WikiDer > T4 holin
The T4 Holin oilasi (TC № 1.E.8) - bu yettita holin superfamilasining biriga kirmaydigan, teshik hosil qiluvchi oqsillar guruhi. T-juftlik fagi, masalan T4, xost uchun holin-endolizin tizimidan foydalanadi hujayra lizisi. Endolizin bo'lsa ham fag E geni (Lizozim E) tomonidan kodlangan T4 1961 yilda aniqlandi, holin (t genining mahsuloti va T-holin deb ataladi) 2001 yilgacha xarakterlanmagan.[1] T4 holinlar oilasiga mansub oqsillarning vakillik ro'yxati Transporter tasnifi ma'lumotlar bazasi.[2]
Tuzilishi
T4 holin juda katta, uzunligi 218 aminoatsil qoldig'i (aas). Oqsil yuqori darajada hidrofil bo'lib, uning uzunligi bo'ylab taqsimlangan 49 kislotali va asosiy qoldiqlar va uning yonida bitta taxminiy transmembran segmenti (TMS) mavjud. N-terminalitarkibida oqsilning katta qismini qoldiradi periplazma.[3]
Funktsiya
Katta periplazmik domen vaqtni aniqlash mexanizmida asosiy determinant bo'lib, lizis inhibisyonida (LIN) ishtirok etadi.[4] LIN tarkibiga T4 ning antiolin rI oqsili kiradi (Qarang TC № 1.E.8.1.1).[5] Liziz inhibisyonu, fag zarralarining pishishi bilan liziz vaqtini muvofiqlashtirish va boshqa fajlarni chiqarib tashlash uchun samarali strategiyadir.[6] T4 xolinning C-terminal periplazmik sohasi, holin singari, membranani bir marta bosib o'tadigan T4 antiholin (RI; 97 aas) ning periplazmik domenini bog'laydi.[3] T4 fagining T-holinasi RI inhibitori bilan 1: 1 kompleksini hosil qiladi, bu esa agregatsiya va g'ovak shakllanishiga to'sqinlik qiladi.[7]
Gomologiya
T4 T-holin fagi (lizis oqsili) bilan bir xil Xolin F3 dan K3 va ARI fajidan deyarli bir xil. 35-96 qoldiqlari K ning 436-495 qoldiqlari bilan 28% ga teng+ oqsillarni qabul qilish Lactococcus lactis (gbAAK04721; TC № 2.A.72; Holin va transportyor o'rtasidagi evolyutsion munosabatni taklif qiladigan KUP). Holinlarda 1 dan 4 tagacha TMS va qisqa C-terminali asosiy qoldiqlarga boy bo'lgan domen.
Shuningdek qarang
Adabiyotlar
- ^ Ramanculov, E .; Young, R. (2001-04-01). "Lambda kontekstida T4 xolin fajining funktsional tahlili". Molekulyar genetika va genomika: MGG. 265 (2): 345–353. doi:10.1007 / s004380000422. ISSN 1617-4615. PMID 11361346. S2CID 40455691.
- ^ "1.E.8 T4 Holin (T4 Holin) oilasi". Transporter tasnifi ma'lumotlar bazasi. Olingan 2016-03-26.
- ^ a b Tran, Tramvay Anh T.; Struck, Duglas K.; Young, Ry (2005-10-01). "Periplazmatik domenlar t4 liziz inhibisyonunda xolin-antiholin o'zaro ta'sirini aniqlaydi". Bakteriologiya jurnali. 187 (19): 6631–6640. doi:10.1128 / JB.187.19.6631-6640.2005. ISSN 0021-9193. PMC 1251592. PMID 16166524.
- ^ Ramanculov, E .; Young, R. (2001-03-07). "T4 holinning genetik tahlili: vaqt va topologiya". Gen. 265 (1–2): 25–36. doi:10.1016 / s0378-1119 (01) 00365-1. ISSN 0378-1119. PMID 11255004.
- ^ Ramanculov, E .; Young, R. (2001-08-01). "Qadimgi o'yinchi niqobsiz: T4 rI t-o'ziga xos antiolinni kodlaydi". Molekulyar mikrobiologiya. 41 (3): 575–583. doi:10.1046 / j.1365-2958.2001.02491.x. ISSN 0950-382X. PMID 11532126. S2CID 25273199.
- ^ Miller, Erik S.; Kutter, Yelizaveta; Mosig, Jizela; Arisaka, Fumio; Kunisava, Takashi; Rüger, Volfgang (2003-03-01). "Bakteriofag T4 genomi". Mikrobiologiya va molekulyar biologiya sharhlari. 67 (1): 86-156, tarkib. doi:10.1128 / mmbr.67.1.86-156.2003. ISSN 1092-2172. PMC 150520. PMID 12626685.
- ^ Mussa, Samir H.; Kuznetsov, Vladimir; Tran, Tramvay Anh T.; Sakkettini, Jeyms S.; Young, Ry (2012-04-01). "Fag T4 lizizini inhibe qilishning proteinli determinantlari". Proteinli fan. 21 (4): 571–582. doi:10.1002 / pro.2042. ISSN 1469-896X. PMC 3375757. PMID 22389108.
Qo'shimcha o'qish
- Kataloniya MJ, Gil F, Moniz-Pereyra J, San-Xose S, Pimentel M (2013). "Bakterial lizis tizimidagi xilma-xillik: bakteriofaglar yo'l ko'rsatmoqda". FEMS Mikrobiologiya sharhlari. 37 (4): 554–571. doi:10.1111/1574-6976.12006. PMID 23043507.
- Mussa SH, Lawler JL, Young R (2014). "T4 lizisining genetik dissektsiyasi". Bakteriologiya jurnali. 196 (12): 2201–2209. doi:10.1128 / JB.01548-14. PMC 4054191. PMID 24706740.
- Saier MH, Reddy BL, Margolin V (2015). "Bakteriyalar, Eukaryotlar va Arxeyadagi xolinlar: potentsial biotexnologik va biotibbiyot qo'llanmalariga ega ko'p funktsional ksenologlar". Bakteriologiya jurnali. 197 (1): 7–17. doi:10.1128 / JB.02046-14. PMC 4288690. PMID 25157079.
- Tran TA, Struck DK, Young R (2005). "Periplazmik domenlar T4 lizisini inhibe qilishda holin-antiolin ta'sirini aniqlaydi". Bakteriologiya jurnali. 187 (19): 6631–6640. doi:10.1128 / JB.187.19.6631-6640.2005. PMC 1251592. PMID 16166524.
- Tran TA, Struck DK, Young R (2007). "T4 RI antiolinida DegP tomonidan degradatsiyaga qaratilgan N-terminal signal langarini chiqarish domeni mavjud". Bakteriologiya jurnali. 189 (21): 7618–7625. doi:10.1128 / JB.00854-07. PMC 2168732. PMID 17693511.
- Vang I, Smit DL, Young R (2000). "Holinlar: Bakteriofag infektsiyasining oqsil soatlari". Mikrobiologiyaning yillik sharhi. 54 (1): 799–825. doi:10.1146 / annurev.micro.54.1.799. PMID 11018145.
Sifatida ushbu tahrir, ushbu maqola tarkibidagi tarkibni ishlatadi "1.E.8 T4 Holin (T4 Holin) oilasi", ostida litsenziyalangan holda qayta foydalanishga ruxsat beradigan tarzda litsenziyalangan Creative Commons Attribution-ShareAlike 3.0 Import qilinmagan litsenziyasi, lekin ostida emas GFDL. Barcha tegishli shartlarga rioya qilish kerak.