WikiDer > HAMP domeni

HAMP domain
XAMP
Identifikatorlar
BelgilarXAMP
PfamPF00672
InterProIPR003660
SCOP22asx / QOIDA / SUPFAM
OPM oqsili5iji
CDDCD06225

Yilda molekulyar biologiya, HAMP domeni (mavjud Histidin kinazlar, Adenilat siklazlari, Metil qabul qiluvchi oqsillar va Fosfatazalar)[1] taxminan 50-aminokislotadir alfa-spiral dimerik, to'rtburchak shakllanadigan mintaqa o'ralgan lasan.[2] U bakterial datchikda va kemotaksis oqsillar va ökaryotikda gistidin kinazlar. Bakterial oqsillar odatda integral membrana oqsillari va a qismi ikki komponentli signal uzatish yo'li. HAMP domenining bir yoki bir nechta nusxasini boshqa domenlar bilan birgalikda topish mumkin, masalan, histidin kinaz domeni, bakterial ximotaksis sezgir transduser domeni, PAS takrorlash, EAL domeni, GGDEF domeni, oqsil fosfataza 2C ga o'xshash domen, guanilat siklaza domen yoki javob tartibga soluvchi domen.[3] Eng keng tarqalgan sozlamada HAMP domeni uzatadi konformatsion o'zgarishlar periplazmada ligand bilan bog'laydigan domenlar ga sitoplazmatik signal berish kinaz va metil-akseptor domenlari va shu bilan tartibga soladi fosforillanish yoki metilatsiya homodimerik faollik retseptorlari.

Adabiyotlar

  1. ^ Aravind L, Ponting CP (1999 yil iyul). "Gistidin kinaz va metil qabul qiluvchi oqsillarning sitoplazmatik spiral bog'lovchi sohasi ko'plab prokaryotik signal beruvchi oqsillar uchun odatiy holdir". FEMS mikrobiologiya xatlari. 176 (1): 111–6. doi:10.1016 / s0378-1097 (99) 00197-4. PMID 10418137.
  2. ^ Xulko M, Berndt F, Gruber M, Linder JU, Truffault V, Shults A, Martin J, Shults JE, Lupas AN, Coles M (sentyabr 2006). "HAMP domen tuzilishi transmembran signalizatsiyasida spiral aylanishini nazarda tutadi". Hujayra. 126 (5): 929–40. doi:10.1016 / j.cell.2006.06.058. PMID 16959572. S2CID 18396561.
  3. ^ Dunin-Xorkavich S, Lupas AN (aprel 2010). "HAMP domenlarini kompleks tahlil qilish: transmembranli signallarni o'tkazishga ta'siri". Molekulyar biologiya jurnali. 397 (5): 1156–74. doi:10.1016 / j.jmb.2010.02.031. PMID 20184894.
Ushbu maqola jamoat domenidagi matnlarni o'z ichiga oladi Pfam va InterPro: IPR003660