WikiDer > SNAI2

SNAI2
Identifikatorlar
Taxalluslar	SNAI2, SLUG, SLUGH1, SNAIL2, WS2D, salyangozlar oilasining transkripsiyaviy repressori 2, SLUGH
Tashqi identifikatorlar	OMIM: 602150 MGI: 1096393 HomoloGene: 31127 Generkartalar: SNAI2
Gen joylashuvi (odam)
Chr.	Xromosoma 8 (odam)
Oxiri	48,921,740 bp
Gen joylashuvi (Sichqoncha)
Chr.	Xromosoma 16 (sichqoncha)
Oxiri	14,709,385 bp
RNK ekspressioni naqsh
	Qo'shimcha ma'lumotni ifodalash ma'lumotlari
Gen ontologiyasi
Molekulyar funktsiya	• ketma-ketlikka xos DNK bilan bog'lanish; • DNK bilan bog'lanish; • metall ionlari bilan bog'lanish; • GO: 0001948 oqsil bilan bog'lanish; • nuklein kislota bilan bog'lanish; • GO: 0001200, GO: 0001133, GO: 0001201 DNK bilan bog'laydigan transkripsiya omilining faolligi, RNK polimeraza II ga xos; • GO: 0001078, GO: 0001214, GO: 0001206 DNK bilan bog'langan transkripsiya repressor faoliyati, RNK polimeraza II ga xos; • RNK polimeraza II regulyator mintaqasiga xos DNKni bog'lash; • xromatin bilan bog'lanish; • GO: 0001131, GO: 0001151, GO: 0001130, GO: 0001204 DNK bilan bog'laydigan transkripsiya omilining faolligi; • transkripsiya faktori faolligi, RNK polimeraza II distal kuchaytiruvchisi ketma-ketligiga xos bog'lanish; • Elektron qutini bog'lash;
Uyali komponent	• sitoplazma; • yadro xromatin; • hujayra yadrosi; • nukleoplazma;
Biologik jarayon	• Notch signalizatsiya yo'li; • D vitamini retseptorlari signalizatsiya yo'lining salbiy regulyatsiyasi; • transkripsiyani tartibga solish, DNK-andozalari; • asab hujayralari hujayralarining rivojlanishi; • keratinotsitlar ko'payishini salbiy tartibga solish; • ikki hujayrali zich birikma yig'ilishini tartibga solish; • hujayra migratsiyasini ijobiy tartibga solish; • ichki apoptotik signalizatsiya yo'lining DNK zararlanishiga javoban salbiy regulyatsiyasi; • transkripsiya, DNK-andozali; • epidermal o'sish omilini rag'batlantirishga uyali javob; • D vitamini biosintezi jarayonining salbiy regulyatsiyasi; • kemokin ishlab chiqarishni tartibga solish; • ko'p hujayrali organizm rivojlanishi; • xondrositlar farqlanishining salbiy regulyatsiyasi; • DNK zararlanishiga javoban salbiy regulyatsiya, p53 sinf mediatori tomonidan signal uzatilishi; • osteoblast differentsiatsiyasini tartibga solish; • osteoblastni farqlash; • kanonik Wnt signalizatsiya yo'li; • kanonik Wnt signalizatsiya yo'lining salbiy regulyatsiyasi; • integrin vositachiligida hujayra yopishqoqligining salbiy regulyatsiyasi; • anoikisning salbiy regulyatsiyasi; • RNK polimeraza II promotoridan transkripsiyaning salbiy regulyatsiyasi; • epitelial-mezenximal o'tish; • epiteliydan mezenkimaga o'tish, endokardial yostiq hosil bo'lishida ishtirok etadi; • endokardiyal yostiq hosil bo'lishida ishtirok etgan hujayra migratsiyasi; • tovushni sezgir idrok etish; • desmosomani demontaj qilish; • pigmentatsiya; • epiteliya rivojlanishi; • ligand bo'lmagan holda tashqi apoptotik signalizatsiya yo'lining salbiy regulyatsiyasi; • aorta qopqog'i morfogenezi; • substrat bilan bog'liq hujayralar migratsiyasida ishtirok etadigan hujayra yopishqoqligining salbiy regulyatsiyasi; • radiatsiyaga javob; • hujayra migratsiyasi; • giston asetilatsiyasining ijobiy regulyatsiyasi; • apoptotik jarayonning salbiy regulyatsiyasi; • yog 'hujayralarining farqlanishini ijobiy tartibga solish; • oq yog 'hujayralarining farqlanishi; • tanglayning rivojlanishi; • xaftaga morfogenezi; • tuprik bezlari morfogenezida ishtirok etadigan tarmoqlanishni tartibga solish; • ionlashtiruvchi nurlanishga uyali javob; • ildiz hujayralarining ko'payishini salbiy tartibga solish; • Yurak rivojlanishiga aloqador signalizatsiya;
	Manbalar:Amigo / QuickGO
Ortologlar
	6591
	20583
	ENSG00000019549
	ENSMUSG00000022676
	O43623
	P97469
	NM_003068
	NM_011415
	NP_003059
	NP_035545
	Vikidata
Insonni ko'rish / tahrirlash	Sichqonchani ko'rish / tahrirlash

SNAI2

SNAI2 barmoqli oqsil a transkripsiya omili odamlarda kodlanganligi SNAI2 gen. U ba'zi hujayralarning differentsiatsiyasi va migratsiyasiga yordam beradi va boshlashda rol o'ynaydi gastrulyatsiya.^[5]^[6]^[7]

Funktsiya

Ushbu gen C2H2 tipidagi salyangoz superfamilasining a'zosini kodlaydi sink barmog'i transkripsiya omillari. Kodlangan oqsil a funktsiyasini bajaradi transkripsiyaviy bog'laydigan repressor Elektron quti motiflari va shuningdek, bostirilishi mumkin Elektron kaderin ko'krak karsinomasida transkriptsiya. Ushbu protein ishtirok etadi epitelial-mezenximal o'tishlar va bor antiapoptotik faoliyat. U differentsiatsiya va migratsiyasini tartibga soladi asab tepasi hujayralar boshqa genlar bilan birga (masalan, FOXD3, SOX9 va SOX10, BMPlar) embrional hayotda. Ushbu gendagi mutatsiyalar sporadik holatlar bilan bog'liq bo'lishi mumkin asab naychasi nuqsonlar.^[7]^[8]

SNAI2 oldingi nerv hujayralari hujayralarida E-kaderin ekspressionini pasaytiradi; Shunday qilib, SNAI2 mahkam bog'langan epiteliya hujayralarini bo'shashgan mezenximal fenotipga ajralishiga olib keladi va gastrulyatsiyaga imkon beradi. mezoderma rivojlanayotgan embrionda.^[9]^[10] Tarkibiy jihatdan anti-apoptotikaga o'xshash Ces-1 yilda C. elegans, SLUG - rivojlanayotgan embrion va kattalardagi samarali hujayralar o'limining salbiy regulyatori.^[9]^[11]

Klinik ahamiyati

Inson to'qimalarida keng tarqalgan SLUG periferik qon leykotsitlarida, kattalar jigarida va homila va kattalar miya to'qimalarida yo'q.^[11] SLUG ko'krak bezi karsinomasida, shuningdek E-kaderinni regulyatsiya qilish yo'li bilan leykemiyada muhim rol o'ynaydi, bu esa mezenximal fenotipni qo'llab-quvvatlaydi, bu esa ekspressionni I tipdan II tip kaderin profiliga o'tkazadi.^[11]^[12] Mezenximal fenotipni saqlash o'sma hujayralarining metastazini ta'minlaydi, ammo SLUG invazivligidan qat'i nazar, karsinomalarda namoyon bo'ladi.^[9]^[10]^[11] Tovuq embrionlaridan foydalangan holda nokaut modeli mezodermal va asab kesti delaminatsiyasini inhibe qilganligini ko'rsatdi; jo'ja embrioni Slug funktsiyasining ortishi asab po'sti ishlab chiqarishni ko'paytiradi.^[9] Slugdagi mutatsiyalar ba'zi hayvonlarda gastrulyatsiya paytida homiladorlikning yo'qolishi bilan bog'liq.^[9]

O'zaro aloqalar

BMPlar SLUG ekspressionidan oldin bo'lib, gen ekspressionining yuqori oqim induktorlari sifatida gumon qilinadi.^[10]^[13]

Adabiyotlar

^ ^a ^b ^v GRCh38: Ensembl relizi 89: ENSG00000019549 - Ansambl, 2017 yil may
^ ^a ^b ^v GRCm38: Ensembl relizi 89: ENSMUSG00000022676 - Ansambl, 2017 yil may
^ "Human PubMed ma'lumotnomasi:". Milliy Biotexnologiya Axborot Markazi, AQSh Milliy Tibbiyot Kutubxonasi.
^ "Sichqoncha PubMed ma'lumotnomasi:". Milliy Biotexnologiya Axborot Markazi, AQSh Milliy Tibbiyot Kutubxonasi.
^ Rhim H, Savagner P, Thibaudeau G, Thiery JP, Pavan WJ (Yanvar 1998). "Sichqoncha xromosomasi 16 va odam xromosomasi 8 ga, asab kroki transkripsiyasi omilini Slug, lokalizatsiya qilish". Sutemizuvchilar genomi. 8 (11): 872–3. doi:10.1007 / s003359900601. PMID 9337409. S2CID 2177885.
^ Cohen ME, Yin M, Paznekas WA, Schertzer M, Wood S, Jabs EW (1998 yil avgust). "Inson SLUG genlarining tashkil etilishi, ekspressioni va xromosomalar xaritasining joylashuvi 8q". Genomika. 51 (3): 468–71. doi:10.1006 / geno.1998.5367. PMID 9721220.
^ ^a ^b "Entrez Gen: SNAI2 salyangoz homolog 2 (Drosophila)".
^ Stegmann, K .; Bekker, J .; Kosan, C .; Ermert, A .; Kunz, J .; Koch, M. C. (1999 yil avgust). "SLUG inson transkripsiyasi omili: asab naychasi nuqsoni bo'lgan bemorlarda mutatsion tahlil va Slug subfamily belgilaydigan mintaqada missense mutatsiyasini (D119E) aniqlash". Mutatsion tadqiqotlar. 406 (2–4): 63–69. doi:10.1016 / s1383-5726 (99) 00002-3. ISSN 0027-5107. PMID 10479723.
^ ^a ^b ^v ^d ^e Nieto MA (mart 2002). "Sink-barmoq transkripsiyasi omillarining salyangoz superfamiliyasi". Molekulyar hujayra biologiyasi. 3 (3): 155–66. doi:10.1038 / nrm757. PMID 11994736. S2CID 8330951.
^ ^a ^b ^v Karlson BM (2013). Inson embriologiyasi va rivojlanish biologiyasi (5-nashr). Filadelfiya, Pensilvaniya: Elsevier Health Sciences. 101-102, 106, 313, 362, 382-betlar. ISBN 978-1-4557-2794-0.
^ ^a ^b ^v ^d Inukai T, Inoue A, Kurosawa H, Goi K, Shinjyo T, Ozawa K, Mao M, Inaba T, Look AT (sentyabr 1999). "SLUG, antitoptotik faollikka ega bo'lgan ces-1 bilan bog'liq bo'lgan sink barmoqlari transkripsiyasi omil geni, E2A-HLF onkoproteinining quyi yo'nalishidagi maqsadidir". Molekulyar hujayra. 4 (3): 343–52. doi:10.1016 / S1097-2765 (00) 80336-6. PMID 10518215.
^ Kalluri R, Vaynberg RA (iyun 2009). "Epiteliya-mezenximal o'tish asoslari". Klinik tadqiqotlar jurnali. 119 (6): 1420–8. doi:10.1172 / jci39104. PMC 2689101. PMID 19487818.
^ Sakai D, Vakamatsu Y (2005). "Nerv krepsini shakllantirishning regulyativ mexanizmlari". Hujayralar to'qimalari organlari. 179 (1–2): 24–35. doi:10.1159/000084506. PMID 15942190. S2CID 1886380.

Qo'shimcha o'qish

Maruyama K, Sugano S (1994 yil yanvar). "Oligo-kepka: eukaryotik mRNAlarning kepka tuzilishini oligoribonukleotidlar bilan almashtirishning oddiy usuli". Gen. 138 (1–2): 171–4. doi:10.1016/0378-1119(94)90802-8. PMID 8125298.
Savagner P, Yamada KM, Thiery JP (iyun 1997). "Sink-barmoq oqsillari shilliqqoni desmosomaning ajralishini keltirib chiqaradi, bu o'sish omilidan kelib chiqadigan epiteliya-mezenximal o'tish uchun boshlang'ich va zarur qadam". Hujayra biologiyasi jurnali. 137 (6): 1403–19. doi:10.1083 / jcb.137.6.1403. PMC 2132541. PMID 9182671.
Suzuki Y, Yoshitomo-Nakagava K, Maruyama K, Suyama A, Sugano S (1997 yil oktyabr). "To'liq boyitilgan va 5'darajali boyitilgan cDNA kutubxonasini qurish va tavsifi". Gen. 200 (1–2): 149–56. doi:10.1016 / S0378-1119 (97) 00411-3. PMID 9373149.
Stegmann K, Boecker J, Kosan C, Ermert A, Kunz J, Koch MC (avgust 1999). "SLUG inson transkripsiyasi omili: asab naychasi nuqsoni bo'lgan bemorlarda mutatsion tahlil va Slug subfamily-definition mintaqasida missense mutatsiyasini (D119E) aniqlash". Mutatsion tadqiqotlar. 406 (2–4): 63–9. doi:10.1016 / S1383-5726 (99) 00002-3. PMID 10479723.
Inukai T, Inoue A, Kurosawa H, Goi K, Shinjyo T, Ozawa K, Mao M, Inaba T, Look AT (sentyabr 1999). "SLUG, antitoptotik faollikka ega bo'lgan ces-1 bilan bog'liq bo'lgan sink barmoqlari transkripsiyasi omil geni, E2A-HLF onkoproteinining quyi yo'nalishidagi maqsadidir". Molekulyar hujayra. 4 (3): 343–52. doi:10.1016 / S1097-2765 (00) 80336-6. PMID 10518215.
Hemavathy K, Guru SC, Xarris J, Chen JD, Ip YT (iyul 2000). "Human Slug - bu faol transkripsiya joylariga joylashadigan repressor". Molekulyar va uyali biologiya. 20 (14): 5087–95. doi:10.1128 / MCB.20.14.5087-5095.2000. PMC 85958. PMID 10866665.
Xajra KM, Chen DY, Fearon ER (mart 2002). "SLUG sink-barmoq oqsili ko'krak bezi saratonida E-kaderinni siqib chiqaradi". Saraton kasalligini o'rganish. 62 (6): 1613–8. PMID 11912130.
Sanches-Martín M, Rodriges-García A, Peres-Losada J, Sagrera A, Read AP, Sanches-García I (dekabr 2002). "Vaardenburg kasalligi bo'lgan bemorlarda SLUG (SNAI2) o'chirilishi". Inson molekulyar genetikasi. 11 (25): 3231–6. doi:10.1093 / hmg / 11.25.3231. PMID 12444107.
Kajita M, McClinic KN, Wade PA (sentyabr 2004). "Salyangoz va shilliqqoning transkripsiyasi omillarining keskin ifodasi genotoksik stressga javobni o'zgartiradi". Molekulyar va uyali biologiya. 24 (17): 7559–66. doi:10.1128 / MCB.24.17.7559-7566.2004. PMC 506998. PMID 15314165.
Catalano A, Rodilossi S, Rippo MR, Caprari P, Procopio A (2004 yil noyabr). "Ko'p dori-darmonlarga chidamli malign mezotelyoma xujayralarida ildiz hujayrasi omilini indüksiyonu / c-Kit / slug signal transdüksiyonu". Biologik kimyo jurnali. 279 (45): 46706–14. doi:10.1074 / jbc.M406696200. PMID 15337769.
Uchikado Y, Natsugoe S, Okumura H, Setoyama T, Matsumoto M, Ishigami S, Aikou T (fevral 2005). "E-kaderin saqlanib qolgan o'smalardagi shilliqqurtning ifodasi qizilo'ngach skuamöz hujayrali karsinomali bemorlarda prognoz bilan bog'liq". Klinik saraton tadqiqotlari. 11 (3): 1174–80. PMID 15709186.
Tripathi MK, Misra S, Khedkar SV, Hamilton N, Irvin-Uilson C, Sharan C, Sealy L, Chaudhuri G (aprel 2005). "BRCA2 genining ekspluatatsiyasini SLUG repressor oqsilining inson ko'krak hujayralarida regulyatsiyasi". Biologik kimyo jurnali. 280 (17): 17163–71. doi:10.1074 / jbc.M501375200. PMC 3092429. PMID 15734731.
Tripathi MK, Misra S, Chaudhuri G (aprel 2005). "8 va 19 tsitokeratinlarning SLUG repressor oqsilining inson ko'krak hujayralarida ifodasini salbiy tartibga solish". Biokimyoviy va biofizik tadqiqotlari. 329 (2): 508–15. doi:10.1016 / j.bbrc.2005.02.006. PMC 3086003. PMID 15737616.
Moody SE, Perez D, Pan TC, Sarkisian CJ, Portocarrero CP, Sterner CJ, Notorfrancesco KL, Cardiff RD, Chodosh LA (sentyabr 2005). "Transkripsiyali repressor Salyangoz sut bezlarida o'smaning qaytalanishiga yordam beradi". Saraton xujayrasi. 8 (3): 197–209. doi:10.1016 / j.ccr.2005.07.009. PMID 16169465.
Chen M, Chen LM, Chai KX (iyun 2006). "Prostazin geni ekspressionining androgen regulyatsiyasi sterolni boshqaruvchi elementni bog'laydigan oqsillar va SLUG vositasida amalga oshiriladi". Prostata. 66 (9): 911–20. doi:10.1002 / pros.20325. PMID 16541421. S2CID 23036264.
Turner FE, Broad S, Khanim FL, Jeanes A, Talma S, Hughes S, Tselepis C, Hotchin NA (2006 yil iyul). "Slug odamning epidermal keratinotsitlarida integralning ekspressioni va hujayralarining ko'payishini tartibga soladi". Biologik kimyo jurnali. 281 (30): 21321–31. doi:10.1074 / jbc.M509731200. PMID 16707493.

[refGRCh38Ensembl-1] v GRCh38: Ensembl relizi 89: ENSG00000019549 - Ansambl, 2017 yil may

[refGRCm38Ensembl-2] v GRCm38: Ensembl relizi 89: ENSMUSG00000022676 - Ansambl, 2017 yil may

[3] "Human PubMed ma'lumotnomasi:". Milliy Biotexnologiya Axborot Markazi, AQSh Milliy Tibbiyot Kutubxonasi.

[4] "Sichqoncha PubMed ma'lumotnomasi:". Milliy Biotexnologiya Axborot Markazi, AQSh Milliy Tibbiyot Kutubxonasi.

[pmid9337409-5] Rhim H, Savagner P, Thibaudeau G, Thiery JP, Pavan WJ (Yanvar 1998). "Sichqoncha xromosomasi 16 va odam xromosomasi 8 ga, asab kroki transkripsiyasi omilini Slug, lokalizatsiya qilish". Sutemizuvchilar genomi. 8 (11): 872–3. doi:10.1007 / s003359900601. PMID 9337409. S2CID 2177885.

[pmid9721220-6] Cohen ME, Yin M, Paznekas WA, Schertzer M, Wood S, Jabs EW (1998 yil avgust). "Inson SLUG genlarining tashkil etilishi, ekspressioni va xromosomalar xaritasining joylashuvi 8q". Genomika. 51 (3): 468–71. doi:10.1006 / geno.1998.5367. PMID 9721220.

[entrez-7] "Entrez Gen: SNAI2 salyangoz homolog 2 (Drosophila)".

[8] Stegmann, K .; Bekker, J .; Kosan, C .; Ermert, A .; Kunz, J .; Koch, M. C. (1999 yil avgust). "SLUG inson transkripsiyasi omili: asab naychasi nuqsoni bo'lgan bemorlarda mutatsion tahlil va Slug subfamily belgilaydigan mintaqada missense mutatsiyasini (D119E) aniqlash". Mutatsion tadqiqotlar. 406 (2–4): 63–69. doi:10.1016 / s1383-5726 (99) 00002-3. ISSN 0027-5107. PMID 10479723.

[Nieto_2002-9] v ^d ^e Nieto MA (mart 2002). "Sink-barmoq transkripsiyasi omillarining salyangoz superfamiliyasi". Molekulyar hujayra biologiyasi. 3 (3): 155–66. doi:10.1038 / nrm757. PMID 11994736. S2CID 8330951.

[Carlson_2013-10] v Karlson BM (2013). Inson embriologiyasi va rivojlanish biologiyasi (5-nashr). Filadelfiya, Pensilvaniya: Elsevier Health Sciences. 101-102, 106, 313, 362, 382-betlar. ISBN 978-1-4557-2794-0.

[Inukai_1999-11] v ^d Inukai T, Inoue A, Kurosawa H, Goi K, Shinjyo T, Ozawa K, Mao M, Inaba T, Look AT (sentyabr 1999). "SLUG, antitoptotik faollikka ega bo'lgan ces-1 bilan bog'liq bo'lgan sink barmoqlari transkripsiyasi omil geni, E2A-HLF onkoproteinining quyi yo'nalishidagi maqsadidir". Molekulyar hujayra. 4 (3): 343–52. doi:10.1016 / S1097-2765 (00) 80336-6. PMID 10518215.

[12] Kalluri R, Vaynberg RA (iyun 2009). "Epiteliya-mezenximal o'tish asoslari". Klinik tadqiqotlar jurnali. 119 (6): 1420–8. doi:10.1172 / jci39104. PMC 2689101. PMID 19487818.

[13] Sakai D, Vakamatsu Y (2005). "Nerv krepsini shakllantirishning regulyativ mexanizmlari". Hujayralar to'qimalari organlari. 179 (1–2): 24–35. doi:10.1159/000084506. PMID 15942190. S2CID 1886380.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]

[10]

[11]

[12]

[13]

Navigation