WikiDer > Xanthomonas sRNA
Molekulyar biologiyada, Xanthomonas sRNK bor kichik RNKlar ning turli turlarida aniqlangan bakteriya Xanthomonas.
Tahlili o'simlik patogen Xanthomonas campestris pv. vesikatoriya etti sis kodlangan ifodasini aniqladi antisens RNKlar (asX1-asX7) va 15 intergenik sRNAlar (sX1 - sX15). Shuningdek, bir nechta sRNKlar aniqlangan Xanthomonas campestris pathovar campestris. Ulardan ba'zilari X. kamestris sRNKlar faqat Xanthomonas, ba'zilari boshqa bakteriyalarda ham namoyon bo'ladi.[1][2] Ushbu sRNKlarning bir nechtasi o'z hissasini qo'shgan ko'rinadi zaharlanish, shu jumladan sX12, sX13 va sRNA-Xcc1.[1][3][4]
Hisoblash tahlili 63 sRNK ni taxmin qiladi Xanthomonas oryzae pathovar oryzae, shulardan 8tasining ifodasi eksperimental tarzda tasdiqlangan. Ulardan uchtasining ifodasi Hfq- mustaqil.[5]
Shuningdek qarang
- Bacillus subtilis BSR sRNKlari
- Bakterial kichik RNK
- Escherichia coli sRNK
- Tuberkulyoz mikobakteriyasi sRNK
- Pseudomonas sRNK
Adabiyotlar
- ^ a b Schmidtke C, Findeiß S, Sharma CM, Kuhfuß J, Hoffmann S, Vogel J va boshq. (2011). "Ksantomonas o'simlik patogenini genom bo'yicha transkriptomik tahlillari taxminiy virulentlik funktsiyalari bilan sRNKlarni aniqlaydi". Nuklein kislotalari rez. 40 (5): 2020–31. doi:10.1093 / nar / gkr904. PMC 3300014. PMID 22080557.
- ^ Jiang RP, Tang DJ, Chen XL, He YQ, Feng JX, Jiang BL va boshq. (2010). "Xanthomonas campestris pathovar campestris-dan to'rtta yangi kodlamaydigan kichik RNKlarni aniqlash". BMC Genomics. 11: 316. doi:10.1186/1471-2164-11-316. PMC 2996969. PMID 20482898.
- ^ Chen XL, Tang DJ, Jiang RP, He YQ, Jiang BL, Lu GT va boshq. (2011). "sRNA-Xcc1, butun elektron bilan kodlangan transpozon va plazmid bilan o'tkazilgan trans-ta'sir qiluvchi sRNK, Xanthomonas campestris pathovar campestris ning asosiy virulentlik regulyatorlari HrpG va HrpX ning ijobiy nazorati ostida". RNK Biol. 8 (6): 947–953. doi:10.4161 / rna.8.6.16690. PMC 3256417. PMID 21941121.
- ^ Shmidtke, C; Abendrot, U; Brok, J; Serraniya, J; Beker, A; Bonas, U (sentyabr 2013). "Kichik RNK sX13: o'simlik patogen Ksantomonalardagi viruslanishning ko'p qirrali regulyatori". PLOS patogenlari. 9 (9): e1003626. doi:10.1371 / journal.ppat.1003626. PMC 3771888. PMID 24068933.
- ^ Liang H, Zhao YT, Zhang JQ, Van XJ, Fang RX, Jia YT (2011). "Xanthomonas oryzae pathovar oryzae tarkibidagi kichik kodlamaydigan RNKlarni aniqlash va funktsional tavsifi". BMC Genomics. 12: 87. doi:10.1186/1471-2164-12-87. PMC 3039613. PMID 21276262.