WikiDer > Transkripsiya xotirasi

Transcriptional memory
Transkripsiya xotirasi printsipi. Induktorning zarbasi (priming) maqsadli genlarning ekspressioniga olib keladi, bu esa olib tashlanganidan keyin pasayadi. Induktsiya bo'lmagan oynada (xotira oynasi), ba'zi genlar tinchlangan, ammo transkripsiyasi bo'yicha jim holatini saqlab qolishadi, bu esa ikkinchi chaqiriqda genning faollashishiga olib keladi.

Transkripsiya xotirasi dastlab xamirturushda topilgan biologik hodisa[1], bu vaqt davomida ma'lum bir ishora bilan ishlangan hujayralar, keyinchalik qayta stimulyatsiya qilinganidan keyin gen ekspresyoni darajasi oshganligini ko'rsatadi. Ushbu hodisa sodir bo'lganligi ko'rsatildi: galaktozada o'sish paytida xamirturushda[1][2] va inositol ochligi[3]; ekologik stress paytida o'simliklar[4][5][6]; davomida sutemizuvchilar hujayralarida LPS[7] va interferon[8][9][10] induksiya. Oldingi ishlar shuni ko'rsatdiki, kromatin tezroq qayta induktsiyalashga imkon beradigan tayyor transkripsiya holatiga hissa qo'shishi mumkin. Bunga quyidagilar kiradi: o'ziga xos transkripsiya omillarining faolligi[11][12][13], saqlash RNK polimeraza II tayyor genlarni targ'ibotchilarida[9], faoliyati xromatinni qayta qurish komplekslar[2], H3K4me2 ning ko'payishi[8][13] va H3K36me3[10] giston modifikatsiyalari, H3.3 bandligi histon varianti[10], shuningdek majburiy yadroviy teshik komponentlar[9][14]. Bundan tashqari, mahalliy aloqada kohesin davomida inson hujayralarida transkripsiyaviy xotiraning o'rnatilishini inhibe qilishi ko'rsatilgan interferon gamma stimulyatsiya[15].

Adabiyotlar

  1. ^ a b Acar, Murat; Beksi, Attila; van Oudenaarden, Aleksandr (2005-05-12). "Stoxastik o'tishni kamaytirish orqali uyali xotirani kuchaytirish". Tabiat. 435 (7039): 228–232. Bibcode:2005 yil Nat. 435..228A. doi:10.1038 / nature03524. ISSN 1476-4687. PMID 15889097. S2CID 4429383.
  2. ^ a b Kundu, Sharmistha; Shox, Piter J.; Peterson, Kreyg L. (2007-04-15). "SWI / SNF xamirturushli GAL gen klasterida transkripsiyali xotira uchun talab qilinadi". Genlar va rivojlanish. 21 (8): 997–1004. doi:10.1101 / gad.1506607. ISSN 0890-9369. PMC 1847716. PMID 17438002.
  3. ^ Brickner, Donna Garvey; Kajigas, Ivelisse; Fondufe-Mittendorf, Yvonne; Ahmed, Sara; Li, Pei-Chih; Vidom, Jonatan; Brickner, Jeyson H (2007 yil aprel). "H2A.Z vositachiligida yadro atrofidagi genlarni lokalizatsiyasi oldingi transkripsiya holatining epigenetik xotirasini beradi". PLOS biologiyasi. 5 (4): e81. doi:10.1371 / journal.pbio.0050081. ISSN 1544-9173. PMC 1828143. PMID 17373856.
  4. ^ Ding, Yong; Fromm, Maykl; Avramova, Zoya (2012 yil yanvar). "Arabidopsisda qurg'oqchilikning" poezd "transkripsiyaviy javoblariga ko'plab ta'sirlar". Tabiat aloqalari. 3 (1): 740. Bibcode:2012 yil NatCo ... 3..740D. doi:10.1038 / ncomms1732. ISSN 2041-1723. PMID 22415831.
  5. ^ Ding, Yong; Liu, Ning; Virlovet, Laetitiya; Ritxoven, Jan-Jek; Fromm, Maykl; Avramova, Zoya (2013). "Arabidopsis talianada dehidratatsiya stressining to'rt xil o'ziga xos geni". BMC o'simlik biologiyasi. 13 (1): 229. doi:10.1186/1471-2229-13-229. ISSN 1471-2229. PMC 3879431. PMID 24377444.
  6. ^ Sani, Emanuela; Hertsik, Pavel; Perrella, Jorjio; Kolot, Vinsent; Amtmann, Anna (2013 yil iyun). "Arabidopsis ko'chatlarining giperosmotik astarlanishi epigenomning o'ziga xos o'zgarishlari bilan birga uzoq muddatli somatik xotirani o'rnatadi". Genom biologiyasi. 14 (6): R59. doi:10.1186 / gb-2013-14-6-r59. ISSN 1474-760X. PMC 3707022. PMID 23767915.
  7. ^ Foster, Simmi L.; Xargrivz, Diana S.; Medjitov, Ruslan (2007-05-30). "TLR tomonidan indikatsiya qilingan xromatin modifikatsiyalari orqali yallig'lanishning genlarga xos nazorati". Tabiat. 447 (7147): 972–978. Bibcode:2007 yil natur.447..972F. doi:10.1038 / nature05836. ISSN 0028-0836. PMID 17538624. S2CID 4426398.
  8. ^ a b Gialitakis, M .; Arampatzi, P .; Makatounakis, T .; Papamatheakis, J. (2010-04-15). "Gen lokusini PML yadro jismlariga ko'chirish orqali gamma interferonga bog'liq transkripsiyaviy xotira". Molekulyar va uyali biologiya. 30 (8): 2046–2056. doi:10.1128 / MCB.00906-09. ISSN 0270-7306. PMC 2849471. PMID 20123968.
  9. ^ a b v Nur, Uilyam H.; Freani, Jonatan; Sood, Varun; Tompson, Abbey; D'Urso, Agustina; Horvat, Kurt M.; Brickner, Jeyson H. (2013-03-26). Misteli, Tom (tahr.) "Xromatin tuzilishini o'zgartirish va epigenetik transkripsiya xotirasini rivojlantirishda inson Nup98 uchun saqlanib qolgan rol". PLOS biologiyasi. 11 (3): e1001524. doi:10.1371 / journal.pbio.1001524. ISSN 1545-7885. PMC 3608542. PMID 23555195.
  10. ^ a b v Kamada, Rui; Yang, Venjing; Chjan, Yubo; Patel, Mira S.; Yang, Yanqin; Ouda, Ryota; Dey, Anup; Vakabayashi, Yoshiyuki; Sakaguchi, Kazuyasu (2018-09-10). "Interferon stimulyatsiyasi xromatin izlarini hosil qiladi va transkripsiyaviy xotirani o'rnatadi". Milliy fanlar akademiyasi materiallari. 115 (39): E9162-E9171. doi:10.1073 / pnas.1720930115. ISSN 0027-8424. PMC 6166839. PMID 30201712.
  11. ^ D'Urso, Agustina; Takaxashi, Yoh-Xey; Xiong, Bin; Marone, Jessica; Coukos, Robert; Randis-Xinchliff, Karlo; Vang, Ji-Ping; Shilatifard, Ali; Brickner, Jeyson H. (2016 yil 23-iyun). "Set1 / COMPASS va Mediator epigenetik transkripsiya xotirasini rivojlantirishga qaratilgan". eLife. 5. doi:10.7554 / eLife.16691. ISSN 2050-084X. PMC 4951200. PMID 27336723.
  12. ^ Sood, Varun; Kajigas, Ivelisse; D'Urso, Agustina; Nur, Uilyam H.; Brickner, Jeyson H. (2017 yil avgust). "GAL genlarining epigenetik transkripsiyaviy xotirasi glyukozaning o'sishiga va Saccharomyces cerevisiae ning Tup1 transkripsiyasi omiliga bog'liq". Genetika. 206 (4): 1895–1907. doi:10.1534 / genetika.117.201632. ISSN 1943-2631. PMC 5560796. PMID 28607146.
  13. ^ a b Lämke, Yorn; Bjezinka, Kshishtof; Altmann, Simone; Bäurle, Isabel (2016-01-18). "Issiqlik urishi bilan ishlaydigan zarba omili barqaror histon metilasyonu va transkripsiyaviy stress xotirasini boshqaradi". EMBO jurnali. 35 (2): 162–175. doi:10.15252 / embj.201592593. ISSN 1460-2075. PMC 4718455. PMID 26657708.
  14. ^ Paskal-Garsiya, Pau; Debo, Brayan; Aleman, Jennifer R.; Talamas, Jessika A .; Lan, Yemin; Nguyen, Nha X.; Von, Kyoung J .; Mayya, Capelson (2017-04-06). "Metazoan yadroviy teshiklari puxta genlar uchun iskala yaratadi va kuchaytiruvchi-targ'ibotchilar bilan aloqada vositachilik qiladi". Molekulyar hujayra. 66 (1): 63-76.e6. doi:10.1016 / j.molcel.2017.02.020. ISSN 1097-4164. PMC 7439321. PMID 28366641.
  15. ^ Siwek, Voytsex; Tehroniy, Sahar S.H .; Mata, Joao F.; Jansen, Lars E.T. (Noyabr 2020). "Klasterli IFNγ maqsadli genlarini faollashtirish kohezin bilan boshqariladigan transkripsiya xotirasini boshqaradi". Molekulyar hujayra. 80 (3): 396-409.e6. doi:10.1016 / j.molcel.2020.10.005. ISSN 1097-2765. PMID 33108759. S2CID 225100808.