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EIN Sequenzmotiv ist ein bestimmter Teil von a Nukleinsäure (DNA oder RNA) oder von a Protein, das an verschiedenen Stellen (DNA) oder auf verschiedenen Molekülen (RNA und Protein) zurückkehrt und eine biologische Wirkung hat. Es gibt oft eine gewisse Variation in der Reihenfolge vor dem. In diesen Fällen ist es sinnvoll, Konsensussequenz die die Reihenfolge weniger stark definiert und an bestimmten Stellen Alternativen zulässt.

Ein Sequenzmotiv unterscheidet sich von a Texturmotiv, die eine dreidimensionale Struktur hat.

Beispiel

DNA-Motiv

Ein Beispiel für ein DNA-Motiv ist das κB-Motiv, das eine Konsensussequenz mit der folgenden Struktur aufweist:

5'-GGGRNNYYCC-3'

Die DNA wird hier vom 5'- zum 3'-Ende gezeigt, wobei G Für ein Guaninnukleotid, R Für ein Purinnukleotid, Ja Für ein Pyrimidinnukleotid, C Für ein Cytosinnukleotid, und Nein steht für ein beliebiges Nukleotid.

Das κB-Motiv kommt in der regulatorischen Region zahlreicher Gene und wird von der TranskriptionsfaktorNF-κB (Nuklearfaktor 'Kappa-Light-Chain-Enhancer' oder aktivierte B-Zellen). Die Bindung des κB-Motivs an das Gen beschleunigt die Transkription.