WikiDer > MYB (gen) - Vikipediya

MYB (gene) - Wikipedia
Mybga o'xshash DNKni bog'laydigan domen
Identifikatorlar
BelgilarMyb_DNA-ni bog'lash
PfamPF00249
InterProIPR001005
KATH1irz
SCOP21irz / QOIDA / SUPFAM
CDDcd00167
MYB
Protein MYB PDB 1guu.png
Mavjud tuzilmalar
PDBOrtholog qidiruvi: PDBe RCSB
Identifikatorlar
TaxalluslarMYB, Cmyb, c-myb, c-myb_CDS, efg, MYB proto-onkogen, transkripsiya omili
Tashqi identifikatorlarOMIM: 189990 MGI: 97249 HomoloGene: 31311 Generkartalar: MYB
Gen joylashuvi (odam)
Xromosoma 6 (odam)
Chr.Xromosoma 6 (odam)[1]
Xromosoma 6 (odam)
MYB uchun genomik joylashuv
MYB uchun genomik joylashuv
Band6q23.3Boshlang135,181,308 bp[1]
Oxiri135,219,173 bp[1]
RNK ekspressioni naqsh
PBB GE MYB 204798 da fs.png
Qo'shimcha ma'lumotni ifodalash ma'lumotlari
Ortologlar
TurlarInsonSichqoncha
Entrez
Ansambl
UniProt
RefSeq (mRNA)

NM_001198914
NM_010848
NM_033597

RefSeq (oqsil)

NP_001185843
NP_034978

Joylashuv (UCSC)Chr 6: 135.18 - 135.22 MbChr 10: 21.12 - 21.16 Mb
PubMed qidirmoq[3][4]
Vikidata
Insonni ko'rish / tahrirlashSichqonchani ko'rish / tahrirlash

Myb genlar katta qismidir genlar oilasi ning transkripsiya omillari hayvonlar va o'simliklarda uchraydi. Odamlarda u o'z ichiga oladi Myb proto-onkogen 1 ga o'xshaydi va Myb bilan bog'liq bo'lgan oqsil B ga qo'shimcha sifatida MYB to'g'ri.[5][6] Kengaytirilgan a'zolar SANT / Myb oilaga shuningdek kiradi SANT domeni va shunga o'xshash boshqa spiral homeoboxo'xshash domenlar.

Funktsiya

Virusli

Myb genlar oilasi shu nomdagi gen nomi bilan atalgan Qushlarning miyeloblastoz virusi. Virusli Myb (v-Myb, P01104) 5'- ketma-ketligini taniydiYAACKG-3 '. Bu tovuqlarda miyeloblastoz (miyeloid leykemiya) ni keltirib chiqaradi.[7] Oddiy hayvon Myb (c-myb) hujayra bilan taqqoslaganda, v-myb C-terminal regulyatsion sohasidagi o'chirishni o'z ichiga oladi, bu esa boshqa onkogenlarning aberrant faollashuviga olib keladi.[8]

Hayvonlar

Myb proto-onkogen oqsili MYB a'zosi (meningeloblastosis) oilasi transkripsiya omillari. Protein uchta domenni o'z ichiga oladi, an N-terminal DNK bilan bog'lanish sohasi, transkripsiyada ishtirok etadigan markaziy transkripsiyani faollashtirish domeni va C-terminal domeni repressiya. U hujayra siklini boshqarishda rol o'ynashi mumkin. Virusli versiya singari, bu gen an onkogenva genning qayta tuzilishi (ko'pincha C-terminal domenida o'chirishni o'z ichiga oladi) saraton kasalligini keltirib chiqaradi.[8]

O'simliklar

MYB omillari konservalangan MYB DNK bilan bog'lanish sohasini o'z ichiga olgan oqsillar oilasini ifodalaydi. O'simliklar tarkibiga R2R3 tipidagi MYB domeni bilan ajralib turadigan MYB-oqsilli subfamiliya kiradi.[9]

Makkajo'xori, flobafenlar flavonoidlar sintetik yo'lida sintez qilinadi[10] polimerlanishidan flavan-4-ols[11][12] bu R2R3 myb-ga o'xshash kodlaydi transkripsiya faollashtiruvchisi[13] uchun kodlovchi A1 genining dihidroflavonol 4-reduktaza (kamaytirish dihidroflavonollar flavan-4-ollarga)[14] boshqa gen esa (Pericarp Pigmentation 1 yoki SPP1 supressori) a vazifasini bajaradi supressor.[15] Makkajo'xori P geni umurtqali hayvonlar Myb oqsillari bilan bog'langan YAACGG bilan keskin farqli o'laroq, CCWACC ketma-ketligini tan oladigan Myb gomologini kodlaydi.[16]

Sorgumda tegishli sariq urug '1 gen (y1)[17] shuningdek, ifodasini tartibga soluvchi Myb domen oqsilining R2R3 turini kodlaydi xalkon sintezi, xalkon izomerazasi va dihidroflavonol reduktaza ning biosintezi uchun zarur bo'lgan genlar 3-deoksiflavonoidlar.[18]

Ruby - tsitrus mevalarida antosiyanin ishlab chiqaradigan genlarning MYB transkripsiya faollashtiruvchisi. Ko'pgina tsitrus navlarida Ruby ishlamaydi, ammo qon apelsinida antosiyanin ishlab chiqarishni tartibga soladi va mevaning o'ziga xos qizil rangini hosil qiladi.[19]

Shuningdek qarang

Adabiyotlar

  1. ^ a b v GRCh38: Ensembl relizi 89: ENSG00000118513 - Ansambl, 2017 yil may
  2. ^ a b v GRCm38: Ensembl relizi 89: ENSMUSG00000019982 - Ansambl, 2017 yil may
  3. ^ "Human PubMed ma'lumotnomasi:". Milliy Biotexnologiya Axborot Markazi, AQSh Milliy Tibbiyot Kutubxonasi.
  4. ^ "Sichqoncha PubMed ma'lumotnomasi:". Milliy Biotexnologiya Axborot Markazi, AQSh Milliy Tibbiyot Kutubxonasi.
  5. ^ Chen Y, Xu H, Liu J, Zhang C, Leutz A, Mo X (iyul 2007). "C-Myb qon tomir silliq mushak hujayralarida PDGF vositachiligida omon qolish signalining quyi yo'nalishi vazifasini bajaradi". Biokimyo Biofiz Res Commun. 360 (2): 433–6. doi:10.1016 / j.bbrc.2007.06.078. PMID 17599807.
  6. ^ "Entrez Gen: v-myb myeloblastosis virusli onkogen homolog (qush)".
  7. ^ Klempnauer KH, Symonds G, Evan GI, Bishop JM (iyun 1984). "Qushlarning miyeloblastoz virusi onkogenlari va E26 qush leykemiya virusi va tovuq c-myb geni bilan kodlangan oqsillarni hujayradan tashqariga joylashishi". Hujayra. 37 (2): 537–47. doi:10.1016/0092-8674(84)90384-2. PMID 6327074. S2CID 46196167.
  8. ^ a b Jorj OL, Ness SA (oktyabr 2014). "Vaziyatni anglash: differentsiatsiya, hujayra tsikli va onkogenezdagi myb transkripsiyasi omilini boshqarish". Saraton. 6 (4): 2049–71. doi:10.3390 / saraton kasalligi6042049. PMC 4276956. PMID 25279451.
  9. ^ Stracke R, Werber M, Weisshaar B (oktyabr 2001). "Arabidopsis talianasida R2R3-MYB genlar oilasi". Curr. Opin. Biol o'simlik. 4 (5): 447–56. doi:10.1016 / s1369-5266 (00) 00199-0. PMID 11597504.
  10. ^ Ximi E, Mares DJ, Yanagisawa A, Noda K (iyul 2002). "Donli rang genining (R) donning uyquchanligiga ta'siri va embrionning bug'doy tarkibidagi absisik kislotaga (ABA) ta'sirchanligi". J. Exp. Bot. 53 (374): 1569–74. doi:10.1093 / jxb / erf005. PMID 12096095.
  11. ^ Vinkel-Shirli B (iyun 2001). "Flavonoid biosintezi. Genetika, biokimyo, hujayra biologiyasi va biotexnologiyasining rang-barang modeli". O'simliklar fizioli. 126 (2): 485–93. doi:10.1104 / s.12.12.2.485. PMC 1540115. PMID 11402179.
  12. ^ Chopra S, Cocciolone SM, Bushman S, Sangar V, McMullen MD, Peterson T (mart 2003). "Apelsin1 uchun makkajo'xori beqaror omili - bu perikarp rangining jim alleli bo'lgan to'qimalarning dominant epigenetik modifikatori".. Genetika. 163 (3): 1135–46. PMC 1462483. PMID 12663550.
  13. ^ Makkajo'xori tarkibidagi murakkab P1-wr klasterining tarkibiy va transkripsiyaviy tahlili. Volfgang Gyotel, Yoaxim Messing. O'simliklar va hayvonlarning genomlari XVI konferentsiyasi Arxivlandi 2012-02-18 da Orqaga qaytish mashinasi
  14. ^ Dong X, Braun EL, Grotewold E (sentyabr 2001). "Arabidopsis flavonoid mutantlarini makkajo'xori genlari bilan to'ldirish natijasida aniqlangan o'simliklarning ikkinchi darajali metabolik fermentlarini funktsional konservatsiyasi" (PDF). O'simliklar fizioli. 127 (1): 46–57. doi:10.1104 / s.127.1.46. PMC 117961. PMID 11553733.
  15. ^ Li EA, Harper V (2002). "Pericarp Pigmentation 1 supressori (SPP1), makkajo'xori (Zea mays L.) perikarpsida phlobaphene to'planishida ishtirok etgan yangi gen". Maydika. 47 (1): 51–58. INIST:13772300
  16. ^ Grotewold E, Drummond BJ, Bowen B, Peterson T (1994). "Myb-homolog P geni flavonoid biosintez genining pastki qismini to'g'ridan-to'g'ri faollashtirish orqali makkajo'xori gullari a'zolarida phlobaphene pigmentatsiyasini boshqaradi". Hujayra. 76 (3): 543–554. doi:10.1016/0092-8674(94)90117-1. PMID 8313474. S2CID 42197232.
  17. ^ Boddu J, Svabek C, Ibrahim F, Jons AD, Chopra S (2005). "3-deoksiflavonoidlarning yo'qolishini ko'rsatuvchi Myb geni sarg'ish urug 'urug'ining yo'q qilinish allelining xarakteristikasi". O'simlikshunoslik. 169 (3): 542–552. doi:10.1016 / j.plantsci.2005.05.007. INIST:16983977
  18. ^ Boddu J, Jiang C, Sangar V, Olson T, Peterson T, Chopra S (yanvar 2006). "3-deoksiflavonoid biosintezining ortologik myb transkripsiyasi regulyatorlarini o'z ichiga olgan jo'xori va makkajo'xori nusxalarini qiyosiy tarkibiy va funktsional tavsifi". Mol zavodi. Biol. 60 (2): 185–99. doi:10.1007 / s11103-005-3568-1. PMID 16429259. S2CID 23841582.
  19. ^ Butelli E, Licciardello C, Zhang Y, Liu J, Mackay S, Bailey P, Reforgiato-Recupero G, Martin C (2012). "Retrotranspozonlar qonga to'q sariq rangda antosiyaninlarning mevalarga xos, sovuqqa bog'liq to'planishini nazorat qiladi". O'simlik hujayrasi. 24 (3): 1242–55. doi:10.1105 / tpc.111.095232. PMC 3336134. PMID 22427337.

Qo'shimcha o'qish

Tashqi havolalar

Ushbu maqolada Amerika Qo'shma Shtatlarining Milliy tibbiyot kutubxonasiichida joylashgan jamoat mulki.