WikiDer > Yass (dasturiy ta'minot)

Yass (software)
Boshqa maqsadlar uchun qarang Yass.
YASS
Barqaror chiqish
1.14
Ombor
Buni Vikidatada tahrirlash
Operatsion tizimLinux, Mac, MS-Windows
TuriBioinformatika vosita
LitsenziyaGPLv2 CeCILL
Veb-saythttps://bioinfo.cristal.univ-lille.fr/yass/

YASS[1][2] a bepul dasturiy ta'minot,[3] juftlik bilan ketma-ketlikni moslashtirish dasturi uchun nukleotid ketma-ketliklar, ya'ni o'xshashliklarni qidirishi mumkin DNK yoki RNK ketma-ketliklar. YASS oddiy matnda yoki nukleotidlar ketma-ketligini qabul qiladi FASTA formati va chiqish formati o'z ichiga oladi Portlash jadvalli chiqish. YASS bir nechta foydalanadi o'tish davri cheklangan oraliq urug ' k-mers, bu sezgirlikni sezilarli darajada yaxshilashga imkon beradi. YASS mahalliy sifatida foydalanuvchi mashinasida yoki shunday ishlatilishi mumkin SaaS ustida YASS veb-server, bu brauzerga asoslangan ishlab chiqaradi nuqta-fitna.

Shuningdek qarang

Adabiyotlar

  1. ^ Noe L., Kucherov. G. (2005). "YASS: DNK o'xshashligini qidirish sezgirligini oshirish". Nuklein kislotalarni tadqiq qilish. 33 (2): W540-W543. doi:10.1093 / nar / gki478. PMC 1160238. PMID 15980530.
  2. ^ Noe L., Kucherov. G. (2004). "DNKning mahalliy moslashuvi uchun takomillashtirilgan mezonlar". BMC Bioinformatika. 5: 149. doi:10.1186/1471-2105-5-149. PMC 526756. PMID 15485572.
  3. ^ "README". Olingan 7 aprel 2015.

Tashqi havolalar