WikiDer > SbRNA

SbRNA
sbRNA
SbRNA kons.png
SbRNA nematodasining saqlanib qolgan ikkilamchi tuzilishi
Identifikatorlar
BelgilarsbRNA
Boshqa ma'lumotlar
RNK turiGen
Domen (lar)Caenorhabditis
PDB tuzilmalarPDBe
Rfam

sbRNA (pog'onali bo'rtma) RNK) oila kodlamaydigan RNK birinchi marta kashf etilgan Caenorhabditis elegans. To'liq paytida aniqlandi transkriptom ekrani C. elegans cDNA kutubxona.[1] Keyingi tajriba sbRNK saqlanib qolganligi bilan tavsiflandi 5' va 3' uzun shakllanadigan ichki motivlar juft poyasi bo'rtiq bilan kesilgan.[2]

Ifoda

sbRNA ning o'zgaruvchanligi bor ifoda rivojlanish jarayonida naqshlar. Ular kattalar qurtlarida eng yuqori darajada namoyon bo'ladi, bodring lichinkalari va quyidagi issiqlik zarbasi.[1] Tizimli nokaut bilan yiqitmoq; ishdan chiqarilgan yordamida tahlil qilish RNAi yo'q deb topildi fenotip ichida ikkita sbRNA ning nokauti uchun C. elegans,[3] ammo nnKRNKdagi RNKning samaradorligi so'roq qilingan.[4] sbRNKlar oqsil tolalarida qat'iylikni saqlab qolish uchun immunoglobulinni o'z ichiga oladi, ammo ular noto'g'ri ishlaydigan ribosomalardan yuqtirish xavfi mavjud.

sbRNK umumiy promouter elementlari dan iborat TATA qutisi va proksimal ketma-ketlik elementi (PSE B qutisi), ammo ulardan faqat bittasi talab qilinadi transkripsiya.[5] Stenogramma bo'lgani kabi yopilmagan va poliuridillangan, tomonidan yozilgan deb o'ylashadi RNK polimeraza III.[6]

Y RNK homologiyasi

SbRNA, CeN134 umurtqali uchun homolog nomzod sifatida xabar berilgan Y RNK davomida qirollik- keng ko'lamli qidiruv.[7] Qo'shimcha tergov gomologik topildi ikkilamchi tuzilish saqlanib qolgan spiral mintaqalar va UUAUC ning umumiy tsikli motifi bilan.[6]

Shuning uchun sbRNKlarning vazifasi umurtqali Y RNK larnikiga o'xshash bo'lishi mumkin, ya'ni Ro- RNK sifatini boshqarish uchun RNK zarrasi[8] va xromosomada rol o'ynaydi takrorlash.[9] O'chirish sbRNA ning xromosoma ko'payishiga to'sqinlik qilmaydi C. elegans, ammo bu boshqa sbRNKlarning etishmayotgan elementlarni o'rnini bosishi (odam Y RNKdagi kabi) natijasida bo'lishi mumkin. Ushbu nazariya, shuningdek, RNK tadqiqotlari nokaut qilingan sbRNAlar uchun fenotipni aniqlay olmaganligini ham tushuntiradi.[6]

Shuningdek qarang

Adabiyotlar

  1. ^ a b Deng V, Zhu X, Skogerbø G va boshq. (2006 yil yanvar). "Caenorhabditis elegans ning kichik kodlashsiz transkriptomini tashkil qilish: genomik xususiyatlari, biogenezi va ekspressioni". Genom Res. 16 (1): 20–9. doi:10.1101 / gr.4139206. PMC 1356125. PMID 16344563.
  2. ^ Aftab MN; U H; Skogerbø G; Chen R (2008). "RNAi-dan keyin Caenorhabditis elegansidagi ncRNA ekspression naqshlarini snoRNA bilan bog'langan oqsillarga qarshi mikroarray tahlil qilish". BMC Genomics. 9: 278. doi:10.1186/1471-2164-9-278. PMC 2442092. PMID 18547420.
  3. ^ Kamath RS, Freyzer AG, Dong Y va boshq. (2003 yil yanvar). "RNAi yordamida Caenorhabditis elegans genomining tizimli funktsional tahlili". Tabiat. 421 (6920): 231–7. doi:10.1038 / nature01278. hdl:10261/63159. PMID 12529635.
  4. ^ Ploner A; Ploner C; Lukasser M; Niederegger H; Hüttenhofer A (oktyabr 2009). "Kichik kodlamaydigan RNKlarni urib tushirishda uslubiy to'siqlar". RNK. 15 (10): 1797–804. doi:10.1261 / rna.1740009. PMC 2743047. PMID 19690100.
  5. ^ Li T; U H; Vang Y; Zheng H; Skogerbø G; Chen R (2008). "Caenorhabditis elegans kodlamaydigan RNK promotorlari motiflarini in vivo jonli tahlil qilish". BMC mol. Biol. 9: 71. doi:10.1186/1471-2199-9-71. PMC 2527325. PMID 18680611.
  6. ^ a b v Boria I, Gruber AR, Tanzer A va boshq. (2010 yil aprel). "Nematode sbRNAs: umurtqali Y RNKlarining gomologlari". J. Mol. Evol. 70 (4): 346–58. doi:10.1007 / s00239-010-9332-4. PMID 20349053.
  7. ^ Perreault J; Perreault JP; Boire G (2007 yil avgust). "Metazoanlardagi Ro-bog'liq Y RNKlari: evolyutsiyasi va diversifikatsiyasi". Mol. Biol. Evol. 24 (8): 1678–89. doi:10.1093 / molbev / msm084. PMID 17470436. Olingan 2010-08-03.
  8. ^ Stein AJ; Fuchs G; Fu C; Wolin SL; Reinisch KM (2005 yil may). "RNK sifatini nazorat qilish bo'yicha tarkibiy tushunchalar: Ro autoantigen noto'g'ri katlanmış RNKlarni markaziy bo'shliq orqali bog'laydi". Hujayra. 121 (4): 529–39. doi:10.1016 / j.cell.2005.03.009. PMC 1769319. PMID 15907467.
  9. ^ Xristov CP; Gardiner TJ; Szyts D; Krude T (2006 yil sentyabr). "Odamning xromosoma DNK replikatsiyasi uchun kodlamaydigan Y RNKlarining funktsional ehtiyoji". Mol. Hujayra. Biol. 26 (18): 6993–7004. doi:10.1128 / MCB.01060-06. PMC 1592862. PMID 16943439.

Qo'shimcha o'qish