WikiDer > TNFAIP3

TNFAIP3
TNFAIP3
Protein TNFAIP3 PDB 2EQE.png
Mavjud tuzilmalar
PDBOrtholog qidiruvi: PDBe RCSB
Identifikatorlar
TaxalluslarTNFAIP3, A20, OTUD7C, TNFA1P2, AISBL, TNF alfa ta'sirida oqsil 3
Tashqi identifikatorlarOMIM: 191163 MGI: 1196377 HomoloGene: 4582 Generkartalar: TNFAIP3
Gen joylashuvi (odam)
Xromosoma 6 (odam)
Chr.Xromosoma 6 (odam)[1]
Xromosoma 6 (odam)
TNFAIP3 uchun genomik joylashuv
TNFAIP3 uchun genomik joylashuv
Band6q23.3Boshlang137,867,214 bp[1]
Oxiri137,883,312 bp[1]
RNK ekspressioni naqsh
Ps.Bng da PBB GE TNFAIP3 202644 s

Ps.Bng da PBB GE TNFAIP3 202643 s
Qo'shimcha ma'lumotni ifodalash ma'lumotlari
Ortologlar
TurlarInsonSichqoncha
Entrez

7128

21929

Ansambl

ENSG00000118503

ENSMUSG00000019850

UniProt

P21580

Q60769

RefSeq (mRNA)

NM_001270507
NM_001270508
NM_006290

NM_001166402
NM_009397

RefSeq (oqsil)

NP_001257436
NP_001257437
NP_006281

NP_001159874
NP_033423

Joylashuv (UCSC)Chr 6: 137.87 - 137.88 MbChr 10: 19 - 19.02 Mb
PubMed qidirmoq[3][4]
Vikidata
Insonni ko'rish / tahrirlashSichqonchani ko'rish / tahrirlash

Shish nekrozi faktor, alfa ta'sirida oqsil 3 yoki A20 a oqsil odamlarda kodlanganligi TNFAIP3 gen.[5][6]

Ushbu gen gen sifatida aniqlandi, uning ekspressioni o'simta nekrozi faktori (TNF) tomonidan tezkor ravishda indüklenir. Ushbu gen tomonidan kodlangan oqsil a sink barmoq oqsili va a deubikuitinatsiya qiluvchi fermentva inhibisyoni ko'rsatilgan NF-kappa B aktivlashtirish, shuningdek TNF vositachiligida apoptoz. A20 oqsili qadimiy va oqsildir gomolog sifatida topishingiz mumkin cnidaria (mercanlar, meduza, anemonlar) saqlangan bilan protein domeni tarkibi. [7] TNFAIP3 va uning transkripsiyali repressorining nokautli sichqoncha modellaridan foydalanish (ya'ni. KCHIP3), TNFAIP3 endotoksin va TNF tomonidan indikatsiyalangan NF-kappa B reaktsiyalarini to'xtatish orqali yallig'lanishni cheklash uchun juda muhimdir.[8][9] Qisqacha aytganda, TNFAIP3 ning deubikuitinaza funktsiyasi uvitkitin zanjirlarini olib tashlash uchun ko'rsatildi VE-kaderin endoteliyada VE-kaderin yo'qolishini oldini olish birikmalarga yopishadi. [8]

O'zaro aloqalar

TNFAIP3 ko'rsatildi o'zaro ta'sir qilish bilan TNIP1,[10] TRAF1,[11][12] TRAF2,[11] IKBKG,[13] TAX1BP1,[14] YWHAB,[15] YWHAZ,[15][16] TRAF6[12][17] va Xudo.[15][16]

Romatoid artrit bilan bog'liqlik

TNFAIP3 lokusi ijobiy bog'liq omil sifatida qaraladi romatoid artrit (RA). RS5029937 (T) va rs6920220 (A) SNPlar RA xavfini mos ravishda 20 dan 40% gacha oshirish.[18] Uchinchi SNP, rs10499194 (T) romatoid artritda kam uchraydi, ammo bu salbiy assotsiatsiya statistik jihatdan ahamiyatli bo'lmasligi mumkin.

Boshqa kasalliklar

Infantil boshlangan ichakning yuqumsiz yallig'lanish kasalligi bilan bog'liqlik haqida ham xabar berilgan.[19]

Shuningdek qarang

Adabiyotlar

  1. ^ a b v GRCh38: Ensembl relizi 89: ENSG00000118503 - Ansambl, 2017 yil may
  2. ^ a b v GRCm38: Ensembl relizi 89: ENSMUSG00000019850 - Ansambl, 2017 yil may
  3. ^ "Human PubMed ma'lumotnomasi:". Milliy Biotexnologiya Axborot Markazi, AQSh Milliy Tibbiyot Kutubxonasi.
  4. ^ "Sichqoncha PubMed ma'lumotnomasi:". Milliy Biotexnologiya Axborot Markazi, AQSh Milliy Tibbiyot Kutubxonasi.
  5. ^ Opipari AW Jr; Boguski MS; Dixit VM (1990 yil oktyabr). "O'sma nekrozi alfa tomonidan qo'zg'atilgan A20 cDNA sink barmoq oqsilining yangi turini kodlaydi". J Biol Chem. 265 (25): 14705–8. PMID 2118515.
  6. ^ "Entrez Gen: TNFAIP3 o'sma nekrozi faktori, alfa ta'sirida oqsil 3".
  7. ^ Staal J, Driege Y, Haegman M, Borghi A, Hulpiau P, Lievens L va boshq. (2018). "CARD-coiled coil / Bcl10 / MALT1-ga o'xshash Parakaspaza signalizatsiya majmuasining qadimiy kelib chiqishi noma'lum muhim funktsiyalarni ko'rsatadi". Immunologiya chegaralari. 9: 1136. doi:10.3389 / fimmu.2018.01136. PMC 5978004. PMID 29881386.
  8. ^ a b Soni D, Vang DM, Regmi SC, Mittal M, Vogel SM, Schlüter D, Tiruppati C (may 2018). "A20 ning deubikuitinaza funktsiyasi o'pka tomirlari shikastlangandan so'ng endotelial to'siqni saqlaydi va tiklaydi". Hujayra o'limining kashf etilishi. 4 (60). doi:10.1038 / s41420-018-0056-3. PMC 5955943. PMID 29796309.
  9. ^ Tiruppati C, Soni D, Vang DM va boshq. (2014 yil mart). "DREAM transkripsiyasi omili A20ni bosib, yallig'lanish vositachiligiga olib keladi". Nat Immunol. 15 (3): 239–247. doi:10.1038 / ni.2823. PMC 4005385. PMID 24487321.
  10. ^ Xeynink, K; De Valck D; Vanden Berge V; Van Kriking V; Contreras R; Fiers W; Xegeman G; Beyaert R (iyun 1999). "A20 sink barmoq oqsili RIP yoki TRAF2 vositachiligidagi transaktivatsiya signaliga aralashish orqali TNF tomonidan indikatsiyalangan NF-kappaBga bog'liq gen ekspressionini inhibe qiladi va to'g'ridan-to'g'ri yangi NF-kappaB inhibitori oqsil ABIN bilan bog'lanadi". J. Hujayra Biol. QO'SHMA SHTATLAR. 145 (7): 1471–82. doi:10.1083 / jcb.145.7.1471. ISSN 0021-9525. PMC 2133159. PMID 10385526.
  11. ^ a b Qo'shiq, H Y; Rothe M; Goeddel D V (iyun 1996). "O'simta nekroz omiliga bog'liq bo'lgan sink barmoq oqsil A20 TRAF1 / TRAF2 bilan o'zaro ta'sir qiladi va NF-kappaB aktivatsiyasini inhibe qiladi". Proc. Natl. Akad. Ilmiy ish. AQSH. QO'SHMA SHTATLAR. 93 (13): 6721–5. Bibcode:1996 yil PNAS ... 93.6721S. doi:10.1073 / pnas.93.13.6721. ISSN 0027-8424. PMC 39093. PMID 8692885.
  12. ^ a b Xeynink, K; Beyaert R (1999 yil yanvar). "Sitokin bilan bog'langan sink barmoq oqsil A20, TRAF6 darajasida IL-1 induktsiyalangan NF-kappaB aktivatsiyasini inhibe qiladi". FEBS Lett. HOLLANDIYA. 442 (2–3): 147–50. doi:10.1016 / S0014-5793 (98) 01645-7. ISSN 0014-5793. PMID 9928991. S2CID 19072203.
  13. ^ Chjan, S Q; Kovalenko A; Cantarella G; Wallach D (2000 yil mart). "IKK signalosomasini p55 TNF retseptoriga jalb qilish: RIP va A20 retseptorlarini stimulyatsiya qilishda NEMO (IKKgamma) bilan bog'lanadi". Immunitet. QO'SHMA SHTATLAR. 12 (3): 301–11. doi:10.1016 / S1074-7613 (00) 80183-1. ISSN 1074-7613. PMID 10755617.
  14. ^ De Valk, D; Jin D Y; Xayninck K; Van de Kreyen M; Contreras R; Fiers W; Jeang K T; Beyaert R (1999 yil iyul). "A20 sink barmog'i oqsili o'ziga xos kaspazlar bilan ajralib turadigan yangi anti-apoptotik oqsil bilan o'zaro ta'sir qiladi". Onkogen. ENGLIYA. 18 (29): 4182–90. doi:10.1038 / sj.onc.1202787. ISSN 0950-9232. PMID 10435631.
  15. ^ a b v Vinsenz, S; Dixit V M (1996 yil avgust). "14-3-3 oqsillar A20 bilan izoformaga xos tarzda bog'lanib, shaperon va adapter molekulalari sifatida ishlaydi". J. Biol. Kimyoviy. QO'SHMA SHTATLAR. 271 (33): 20029–34. doi:10.1074 / jbc.271.33.20029. ISSN 0021-9258. PMID 8702721.
  16. ^ a b De Valk, D; Xayninck K; Van Kriking V; Vandenabeele P; Fiers W; Beyaert R (sentyabr 1997). "A20 14-3-3 oqsillar bilan bog'lanishdan mustaqil ravishda NF-kappaB aktivatsiyasini inhibe qiladi". Biokimyo. Biofiz. Res. Kommunal. QO'SHMA SHTATLAR. 238 (2): 590–4. doi:10.1006 / bbrc.1997.7343. ISSN 0006-291X. PMID 9299557.
  17. ^ Evans, P C; Teylor E R; Coadwell J; Xayninck K; Beyaert R; Kilshaw P J (avgust 2001). "A20 ga o'xshash ikkita yangi proteinni ajratish va tavsifi". Biokimyo. J. Angliya. 357 (Pt 3): 617-23. doi:10.1042/0264-6021:3570617. ISSN 0264-6021. PMC 1221992. PMID 11463333.
  18. ^ Stahl EA, Raychaudhuri S, Remmers EF va boshq. (Iyun 2010). "Genom-assotsiatsiyani o'rganish meta-tahlilida ettita yangi romatoid artrit xavfi aniqlandi". Nat. Genet. 42 (6): 508–14. doi:10.1038 / ng.582. PMC 4243840. PMID 20453842.
  19. ^ Zheng C, Huang Y, Ye Z, Vang Y, Tang Z, Lu J, Vu J, Chjou Y, Vang L, Xuang Z, Yang H, Xue A (2018) Yangi heterozigotli mutatsiyalar tufayli infantil boshlangan yuqumsiz ichak kasalligi. TNFAIP3 (A20). Yallig'lanish ichak Dis doi: 10.1093 / ibd / izy165

Qo'shimcha o'qish

Tashqi havolalar

  • Da mavjud bo'lgan barcha tarkibiy ma'lumotlarga umumiy nuqtai PDB uchun UniProt: P21580 (O'sma nekrozi faktori alfa bilan bog'liq protein 3) da PDBe-KB.