WikiDer > Kichik Kajal tanasiga xos RNK 6

Small Cajal body specific RNA 6
Kichik Kajal tanasiga xos RNK 6
RF00478.jpg
Bashorat qilingan ikkilamchi tuzilish va ketma-ketlikni saqlash SCARNA6
Identifikatorlar
BelgilarSCARNA6
Alt. BelgilarU88
RfamRF00478
Boshqa ma'lumotlar
RNK turiGen; snRNA; snoRNA; scrNA
Domen (lar)Eukaryota
GOGO muddati GO bilan boshlanishi kerak: GO muddati GO bilan boshlanishi kerak:
SOSO: 0000275
PDB tuzilmalarPDBe

Kichik Kajal tanasiga xos RNK 6 (shuningdek, nomi bilan tanilgan SCARNA6 yoki U88) a kichik nukleolyar RNK ichida topilgan Kajal jasadlari va psevdouridilatsiyaga aloqador deb ishoniladi (izomerizatsiya ning siydik ga pseudouridin) ning U5 splitseozomal RNK.

scaRNAlar ma'lum bir sinfdir kichik nukleolyar RNKlar ga mahalliylashtiradigan Kajal jasadlari va modifikatsiyasini boshqaring RNK polimeraza II ko'chirildi splitseozomal RNKlar U1, U2, U4, U5 va U12[1]

U88 fibrillyarin va Gar1p bilan birikkan va Kajal tanalarida lasan bilan birgalikda lokalizatsiyalangan.[1]Bu g'ayrioddiy qo'llanma RNK, chunki u ikkalasidan iborat H / ACA qutisi va a C / D qutisi saqlangan domenlar. 2'- ni boshqarishi taxmin qilinmoqdaO-U5 snRNA ning U41 qoldiqlarini metilatsiyalash.[1]

U88, shuningdek, boshqa odam snoRNAs scaRNA U87 va sichqonchaning homologi MBI-46 bilan chambarchas bog'liq.[2]Inson genomida U88 va U87 skaRNKlari bir xil mezbon geniga ega.[1][3]

Adabiyotlar

  1. ^ a b v d Darzacq X, Jady BE, Verheggen C, Kiss AM, Bertrand E, Kiss T (iyun 2002). "Kajal tanasiga xos bo'lgan kichik yadroli RNKlar: 2'-O-metillanish va psevdouridilatsiya bo'yicha qo'llanma RNKlarning yangi klassi". EMBO jurnali. 21 (11): 2746–56. doi:10.1093 / emboj / 21.11.2746. PMC 126017. PMID 12032087.
  2. ^ Hüttenhofer A, Kiefmann M, Meier-Ewert S, O'Brien J, Lehrach H, Bachellerie JP, Brosius J (iyun 2001). "RNomics: sichqonchada yangi, kichik, messenjer bo'lmagan RNKlarga 201 nomzodni aniqlaydigan eksperimental yondashuv". EMBO jurnali. 20 (11): 2943–53. doi:10.1093 / emboj / 20.11.2943. PMC 125495. PMID 11387227.
  3. ^ Lestrade L, Weber MJ (2006 yil yanvar). "snoRNA-LBME-db, insonning H / ACA va C / D qutilari snoRNAlarining keng ma'lumotlar bazasi". Nuklein kislotalarni tadqiq qilish. 34 (Ma'lumotlar bazasi muammosi): D158-62. CiteSeerX 10.1.1.105.7552. doi:10.1093 / nar / gkj002. PMC 1347365. PMID 16381836.

Tashqi havolalar