WikiDer > SUV39H1

SUV39H1
Mavjud tuzilmalar
PDB	Ortholog qidiruvi: PDBe RCSB
PDB id kodlari ro'yxati
	3MTS
Identifikatorlar
Taxalluslar	SUV39H1, H3-K9-HMTase 1, KMT1A, MG44, SUV39H, turg'unlik supressori 3-9 gomolog 1
Tashqi identifikatorlar	OMIM: 300254 MGI: 1099440 HomoloGene: 2388 Generkartalar: SUV39H1
Gen joylashuvi (odam)
Chr.	X xromosoma (odam)
Oxiri	48,709,012 bp
Gen joylashuvi (Sichqoncha)
Chr.	X xromosoma (sichqoncha)
Oxiri	8,074,760 bp
RNK ekspressioni naqsh
	Qo'shimcha ma'lumotni ifodalash ma'lumotlari
Gen ontologiyasi
Molekulyar funktsiya	• metiltransferaza faolligi; • transferaza faoliyati; • giston metiltransferaza faolligi; • giston metiltransferaza faolligi (o'ziga xos H3-K9); • S-adenosilmetioninga bog'liq metiltransferaza faolligi; • oqsilni N-terminus bilan bog'lash; • rux ionlari bilan bog'lanish; • xromatin bilan bog'lanish; • transkripsiyani tartibga soluvchi mintaqa ketma-ketligiga xos DNKni bog'lash; • metall ionlari bilan bog'lanish; • GO: 0001948 oqsil bilan bog'lanish; • giston-lizin N-metiltransferaza faolligi;
Uyali komponent	• yadro qatlami; • nukleoplazma; • xromosoma; • heteroxromatin; • quyultirilgan yadro xromosomasi; • rDNA heteroxromatin; • xromatinni sustlash kompleksi; • xromosoma, sentromerik mintaqa; • hujayra yadrosi;
Biologik jarayon	• hujayralarni differentsiatsiyasi; • transkripsiyani tartibga solish, DNK-andozalari; • histon H3-K9 dimetillanish; • ritmik jarayon; • sirkadiyalik ritmning salbiy regulyatsiyasi; • RNK polimeraza II promotoridan transkripsiyaning salbiy regulyatsiyasi; • transkripsiya, DNK-andozali; • histon H3-K9 trimetillanish; • DNKning zararlanishini rag'batlantirishga uyali javob; • metilatsiya; • rDNK da xromatinni susaytirish; • rRNKni qayta ishlash; • giston lizin metilatsiyasi; • hujayra aylanishi; • GO: 0022415 virusli jarayon; • transkripsiyaning salbiy regulyatsiyasi, DNK-andozalari; • gipoksiyaga uyali javob; • xromatin moddasi;
	Manbalar:Amigo / QuickGO
Ortologlar
	6839
	20937
	ENSG00000101945
	ENSMUSG00000039231
	O43463
	O54864
	NM_003173; NM_001282166
	NM_001290716; NM_011514; NM_001358237
	NP_001269095; NP_003164
	NP_001277645; NP_035644; NP_001345166
	Vikidata
Insonni ko'rish / tahrirlash	Sichqonchani ko'rish / tahrirlash

SUV39H1

Giston-lizin N-metiltransferaza SUV39H1 bu ferment odamlarda kodlanganligi SUV39H1 gen.^[5]

Funktsiya

Ushbu gen 3-9 gomolog oilasining rang-barangligi supressorining a'zosi bo'lib, oqsilni a bilan kodlaydi xromodomain va C-terminalli SET domeni. Ushbu yadro oqsili mitoz paytida sentromeralarga o'tadi va histon metiltransferaza vazifasini bajaradi, H3 histonning Lys-9 ni metillaydi. Umuman olganda, u heteroxromatinni tashkil qilishda, xromosomalarni ajratishida va mitotik progresiyada muhim rol o'ynaydi.^[6]

O'zaro aloqalar

SUV39H1 ga ko'rsatildi o'zaro ta'sir qilish bilan:

PIN1^[16]

Adabiyotlar

^ ^a ^b ^v GRCh38: Ensembl relizi 89: ENSG00000101945 - Ansambl, 2017 yil may
^ ^a ^b ^v GRCm38: Ensembl relizi 89: ENSMUSG00000039231 - Ansambl, 2017 yil may
^ "Human PubMed ma'lumotnomasi:". Milliy Biotexnologiya Axborot Markazi, AQSh Milliy Tibbiyot Kutubxonasi.
^ "Sichqoncha PubMed ma'lumotnomasi:". Milliy Biotexnologiya Axborot Markazi, AQSh Milliy Tibbiyot Kutubxonasi.
^ ^a ^b Aagaard L, Laible G, Selenko P, Shmid M, Dorn R, Shotta G, Kuhfittig S, Wolf A, Lebersorger A, Singh PB, Reuter G, Jenuwein T (iyun 1999). "Drosophila PEV-modifikatori Su (var) 3-9 ning sutemizuvchilarning funktsional gomologlari heteroxromatin komponenti M31 bilan murakkablashgan sentromeraga bog'liq oqsillarni kodlaydi". EMBO J. 18 (7): 1923–38. doi:10.1093 / emboj / 18.7.1923. PMC 1171278. PMID 10202156.
^ "Entrez Gen: SUV39H1 rang-baranglikni bostiruvchi 3-9 gomolog 1 (Drosophila)".
^ ^a ^b Zhang CL, McKinsey TA, Olson EN (oktyabr 2002). "II darajali giston deatsetilazlarning heteroxromatin oqsili 1 bilan assotsiatsiyasi: mushaklarning differentsiatsiyasini boshqarishda giston metilatsiyasining potentsial roli". Mol. Hujayra. Biol. 22 (20): 7302–12. doi:10.1128 / mcb.22.20.7302-7312.2002. PMC 139799. PMID 12242305.
^ ^a ^b Fujita N, Vatanabe S, Ichimura T, Tsuruzoe S, Shinkai Y, Tachibana M, Chiba T, Nakao M (iyun 2003). "Metil-CpG majburiy domeni 1 (MBD1) Suv39h1-HP1 heteroxromatik kompleksi bilan DNK metilatsiyasiga asoslangan transkripsiyali repressiya uchun o'zaro ta'sir qiladi". J. Biol. Kimyoviy. 278 (26): 24132–8. doi:10.1074 / jbc.M302283200. PMID 12711603.
^ Rual JF, Venkatesan K, Xao T, Xirozane-Kishikava T, Drikot A, Li N, Berriz GF, Gibbons FD, Dreze M, Ayivi-Gedehoussou N, Klitgord N, Simon C, Boxem M, Milshteyn S, Rozenberg J, Goldberg DS, Zhang LV, Vong SL, Franklin G, Li S, Albala JS, Lim J, Fraughton C, Llamosas E, Cevik S, Bex C, Lamesch P, Sikorski RS, Vandenhaute J, Zoghbi HY, Smolyar A, Bosak S, Sequerra R, Ducette-Stamm L, Cusick ME, Hill DE, Roth FP, Vidal M (oktyabr 2005). "Odamning oqsil va oqsil bilan o'zaro aloqasi tarmog'ining proteom miqyosli xaritasi tomon". Tabiat. 437 (7062): 1173–8. Bibcode:2005 yil. Nat. 437.1173R. doi:10.1038 / nature04209. PMID 16189514. S2CID 4427026.
^ Fuks F, Hurd PJ, Deplus R, Kouzarides T (may 2003). "DNK metiltransferazlar HP1 va SUV39H1 histon metiltransferaza bilan bog'lanadi". Nuklein kislotalari rez. 31 (9): 2305–12. doi:10.1093 / nar / gkg332. PMC 154218. PMID 12711675.
^ ^a ^b ^v Vaute O, Nikolas E, Vandel L, Trouche D (2002 yil yanvar). "Giston metil transferaz Suv39H1 va giston deatsetilazalar o'rtasidagi funktsional va jismoniy o'zaro ta'sir". Nuklein kislotalari rez. 30 (2): 475–81. doi:10.1093 / nar / 30.2.475. PMC 99834. PMID 11788710.
^ Chakraborty S, Sinha KK, Senyuk V, Nucifora G (Avgust 2003). "SUV39H1 AML1 bilan o'zaro ta'sir qiladi va AML1 transaktivligini bekor qiladi. AML1 in vivo jonli ravishda metillanadi". Onkogen. 22 (34): 5229–37. doi:10.1038 / sj.onc.1206600. PMID 12917624.
^ Nilsen SJ, Shnayder R, Bauer UM, Bannister AJ, Morrison A, O'Karrol D, Firestein R, Kliari M, Jenueyn T, Errera RE, Kouzarides T (avgust 2001). "Rb targ'ibotchilarga histon H3 metilatsiyasini va HP1ni maqsad qiladi". Tabiat. 412 (6846): 561–5. Bibcode:2001 yil natur.412..561N. doi:10.1038/35087620. PMID 11484059. S2CID 4378296.
^ Vandel L, Nikolas E, Vaute O, Ferreira R, Ait-Si-Ali S, Trouche D (oktyabr 2001). "Retinoblastoma oqsili bilan transkripsiyaviy repressiya, histon metiltransferaza yollash orqali". Mol. Hujayra. Biol. 21 (19): 6484–94. doi:10.1128 / mcb.21.19.6484-6494.2001. PMC 99795. PMID 11533237.
^ Firestein R, Cui X, Huie P, Cleary ML (2000 yil iyul). "Drosophila Su (var) 3-9 sutemizuvchisi ortologi SUV39H1 tomonidan transkripsiya söndürme va o'sishni nazorat qilishning domenga bog'liq regulyatsiyasi". Mol. Hujayra. Biol. 20 (13): 4900–9. doi:10.1128 / mcb.20.13.4900-4909.2000. PMC 85941. PMID 10848615.
^ Xanal, Prem; Kim, Garam; Lim, Sung-Chul; Yun, Xyo ‐ Jeong; Li, Kvang Youl; Choi, Xu ‐ Kyun; Choi, Hong Seok (2013). "Prolyl izomeraz Pin1 ko'krak bezi saratonida shish paydo bo'lishini rag'batlantirish uchun SUV39H1 barqarorligini salbiy tartibga soladi". FASEB jurnali. 27 (11): 4606–4618. doi:10.1096 / fj.13-236851. PMID 23934277. S2CID 5259616.

Qo'shimcha o'qish

Schotta G, Ebert A, Reuter G (2003). "SU (VAR) 3-9 - bu heteroxromatik genlarni sukunatlashda saqlanadigan asosiy funktsiya". Genetika. 117 (2–3): 149–58. doi:10.1023 / A: 1022923508198. PMID 12723694. S2CID 39517859.
Hijmans EM, Voorhoeve PM, Beijersbergen RL, van 't Veer LJ, Bernards R (1995). "E2F-5, in Vivo jonli ravishda p130 bilan o'zaro aloqada bo'lgan yangi E2F oilasi a'zosi". Mol. Hujayra. Biol. 15 (6): 3082–9. doi:10.1128 / mcb.15.6.3082. PMC 230539. PMID 7760804.
Maruyama K, Sugano S (1994). "Oligo-kepka: eukaryotik mRNAlarning kepka tuzilishini oligoribonukleotidlar bilan almashtirishning oddiy usuli". Gen. 138 (1–2): 171–4. doi:10.1016/0378-1119(94)90802-8. PMID 8125298.
Suzuki Y, Yoshitomo-Nakagava K, Maruyama K, Suyama A, Sugano S (1997). "To'liq boyitilgan va 5'darajali boyitilgan cDNA kutubxonasini qurish va tavsifi". Gen. 200 (1–2): 149–56. doi:10.1016 / S0378-1119 (97) 00411-3. PMID 9373149.
Aagaard L, Shmid M, Warburton P, Jenuwein T (2000). "Faol sentromeralarning yangi tarkibiy qismi bo'lgan SUV39H1 ning mitotik fosforillanishi sutemizuvchilar sentromeralarida vaqtincha to'planishiga to'g'ri keladi". J. Cell Sci. 113 (5): 817–29. PMID 10671371.
Melcher M, Shmid M, Aagaard L, Selenko P, Laible G, Jenuwein T (2000). "SUV39H1 ning struktura-funktsional tahlili geteroxromatinni tashkil etishda, xromosomalarni ajratishida va mitotik progresiyada dominant rolni ochib beradi". Mol. Hujayra. Biol. 20 (10): 3728–41. doi:10.1128 / MCB.20.10.3728-3741.2000. PMC 85674. PMID 10779362.
Firestein R, Cui X, Huie P, Cleary ML (2000). "Drosophila Su (var) 3-9 sutemizuvchi ortologi SUV39H1 tomonidan transkripsiya söndürme va o'sishni nazorat qilishning domenga bog'liq regulyatsiyasi". Mol. Hujayra. Biol. 20 (13): 4900–9. doi:10.1128 / MCB.20.13.4900-4909.2000. PMC 85941. PMID 10848615.
Freyzer ME, Jeyms MN, Bridger VA, Volodko VT (2000). "Cho'chqa yuragining fosforillangan va deposforillangan tuzilmalari, GTPga xos süksinil-KoA sintetaza". J. Mol. Biol. 299 (5): 1325–39. doi:10.1006 / jmbi.2000.3807. PMID 10873456.
Rea S, Eisenhaber F, O'Carroll D, Strahl BD, Sun ZW, Shmid M, Opravil S, Mextler K, Ponting CP, Allis CD, Jenuwein T (2000). "Hromatin tuzilishini saytga xos giston H3 metiltransferazalar bilan tartibga solish". Tabiat. 406 (6796): 593–9. Bibcode:2000 yil Natur.406..593R. doi:10.1038/35020506. PMID 10949293. S2CID 205008015.
Lachner M, O'Karrol D, Rea S, Mextler K, Jenueyn T (2001). "Giston H3 lizinin 9 metilatsiyasi HP1 oqsillari uchun bog'lanish joyini yaratadi". Tabiat. 410 (6824): 116–20. Bibcode:2001 yil Noyabr 410..116L. doi:10.1038/35065132. PMID 11242053. S2CID 4331863.
Vandel L, Trouche D (2001). "Giston atsetil transferaza CBP va giston metil transferaza o'rtasidagi fizik bog'liqlik". EMBO vakili. 2 (1): 21–6. doi:10.1093 / embo-report / kve002. PMC 1083799. PMID 11252719.
Nilsen SJ, Shnayder R, Bauer UM, Bannister AJ, Morrison A, O'Karrol D, Firestein R, Kliari M, Jenueyn T, Herrera RE, Kouzarides T (2001). "Rb targ'ibotchilarga histon H3 metilatsiyasini va HP1ni maqsad qiladi". Tabiat. 412 (6846): 561–5. Bibcode:2001 yil natur.412..561N. doi:10.1038/35087620. PMID 11484059. S2CID 4378296.
Vandel L, Nikolas E, Vaute O, Ferreira R, Ait-Si-Ali S, Trouche D (2001). "Retinoblastoma oqsili bilan transkripsiyaviy repressiya, histon metiltransferaza yollash orqali". Mol. Hujayra. Biol. 21 (19): 6484–94. doi:10.1128 / MCB.21.19.6484-6494.2001. PMC 99795. PMID 11533237.
Vaute O, Nikolas E, Vandel L, Trouche D (2002). "Suv39H1 giston metil transferaza va giston deatsetilazalar o'rtasidagi funktsional va jismoniy o'zaro ta'sir". Nuklein kislotalari rez. 30 (2): 475–81. doi:10.1093 / nar / 30.2.475. PMC 99834. PMID 11788710.
Schotta G, Ebert A, Krauss V, Fischer A, Hoffmann J, Rea S, Jenuwein T, Dorn R, Reuter G (2002). "Drosophila SU (VAR) 3-9 histonining H3-K9 metillanishida va geteroxromatik genlarni sustlashida markaziy roli". EMBO J. 21 (5): 1121–31. doi:10.1093 / emboj / 21.5.1121. PMC 125909. PMID 11867540.
Sewalt RG, Lachner M, Vargas M, Hamer KM, den Blauven JL, Hendrix T, Melcher M, Shvaytser D, Jenuveyin T, Otte AP (2002). "Umurtqali polikom gomologlari va SUV39H1 giston lizin metiltransferazasi o'rtasidagi selektiv o'zaro aloqalar, Histon H3-K9 metilatsiyasining Polycomb guruhi oqsillarini xromosoma yo'naltirishiga yordam beradi". Mol. Hujayra. Biol. 22 (15): 5539–53. doi:10.1128 / MCB.22.15.5539-5553.2002. PMC 133945. PMID 12101246.
Zhang CL, McKinsey TA, Olson EN (2002). "II darajali giston deatsetilazlarning heteroxromatin oqsili 1 bilan assotsiatsiyasi: mushaklarning differentsiatsiyasini boshqarishda giston metilatsiyasining potentsial roli". Mol. Hujayra. Biol. 22 (20): 7302–12. doi:10.1128 / MCB.22.20.7302-7312.2002. PMC 139799. PMID 12242305.
Yamamoto K, Sonoda M (2003). "Geteroxromatin oqsil 1 ning o'zaro ta'sirlanishi, giston metiltransferaza, SUV39H1 bilan bevosita bog'lanish uchun kerak". Biokimyo. Biofiz. Res. Kommunal. 301 (2): 287–92. doi:10.1016 / S0006-291X (02) 03021-8. PMID 12565857.

[refGRCh38Ensembl-1] v GRCh38: Ensembl relizi 89: ENSG00000101945 - Ansambl, 2017 yil may

[refGRCm38Ensembl-2] v GRCm38: Ensembl relizi 89: ENSMUSG00000039231 - Ansambl, 2017 yil may

[3] "Human PubMed ma'lumotnomasi:". Milliy Biotexnologiya Axborot Markazi, AQSh Milliy Tibbiyot Kutubxonasi.

[4] "Sichqoncha PubMed ma'lumotnomasi:". Milliy Biotexnologiya Axborot Markazi, AQSh Milliy Tibbiyot Kutubxonasi.

[pmid10202156-5] Aagaard L, Laible G, Selenko P, Shmid M, Dorn R, Shotta G, Kuhfittig S, Wolf A, Lebersorger A, Singh PB, Reuter G, Jenuwein T (iyun 1999). "Drosophila PEV-modifikatori Su (var) 3-9 ning sutemizuvchilarning funktsional gomologlari heteroxromatin komponenti M31 bilan murakkablashgan sentromeraga bog'liq oqsillarni kodlaydi". EMBO J. 18 (7): 1923–38. doi:10.1093 / emboj / 18.7.1923. PMC 1171278. PMID 10202156.

[entrez-6] "Entrez Gen: SUV39H1 rang-baranglikni bostiruvchi 3-9 gomolog 1 (Drosophila)".

[pmid12242305-7] Zhang CL, McKinsey TA, Olson EN (oktyabr 2002). "II darajali giston deatsetilazlarning heteroxromatin oqsili 1 bilan assotsiatsiyasi: mushaklarning differentsiatsiyasini boshqarishda giston metilatsiyasining potentsial roli". Mol. Hujayra. Biol. 22 (20): 7302–12. doi:10.1128 / mcb.22.20.7302-7312.2002. PMC 139799. PMID 12242305.

[pmid12711603-8] Fujita N, Vatanabe S, Ichimura T, Tsuruzoe S, Shinkai Y, Tachibana M, Chiba T, Nakao M (iyun 2003). "Metil-CpG majburiy domeni 1 (MBD1) Suv39h1-HP1 heteroxromatik kompleksi bilan DNK metilatsiyasiga asoslangan transkripsiyali repressiya uchun o'zaro ta'sir qiladi". J. Biol. Kimyoviy. 278 (26): 24132–8. doi:10.1074 / jbc.M302283200. PMID 12711603.

[pmid16189514-9] Rual JF, Venkatesan K, Xao T, Xirozane-Kishikava T, Drikot A, Li N, Berriz GF, Gibbons FD, Dreze M, Ayivi-Gedehoussou N, Klitgord N, Simon C, Boxem M, Milshteyn S, Rozenberg J, Goldberg DS, Zhang LV, Vong SL, Franklin G, Li S, Albala JS, Lim J, Fraughton C, Llamosas E, Cevik S, Bex C, Lamesch P, Sikorski RS, Vandenhaute J, Zoghbi HY, Smolyar A, Bosak S, Sequerra R, Ducette-Stamm L, Cusick ME, Hill DE, Roth FP, Vidal M (oktyabr 2005). "Odamning oqsil va oqsil bilan o'zaro aloqasi tarmog'ining proteom miqyosli xaritasi tomon". Tabiat. 437 (7062): 1173–8. Bibcode:2005 yil. Nat. 437.1173R. doi:10.1038 / nature04209. PMID 16189514. S2CID 4427026.

[pmid12711675-10] Fuks F, Hurd PJ, Deplus R, Kouzarides T (may 2003). "DNK metiltransferazlar HP1 va SUV39H1 histon metiltransferaza bilan bog'lanadi". Nuklein kislotalari rez. 31 (9): 2305–12. doi:10.1093 / nar / gkg332. PMC 154218. PMID 12711675.

[pmid11788710-11] v Vaute O, Nikolas E, Vandel L, Trouche D (2002 yil yanvar). "Giston metil transferaz Suv39H1 va giston deatsetilazalar o'rtasidagi funktsional va jismoniy o'zaro ta'sir". Nuklein kislotalari rez. 30 (2): 475–81. doi:10.1093 / nar / 30.2.475. PMC 99834. PMID 11788710.

[pmid12917624-12] Chakraborty S, Sinha KK, Senyuk V, Nucifora G (Avgust 2003). "SUV39H1 AML1 bilan o'zaro ta'sir qiladi va AML1 transaktivligini bekor qiladi. AML1 in vivo jonli ravishda metillanadi". Onkogen. 22 (34): 5229–37. doi:10.1038 / sj.onc.1206600. PMID 12917624.

[pmid11484059-13] Nilsen SJ, Shnayder R, Bauer UM, Bannister AJ, Morrison A, O'Karrol D, Firestein R, Kliari M, Jenueyn T, Errera RE, Kouzarides T (avgust 2001). "Rb targ'ibotchilarga histon H3 metilatsiyasini va HP1ni maqsad qiladi". Tabiat. 412 (6846): 561–5. Bibcode:2001 yil natur.412..561N. doi:10.1038/35087620. PMID 11484059. S2CID 4378296.

[pmid11533237-14] Vandel L, Nikolas E, Vaute O, Ferreira R, Ait-Si-Ali S, Trouche D (oktyabr 2001). "Retinoblastoma oqsili bilan transkripsiyaviy repressiya, histon metiltransferaza yollash orqali". Mol. Hujayra. Biol. 21 (19): 6484–94. doi:10.1128 / mcb.21.19.6484-6494.2001. PMC 99795. PMID 11533237.

[pmid10848615-15] Firestein R, Cui X, Huie P, Cleary ML (2000 yil iyul). "Drosophila Su (var) 3-9 sutemizuvchisi ortologi SUV39H1 tomonidan transkripsiya söndürme va o'sishni nazorat qilishning domenga bog'liq regulyatsiyasi". Mol. Hujayra. Biol. 20 (13): 4900–9. doi:10.1128 / mcb.20.13.4900-4909.2000. PMC 85941. PMID 10848615.

[16] Xanal, Prem; Kim, Garam; Lim, Sung-Chul; Yun, Xyo ‐ Jeong; Li, Kvang Youl; Choi, Xu ‐ Kyun; Choi, Hong Seok (2013). "Prolyl izomeraz Pin1 ko'krak bezi saratonida shish paydo bo'lishini rag'batlantirish uchun SUV39H1 barqarorligini salbiy tartibga soladi". FASEB jurnali. 27 (11): 4606–4618. doi:10.1096 / fj.13-236851. PMID 23934277. S2CID 5259616.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]

[10]

[11]

[12]

[13]

[14]

[15]

[16]

Navigation