib tashlanganligi sababli.

Adabiyotlar

  1. ^ Bern, Marshal; Goldberg, Devid (2004 yil 2-noyabr). "Bakterial filogeniya uchun vakili oqsillarni avtomatik tanlash". BMC evolyutsion biologiyasi. 5 (34): 34. doi:10.1186/1471-2148-5-34. PMC 1175084. PMID 15927057.