WikiDer > PSMD10

PSMD10
PSMD10
Protein PSMD10 PDB 1qym.png
Mavjud tuzilmalar
PDBOrtholog qidiruvi: PDBe RCSB
Identifikatorlar
TaxalluslarPSMD10, dJ889N15.2, p28, p28 (GANK), proteazom 26S subbirligi, ATPase bo'lmagan 10
Tashqi identifikatorlarOMIM: 300880 MGI: 1858898 HomoloGene: 94517 Generkartalar: PSMD10
Gen joylashuvi (odam)
X xromosoma (odam)
Chr.X xromosoma (odam)[1]
X xromosoma (odam)
Genomic location for PSMD10
Genomic location for PSMD10
BandXq22.3Boshlang108,084,207 bp[1]
Oxiri108,091,549 bp[1]
RNK ekspressioni naqsh
PBB GE PSMD10 gnf1h05584 x at fs.png

PBB GE PSMD10 gnf1h05583 at fs.png

PBB GE PSMD10 219485 s at fs.png
Qo'shimcha ma'lumotni ifodalash ma'lumotlari
Ortologlar
TurlarInsonSichqoncha
Entrez

5716

53380

Ansambl

ENSG00000101843

ENSMUSG00000031429

UniProt

O75832

Q9Z2X2

RefSeq (mRNA)

NM_170750
NM_002814

NM_001164177
NM_016883

RefSeq (oqsil)

NP_002805
NP_736606

NP_001157649
NP_058579

Joylashuv (UCSC)Chr X: 108.08 - 108.09 MbChr X: 140.95 - 140.96 Mb
PubMed qidirmoq[3][4]
Vikidata
Insonni ko'rish / tahrirlashSichqonchani ko'rish / tahrirlash

26S proteazom ATPaza bo'lmagan tartibga soluvchi subunit 10 yoki gankirin bu ferment odamlarda kodlanganligi PSMD10 gen.[5] Gankyrin bu onkoprotein bu 19S ning tartibga soluvchi qopqog'ining tarkibiy qismidir proteazom. Tarkibiy jihatdan u 33-aminokislota ankirin takrorlang qatorini tashkil etadi alfa spirallari.[6] Bu tartibga solishda muhim rol o'ynaydi hujayra aylanishi orqali oqsil va oqsillarning o'zaro ta'siri bilan siklinga bog'liq kinaz CDK4. Bundan tashqari, u E3 bilan chambarchas bog'lanadi ubikuitin ligase MDM2, bu degradatsiyani tartibga soluvchi hisoblanadi p53 va retinoblastoma oqsili, ikkalasi ham transkripsiya omillari da ishtirok etish o'smani bostirish va ko'pchilikda mutatsiyaga uchragan saraton.[7] Gankyrin shuningdek piyodalarga qarshiapoptotik effekti va ma'lum turlarida haddan tashqari ifoda etiladi o'sma kabi hujayralar jigar hujayralari karsinomasi.[8]

Funktsiya

26S proteazomasi 2-kompleks, 20S yadrosi va 19S regulyatoridan tashkil topgan, juda tartibli tuzilishga ega multikatalitik proteinaz kompleksidir. 20S yadrosi bir xil bo'lmagan 28 subbirlikdan iborat 4 halqadan iborat; 2 halqa 7 alfa subbirligidan va 2 halqa 7 beta subbirlikdan iborat. 19S regulyatori tarkibida 6 ta ATPase va 2 ta ATPaza bo'lmagan bo'linmalar va 10 ta ATPaza bo'lmagan bo'linmalarni o'z ichiga olgan baza mavjud. Proteazomalar yuqori konsentratsiyali eukaryotik hujayralar bo'ylab tarqaladi va lizosomal bo'lmagan yo'lda ATP / ubikitinga bog'liq jarayonda peptidlarni ajratadi. O'zgartirilgan proteazomaning, immunoproteazomaning muhim vazifasi I sinf MHC peptidlarini qayta ishlashdir. Ushbu gen 19S regulyatorining ATPase bo'lmagan birligini kodlaydi. Turli izoformlarni kodlovchi ikkita stsenariy tasvirlangan. 3 va 20 xromosomalarda pseudogenlar aniqlangan.[9]

Klinik ahamiyati

Proteazoma va uning bo'linmalari kamida ikkita sababga ko'ra klinik ahamiyatga ega: (1) murosaga kelgan murakkab yig'ilish yoki disfunktsional proteazoma o'ziga xos kasalliklarning asosiy patofiziologiyasi bilan bog'liq bo'lishi mumkin va (2) ular terapevtik dorilarning maqsadlari sifatida ishlatilishi mumkin. aralashuvlar. Yaqinda yangi diagnostika markerlari va strategiyalarini ishlab chiqish uchun proteazomani ko'rib chiqishga ko'proq harakat qilindi. Proteazomaning patofizyologiyasini takomillashtirilgan va har tomonlama tushunish kelajakda klinik qo'llanmalarga olib kelishi kerak.

Proteazomalar uchun asosiy komponentni tashkil qiladi ubikuitin-proteazoma tizimi (UPS) [10] va shunga mos keladigan uyali oqsil sifatini boshqarish (PQC). Oqsil hamma joyda va keyingi proteoliz va proteazom tomonidan parchalanishi regulyatsiyaning muhim mexanizmidir hujayra aylanishi, hujayralar o'sishi va differentsiatsiya, gen transkripsiyasi, signal transduktsiyasi va apoptoz.[11] Keyinchalik, buzilgan proteazomali kompleks birikma va funktsiya proteolitik faollikni pasayishiga va buzilgan yoki noto'g'rilangan oqsil turlarining to'planishiga olib keladi. Bunday protein to'planishi neyrodejenerativ kasalliklarda patogenez va fenotipik xususiyatlarga yordam berishi mumkin,[12][13] yurak-qon tomir kasalliklari,[14][15][16] yallig'lanish reaktsiyalari va otoimmun kasalliklar,[17] va DNKning tizimli zararlanish reaktsiyalari xavfli kasalliklar.[18]

Bir nechta eksperimental va klinik tadqiqotlar shuni ko'rsatdiki, UPSdagi aberatsiya va regulyatsiya bir nechta neyrodejenerativ va miodegenerativ kasalliklarning patogeneziga yordam beradi, shu jumladan Altsgeymer kasalligi,[19] Parkinson kasalligi[20] va Pick kasalligi,[21] Amiotrofik lateral skleroz (ALS),[21] Xantington kasalligi,[20] Kreuzfeldt-Yakob kasalligi,[22] va motorli neyron kasalliklari, poliglutamin (PolyQ) kasalliklari, Muskul distrofiyalari[23] bilan bog'liq bo'lgan neyrodejenerativ kasalliklarning bir nechta noyob shakllari dementia.[24] Ning bir qismi sifatida ubikuitin-proteazoma tizimi (UPS), proteazoma yurak oqsilining gomeostazini saqlab turadi va shu bilan yurakda muhim rol o'ynaydi. ishemik jarohat,[25] qorincha gipertrofiyasi[26] va yurak etishmovchiligi.[27] Bundan tashqari, UPS ning malign transformatsiyada muhim rol o'ynashi haqida dalillar to'planmoqda. UPS proteolizi saraton xujayralarining saraton rivojlanishi uchun juda muhim bo'lgan ogohlantiruvchi signallarga ta'sirida katta rol o'ynaydi. Shunga ko'ra, degradatsiyaga uchragan gen ekspressioni transkripsiya omillari, kabi p53, c-jun, c-Fos, NF-DB, c-Myc, HIF-1a, MATa2, STAT3, sterol bilan boshqariladigan elementlarni bog'laydigan oqsillar va androgen retseptorlari barchasi UPS tomonidan boshqariladi va shu bilan turli xil xavfli kasalliklarning rivojlanishida ishtirok etadi.[28] Bundan tashqari, UPS o'simta supressor geni kabi mahsulotlarning degradatsiyasini tartibga soladi adenomatoz polipoziya koli (APCkolorektal saraton kasalligida, retinoblastoma (Rb). va fon Hippel-Lindau o'simtasini bostiruvchi (VHL), shuningdek bir qator proto-onkogenlar (Raf, Myc, Myb, Aloqador, Src, Mos, ABL). UPS shuningdek, yallig'lanish reaktsiyalarini boshqarishda ishtirok etadi. Ushbu faoliyat odatda proteazomalarning NF-kB faollashuvidagi roliga bog'liq bo'lib, u proinflamatuar ifodani yanada tartibga soladi. sitokinlar kabi TNF-a, IL-b, Il-8, yopishqoqlik molekulalari (ICAM-1, VCAM-1, P-tanlovi) va prostaglandinlar va azot oksidi (YO'Q).[17] Bundan tashqari, UPS leykotsitlar ko'payishini regulyatori sifatida yallig'lanish reaktsiyalarida, asosan tsiklinlarning proteolizi va degradatsiyasi orqali rol o'ynaydi. CDK inhibitörler.[29] Va nihoyat, otoimmun kasallik bilan kasallanganlar SLE, Syogren sindromi va romatoid artrit (RA) asosan klinik biomarker sifatida qo'llanilishi mumkin bo'lgan aylanma proteazomalarni namoyish etadi.[30]

O'zaro aloqalar

PSMD10 ko'rsatildi o'zaro ta'sir qilish bilan:

Adabiyotlar

  1. ^ a b v GRCh38: Ensembl relizi 89: ENSG00000101843 - Ansambl, 2017 yil may
  2. ^ a b v GRCm38: Ensembl relizi 89: ENSMUSG00000031429 - Ansambl, 2017 yil may
  3. ^ "Human PubMed ma'lumotnomasi:". Milliy Biotexnologiya Axborot Markazi, AQSh Milliy Tibbiyot Kutubxonasi.
  4. ^ "Sichqoncha PubMed ma'lumotnomasi:". Milliy Biotexnologiya Axborot Markazi, AQSh Milliy Tibbiyot Kutubxonasi.
  5. ^ Xori T, Kato S, Saeki M, DeMartino GN, Slaughter CA, Takeuchi J, Toh-e A, Tanaka K (Avgust 1998). "cSNK klonlash va p28 (Nas6p) va p40.5 (Nas7p) ning funktsional tahlili, 26S proteazomasining ikkita yangi tartibga soluvchi bo'linmasi". Gen. 216 (1): 113–22. doi:10.1016 / S0378-1119 (98) 00309-6. PMID 9714768.
  6. ^ Krzywda S, Brzozowski AM, Higashitsuji H, Fujita J, Welchman R, Dawson S, Mayer RJ, Wilkinson AJ (2004). "Gankirinning kristall tuzilishi, onkoprotein, siklinga bog'liq kinaz 4, 19 S proteazomal ATPase regulyatori va o'simta supressorlari Rb va p53 bo'lgan komplekslarda mavjud". Biologik kimyo jurnali. 279 (2): 1541–5. doi:10.1074 / jbc.M310265200. PMID 14573599.
  7. ^ Krzywda S, Brzozowski AM, Al-Safty R, Welchman R, Mee M, Dawson S, Fujita J, Higashitsuji H, Mayer RJ, Wilkinson AJ (2003). "26S proteazomasining 19S regulyatorining CDK4 va S6b (rpt3) ATPaza bilan o'zaro ta'sir qiluvchi onkoprotein - gankirinning kristalizatsiyasi". Acta Crystallographica bo'limi D. 59 (Pt 7): 1294-5. doi:10.1107 / S0907444903009892. PMID 12832791.
  8. ^ Higashitsuji H, Liu Y, Mayer RJ, Fujita J (2005). "Onkoprotein gankirin proteazomal degradatsiyani kuchaytirish orqali p53 va RB ni ham salbiy tartibga soladi". Hujayra aylanishi. 4 (10): 1335–7. doi:10.4161 / cc.4.10.2107. PMID 16177571.
  9. ^ "Entrez Gen: PSMD10 proteazom (prosome, makropain) 26S subunit, ATPase bo'lmagan, 10".
  10. ^ Kleiger G, Mayor T (iyun 2014). "Xavfli sayohat: hamma joyda protein-proteazom tizimiga sayohat". Hujayra biologiyasining tendentsiyalari. 24 (6): 352–9. doi:10.1016 / j.tcb.2013.12.003. PMC 4037451. PMID 24457024.
  11. ^ Goldberg AL, Stein R, Adams J (avgust 1995). "Proteazomalar faoliyati to'g'risida yangi tushunchalar: arxebakteriyalardan dori ishlab chiqarishga qadar". Kimyo va biologiya. 2 (8): 503–8. doi:10.1016/1074-5521(95)90182-5. PMID 9383453.
  12. ^ Sulistio YA, Xiz K (Yanvar 2015). "Albgeymer kasalligidagi Ubikuitin - Proteazom tizimi va molekulyar shaperonning regulyatsiyasi". Molekulyar neyrobiologiya. 53 (2): 905–31. doi:10.1007 / s12035-014-9063-4. PMID 25561438. S2CID 14103185.
  13. ^ Ortega Z, Lukas JJ (2014). "Ubiquitin-proteazom tizimining Xantington kasalligi bilan bog'liqligi". Molekulyar nevrologiya chegaralari. 7: 77. doi:10.3389 / fnmol.2014.00077. PMC 4179678. PMID 25324717.
  14. ^ Sandri M, Robbins J (iyun 2014). "Proteotoksiklik: yurak kasalliklarida baholanmagan patologiya". Molekulyar va uyali kardiologiya jurnali. 71: 3–10. doi:10.1016 / j.yjmcc.2013.12.015. PMC 4011959. PMID 24380730.
  15. ^ Drews O, Taegtmeyer H (Dekabr 2014). "Yurak kasalligida ubikuitin-proteazom tizimiga yo'naltirish: yangi terapevtik strategiyalarning asosi". Antioksidantlar va oksidlanish-qaytarilish signalizatsiyasi. 21 (17): 2322–43. doi:10.1089 / ars.2013.5823. PMC 4241867. PMID 25133688.
  16. ^ Vang ZV, Hill JA (2015 yil fevral). "Proteinlar sifatini nazorat qilish va metabolizm: yurakdagi ikki tomonlama nazorat". Hujayra metabolizmi. 21 (2): 215–26. doi:10.1016 / j.cmet.2015.01.016. PMC 4317573. PMID 25651176.
  17. ^ a b Karin M, Delhase M (Fevral 2000). "I kappa B kinaz (IKK) va NF-kappa B: proinflamatuar signalizatsiyaning asosiy elementlari". Immunologiya bo'yicha seminarlar. 12 (1): 85–98. doi:10.1006 / smim.2000.0210. PMID 10723801.
  18. ^ Ermolaeva MA, Daxovnik A, Shumaxer B (sentyabr 2015). "DNKning hujayrali va tizimli zararlanish ta'sirida sifatni boshqarish mexanizmlari". Qarish bo'yicha tadqiqotlar. 23 (Pt A): 3-11. doi:10.1016 / j.arr.2014.12.009. PMC 4886828. PMID 25560147.
  19. ^ Checler F, da Kosta KA, Ancolio K, Chevallier N, Lopez-Peres E, Marambaud P (Iyul 2000). "Altsgeymer kasalligida proteazomaning roli". Biochimica et Biofhysica Acta (BBA) - Kasallikning molekulyar asoslari. 1502 (1): 133–8. doi:10.1016 / s0925-4439 (00) 00039-9. PMID 10899438.
  20. ^ a b Chung KK, Dawson VL, Dawson TM (noyabr 2001). "Parkinson kasalligi va boshqa neyrodejenerativ kasalliklarda ubikuitin-proteazomal yo'lning roli". Nörobilimlerin tendentsiyalari. 24 (11 ta qo'shimcha): S7-14. doi:10.1016 / s0166-2236 (00) 01998-6. PMID 11881748. S2CID 2211658.
  21. ^ a b Ikeda K, Akiyama H, Arai T, Ueno H, Tsuchiya K, Kosaka K (Iyul 2002). "Pik kasalligi va dementsiya bilan birga bo'lgan amiotrofik sklerozning motorli neyron tizimini morfometrik qayta baholash". Acta Neuropathologica. 104 (1): 21–8. doi:10.1007 / s00401-001-0513-5. PMID 12070660. S2CID 22396490.
  22. ^ Manaka H, ​​Kato T, Kurita K, Katagiri T, Shikama Y, Kujirai K, Kavanami T, Suzuki Y, Nihei K, Sasaki H (may 1992). "Kroytsfeldt-yakob kasalligida miya omurilik suyuqligi ubiqitinining sezilarli darajada ko'payishi". Nevrologiya xatlari. 139 (1): 47–9. doi:10.1016 / 0304-3940 (92) 90854-z. PMID 1328965. S2CID 28190967.
  23. ^ Mathews KD, Mur SA (2003 yil yanvar). "Oyoq-kamar mushaklari distrofiyasi". Hozirgi Nevrologiya va Nevrologiya bo'yicha hisobotlar. 3 (1): 78–85. doi:10.1007 / s11910-003-0042-9. PMID 12507416. S2CID 5780576.
  24. ^ Mayer RJ (2003 yil mart). "Neyrodegeneratsiyadan neyroxomostostazgacha: ubikuitinning roli". Dori yangiliklari va istiqbollari. 16 (2): 103–8. doi:10.1358 / dnp.2003.16.2.829327. PMID 12792671.
  25. ^ Calise J, Pauell SR (2013 yil fevral). "Ubikuitinli proteazomalar tizimi va miokard ishemiyasi". Amerika fiziologiya jurnali. Yurak va qon aylanish fiziologiyasi. 304 (3): H337-49. doi:10.1152 / ajpheart.00604.2012. PMC 3774499. PMID 23220331.
  26. ^ Predmore JM, Vang P, Devis F, Bartolone S, Westfall MV, Dyke DB, Pagani F, Powell SR, Day SM (Mar 2010). "Odamning gipertrofik va kengaygan kardiyomiyopatiyalaridagi Ubikuitin proteazom disfunktsiyasi". Sirkulyatsiya. 121 (8): 997–1004. doi:10.1161 / AYDIRISHAHA.109.904557. PMC 2857348. PMID 20159828.
  27. ^ Pauell SR (2006 yil iyul). "Yurak fiziologiyasi va patologiyasida ubikuitin-proteazom tizimi". Amerika fiziologiya jurnali. Yurak va qon aylanish fiziologiyasi. 291 (1): H1-H19. doi:10.1152 / ajpheart.00062.2006. PMID 16501026.
  28. ^ Adams J (2003 yil aprel). "Saraton kasalligini davolashda proteazom inhibisyonining potentsiali". Bugungi kunda giyohvand moddalarni kashf etish. 8 (7): 307–15. doi:10.1016 / s1359-6446 (03) 02647-3. PMID 12654543.
  29. ^ Ben-Neriya Y (yanvar 2002). "Immunitet tizimidagi hamma joyni tartibga solish funktsiyalari". Tabiat immunologiyasi. 3 (1): 20–6. doi:10.1038 / ni0102-20. PMID 11753406. S2CID 26973319.
  30. ^ Egerer K, Kuckelkorn U, Rudolph PE, Rückert JC, Dörner T, Burmester GR, Kloetzel PM, Feist E (oktyabr 2002). "Sirkulyatsion proteazomalar - bu hujayralar shikastlanishi va otoimmun kasalliklarda immunologik faollik ko'rsatkichlari". Revmatologiya jurnali. 29 (10): 2045–52. PMID 12375310.
  31. ^ Qiu V, Vu J, Uolsh EM, Chjan Y, Chen CY, Fujita J, Xiao ZX (Iyul 2008). "Retinoblastoma oqsili saraton hujayralarida p53 barqarorligi va kimyoviy ta'sirchanligini boshqarishda gankirin-MDM2 ni modulyatsiya qiladi". Onkogen. 27 (29): 4034–43. doi:10.1038 / onc.2008.43. PMID 18332869.
  32. ^ a b Ewing RM, Chu P, Elisma F, Li H, Teylor P, Klimi S, McBroom-Cerajewski L, Robinson MD, O'Konnor L, Li M, Teylor R, Dharsee M, Ho Y, Heilbut A, Mur L, Chjan S, Ornatskiy O, Buxman YV, Etier M, Sheng Y, Vasilesku J, Abu-Farha M, Lambert JP, Duelel HS, Styuart II, Kuehl B, Xogue K, Kolvill K, Gladvish K, Muskat B, Kinach R, Adams SL, Moran MF, Morin GB, Topaloglou T, Figeys D (2007). "Mass-spektrometriya bo'yicha odamning oqsil-oqsil o'zaro ta'sirini keng miqyosda xaritalash". Mol. Syst. Biol. 3: 89. doi:10.1038 / msb4100134. PMC 1847948. PMID 17353931.
  33. ^ Rual JF, Venkatesan K, Xao T, Xirozane-Kishikava T, Drikot A, Li N, Berriz GF, Gibbons FD, Dreze M, Ayivi-Gedehoussou N, Klitgord N, Saymon S, Boxem M, Milshteyn S, Rozenberg J, Goldberg DS, Zhang LV, Vong SL, Franklin G, Li S, Albala JS, Lim J, Fraughton C, Llamosas E, Cevik S, Bex C, Lamesch P, Sikorski RS, Vandenhaute J, Zoghbi HY, Smolyar A, Bosak S, Sequerra R, Ducette-Stamm L, Cusick ME, Hill DE, Roth FP, Vidal M (oktyabr 2005). "Odamning oqsil va oqsil bilan o'zaro aloqasi tarmog'ining proteom miqyosli xaritasi tomon". Tabiat. 437 (7062): 1173–8. Bibcode:2005 yil. Nat. 437.1173R. doi:10.1038 / nature04209. PMID 16189514. S2CID 4427026.
  34. ^ Dawson S, Apcher S, Mee M, Higashitsuji H, Baker R, Uhle S, Dubiel V, Fujita J, Mayer RJ (2002 yil mart). "Gankirin - bu ankyrin takrorlanadigan onkoprotein, u CDK4 kinaz va 26 S proteazomning S6 ATPazasi bilan o'zaro ta'sir qiladi". J. Biol. Kimyoviy. 277 (13): 10893–902. doi:10.1074 / jbc.M107313200. PMID 11779854.

Qo'shimcha o'qish

Tashqi havolalar