WikiDer > Kichik Kajal tanasiga xos RNK 15

Small Cajal body specific RNA 15
Kichik Kajal tanasiga xos RNK 15
RF00426.jpg
Bashorat qilingan ikkilamchi tuzilish va ketma-ketlikni saqlash SCARNA15
Identifikatorlar
BelgilarSCARNA15
Alt. BelgilarsnoACA45
RfamRF00426
Boshqa ma'lumotlar
RNK turiGen; snRNA; snoRNA; scrNA
Domen (lar)Eukaryota
GOGO muddati GO bilan boshlanishi kerak: GO muddati GO bilan boshlanishi kerak: GO muddati GO bilan boshlanishi kerak:
SOSO: 0000275
PDB tuzilmalarPDBe

Kichik Kajal tanasiga xos RNK 15 (shuningdek, nomi bilan tanilgan SCARNA15 yoki ACA45) a kichik nukleolyar RNK ichida topilgan Kajal jasadlari va psevdouridilatsiyaga aloqador deb ishoniladi (izomerizatsiya ning siydik ga pseudouridin) ning U1 splitseozomal RNK.

scaRNAlar ma'lum bir sinfdir kichik nukleolyar RNKlar ga mahalliylashtiradigan Kajal jasadlari va modifikatsiyasini boshqaring RNK polimeraza II ko'chirildi splitseozomal RNKlar U1, U2, U4, U5 va U12.[1]

ACA45 ga tegishli H / ACA qutisi hidoyat RNKlari klassi, chunki u taxmin qilingan soch qisqich-menteşe-soch qisqich-quyruq tuzilishi, konservalangan H / ACA-quti motiflari va GAR1 bilan bog'liq.[2] ACA45 U2 splitseozomal snRNA ning U37 qoldig'ining psevdouridilatsiyasini boshqarishi taxmin qilinmoqda.[3]

Inson ACA45 ni 21 ga qayta ishlash mumkinligi ko'rsatilgan nukleotidlar uzoq etuk miRNA tomonidan RNAse III oilasi endoribonukleaza dicer.[4] Ushbu snoRNA mahsuloti ilgari mmu-miR-1839 sifatida aniqlangan[5] va boshqa miRNA hosil bo'lishidan mustaqil ravishda qayta ishlanganligi ko'rsatilgan endoribonukleaza drosha.[6]

Adabiyotlar

  1. ^ Darzacq X, Jady BE, Verheggen C, Kiss AM, Bertrand E, Kiss T (iyun 2002). "Kajal tanasiga xos bo'lgan kichik yadroli RNKlar: 2'-O-metillanish va psevdouridilatsiya bo'yicha qo'llanma RNKlarning yangi klassi". EMBO jurnali. 21 (11): 2746–56. doi:10.1093 / emboj / 21.11.2746. PMC 126017. PMID 12032087.
  2. ^ Kiss AM, Jády BE, Bertrand E, Kiss T (2004 yil iyul). "Inson qutisi H / ACA pseudouridilatsiya qo'llanmasi RNK apparati". Molekulyar va uyali biologiya. 24 (13): 5797–807. doi:10.1128 / MCB.24.13.5797-5807.2004. PMC 480876. PMID 15199136.
  3. ^ Lestrade L, Weber MJ (2006 yil yanvar). "snoRNA-LBME-db, insonning H / ACA va C / D qutilari snoRNAlarining keng ma'lumotlar bazasi". Nuklein kislotalarni tadqiq qilish. 34 (Ma'lumotlar bazasi muammosi): D158-62. CiteSeerX 10.1.1.105.7552. doi:10.1093 / nar / gkj002. PMC 1347365. PMID 16381836.
  4. ^ Ender C, Krek A, Fridländer MR, Beytsinger M, Vaynman L, Chen V, Pfeffer S, Rajevskiy N, Meister G (Noyabr 2008). "MikroRNKga o'xshash funktsiyalarga ega bo'lgan odam snoRNA". Molekulyar hujayra. 32 (4): 519–28. doi:10.1016 / j.molcel.2008.10.017. PMID 19026782.
  5. ^ "mmu-miR-1839". MiRBase.
  6. ^ Babiarz JE, Ruby JG, Vang Y, Bartel DP, Blelloch R (oktyabr 2008). "Sichqoncha ES hujayralari endogen shRNA, siRNA va boshqa Mikroprotsessorga bog'liq bo'lmagan, Dicerga bog'liq kichik RNKlarni ifoda etadi". Genlar va rivojlanish. 22 (20): 2773–85. doi:10.1101 / gad.1705308. PMC 2569885. PMID 18923076.

Tashqi havolalar