WikiDer > CLIC1

CLIC1

CLIC1

Protein CLIC1 PDB 1k0m.png

Mavjud tuzilmalar

Ortholog qidiruvi: PDBe RCSB

PDB id kodlari ro'yxati
1K0M, 1K0N, 1K0O, 1RK4, 3O3T, 3P8W, 3P90, 3QR6, 3SWL, 3TGZ, 3UVH, 4IQA, 4JZQ, 4K0G, 4K0N

Identifikatorlar

CLIC1, G6, NCC27, xlorid hujayra ichidagi kanal 1, CL1C1, CLCNL1

Tashqi identifikatorlar

OMIM: 602872 MGI: 2148924 HomoloGene: 20343 Generkartalar: CLIC1

Gen joylashuvi (odam)

Chr.	Xromosoma 6 (odam)^[1]

Band	6p21.33	Boshlang	31,730,581 bp^[1]
Band	6p21.33	Oxiri	31,739,763 bp^[1]

RNK ekspressioni naqsh

Qo'shimcha ma'lumotni ifodalash ma'lumotlari

Gen ontologiyasi
Molekulyar funktsiya	• kuchlanishli ionli kanal faoliyati • GO: 0001948 oqsil bilan bog'lanish • xlorid kanallari faoliyati • kaderin bilan bog'lash • glutation transferaz faolligi
Uyali komponent	• sitoplazma • membrananing ajralmas komponenti • pufakcha • membrana emas • qon mikropartikulasi • yadroviy konvert • membrana • hujayra membranasi • xlorli kanal kompleksi • mitoxondriya • cho'tka chegarasi • sitoplazmaning perinuklear mintaqasi • hujayra tashqari ekzozoma • hujayra yadrosi • hujayradan tashqari
Biologik jarayon	• ion transmembranali transportni tartibga solish • ion transporti • hujayra aylanishini tartibga solish • mitoxondriyal membrana salohiyatini tartibga solish • osteoblast differentsiatsiyasini ijobiy tartibga solish • xloridni tashish • trombotsitlar agregatsiyasi • signal uzatish • xlorli transmembranani tashish • glutation metabolik jarayoni • transport
Manbalar:Amigo / QuickGO

Turlar

Inson

Sichqoncha


1192


114584

ENSG00000213719 ENSG00000223639 ENSG00000226248 ENSG00000226651 ENSG00000226417
ENSG00000230685 ENSG00000206394


ENSMUSG00000007041


O00299


Q9Z1Q5

RefSeq (mRNA)


NM_001288 NM_001287593 NM_001287594


NM_033444

RefSeq (oqsil)


NP_001274522 NP_001274523 NP_001279


NP_254279

Joylashuv (UCSC)

Chr 6: 31.73 - 31.74 Mb

n / a

PubMed qidirmoq

^[2]

^[3]

Insonni ko'rish / tahrirlash

Sichqonchani ko'rish / tahrirlash

Xlorid hujayra ichidagi kanal oqsili 1 a oqsil odamlarda kodlanganligi CLIC1 gen.^[4]^[5]

Xlorid kanallari - bu hujayra membranasi potentsialini barqarorlashtirish, transepitelial transport, saqlashni o'z ichiga olgan asosiy uyali jarayonlarni tartibga soluvchi turli xil oqsillar guruhi. hujayra ichidagi pHva hujayra hajmini tartibga solish. Xlorid hujayra ichidagi kanal 1 p64 oilasining a'zosi; oqsil asosan hujayra yadrosida joylashadi va xlorid ionli kanal faolligi va yadro hamda plazma membranasini namoyish etadi.^[5]

O'zaro aloqalar

CLIC1 ga ko'rsatildi o'zaro ta'sir qilish bilan TRAPPC2.^[6]

Shuningdek qarang

Xlorli kanal

Adabiyotlar

^ ^a ^b ^v ENSG00000223639, ENSG00000226248, ENSG00000226651, ENSG00000226417, ENSG00000230685, ENSG00000206394 GRCh38: Ensembl reliz 89: ENSG00000213719, ENSG00000223639, ENSG0000022600, ENGG00000226000, ENSG00000226000, ENGG00000226000, - Ansambl, 2017 yil may
^ "Human PubMed ma'lumotnomasi:". Milliy Biotexnologiya Axborot Markazi, AQSh Milliy Tibbiyot Kutubxonasi.
^ "Sichqoncha PubMed ma'lumotnomasi:". Milliy Biotexnologiya Axborot Markazi, AQSh Milliy Tibbiyot Kutubxonasi.
^ Valenzuela SM, Martin DK, Por SB, Robbins JM, Varton K, Bootkov MR, Shofild PR, Kempbell TJ, Breit SN (iyun 1997). "Molekulyar klonlash va hujayra yadrolarining xlorli ion kanalining ekspressioni". J Biol Chem. 272 (19): 12575–82. doi:10.1074 / jbc.272.19.12575. PMID 9139710.
^ ^a ^b "Entrez Gen: CLIC1 xlorid hujayra ichidagi kanal 1".
^ Fan, Libin; Yu Vey; Zhu Xueliang (2003 yil aprel). "Sedlinning xlorid hujayra ichidagi kanal oqsillari bilan o'zaro ta'siri". FEBS Lett. Gollandiya. 540 (1–3): 77–80. doi:10.1016 / S0014-5793 (03) 00228-X. ISSN 0014-5793. PMID 12681486. S2CID 8573651.

Qo'shimcha o'qish

Singh H (2010). "Xlorid xlorid hujayra ichidagi kanallari (CLIC) bilan ikki o'n yillik". FEBS xatlari. 584 (10): 2112–21. doi:10.1016 / j.febslet.2010.03.013. PMID 20226783. S2CID 21056278.
Okubo K, Xori N, Matoba R va boshq. (1994). "Gen ekspressionining miqdoriy va sifat jihatlarini tahlil qilish uchun keng ko'lamli cDNA sekvensiyasi". Nat. Genet. 2 (3): 173–9. doi:10.1038 / ng1192-173. PMID 1345164. S2CID 35309579.
Frigerio JM, Bertezen P, Garrido P va boshq. (1995). "Odamning kolorektal saraton kasalligi cDNA kutubxonasidan 2166 klonni qisman sekvensiya orqali tahlil qilish". Hum. Mol. Genet. 4 (1): 37–43. doi:10.1093 / hmg / 4.1.37. PMID 7711732.
Singx X, Eshli RH (2006). "CLIC1-ni sistein qoldiqlari tomonidan oksidlanish-qaytarilish regulyatsiyasi, Putativ kanal teshigi bilan bog'liq". Biofiz. J. 90 (5): 1628–1638. Bibcode:2006BpJ .... 90.1628S. doi:10.1529 / biofhysj.105.072678. PMC 1367314. PMID 16339885.
Liew CC, Hwang DM, Fung YW va boshq. (1994). "Belgilangan ketma-ketlik yorliqlari bilan aniqlangan yurak-qon tomir tizimidagi genlar katalogi". Proc. Natl. Akad. Ilmiy ish. AQSH. 91 (22): 10645–9. Bibcode:1994 yil PNAS ... 9110645L. doi:10.1073 / pnas.91.22.10645. PMC 45078. PMID 7938007.
Maruyama K, Sugano S (1994). "Oligo-kepka: eukaryotik mRNAlarning kepka tuzilishini oligoribonukleotidlar bilan almashtirishning oddiy usuli". Gen. 138 (1–2): 171–4. doi:10.1016/0378-1119(94)90802-8. PMID 8125298.
Heiss NS, Poustka A (1997). "Xq28 da yangi CLIC2 xlorli kanal genining genomik tuzilishi". Genomika. 45 (1): 224–8. doi:10.1006 / geno.1997.4922. PMID 9339381.
Suzuki Y, Yoshitomo-Nakagava K, Maruyama K va boshq. (1997). "To'liq boyitilgan va 5'darajali boyitilgan cDNA kutubxonasini qurish va tavsifi". Gen. 200 (1–2): 149–56. doi:10.1016 / S0378-1119 (97) 00411-3. PMID 9373149.
Tulk BM, Edvards JK (1998). "NCC27, hujayra ichidagi Cl homologi⁻ kanal p64, buyrak proksimal tubulasining cho'tkasi chegarasida ifodalangan ". Am. J. Fiziol. 274 (6 Pt 2): F1140-9. doi:10.1152 / ajprenal.1998.274.6.F1140. PMID 9841507.
Chuang JZ, Milner TA, Zhu M, Sung CH (1999). "29 kDa hujayra ichidagi xlorid p64H1 kalamush hipokampal neyronlarida katta zich yadroli pufakchalar bilan bog'liq". J. Neurosci. 19 (8): 2919–28. doi:10.1523 / JNEUROSCI.19-08-02919.1999. PMC 6782274. PMID 10191309.
Ribas G, Nevill M, Vixon JL va boshq. (1999). "Leykotsitlar antijeni 6 yangi superfamilasining uchta yangi a'zosini va Ig superfamilasining yangi a'zosini kodlovchi genlar, shuningdek regulyativ yadro xlorid ion kanal oqsili (hRNCC) va N omega-N omega-dimetilarginin dimetilaminohidrolaza homologini kodlovchi genlar bilan birga topilgan. MHC III sinf mintaqasining 30 kb segmenti ". J. Immunol. 163 (1): 278–87. PMID 10384126.
Berryman M, Bretscher A (2000). "Plasental mikrovillalarning aktin sitoskeletasi bilan bog'langan xlorid hujayra ichidagi kanal geni oilasining (CLIC5) yangi a'zosini aniqlash". Mol. Biol. Hujayra. 11 (5): 1509–21. doi:10.1091 / mbc.11.5.1509. PMC 14863. PMID 10793131.
Tonini R, Ferroni A, Valenzuela SM va boshqalar. (2000). "NCC27 yadro oqsilining barqaror transfektsiyalangan CHO-K1 hujayralaridagi funktsional tavsifi". FASEB J. 14 (9): 1171–8. doi:10.1096 / fasebj.14.9.1171. PMID 10834939. S2CID 30652670.
Valenzuela SM, Mazzanti M, Tonini R va boshqalar. (2001). "NCC27 yadro xlorid ion kanali hujayra siklini boshqarishda ishtirok etadi". J. Fiziol. 529 (3): 541–52. doi:10.1111 / j.1469-7793.2000.00541.x. PMC 2270212. PMID 11195932.
Harrop SJ, DeMaere MZ, Fairlie WD va boshq. (2002). "1.4-A piksellar sonidagi CLIC1 (NCC27) hujayra ichidagi xlorli ion kanalining eruvchan shakli kristalli tuzilishi". J. Biol. Kimyoviy. 276 (48): 44993–5000. doi:10.1074 / jbc.M107804200. PMID 11551966.
Warton K, Tonini R, Fairlie WD va boshq. (2002). "Rekombinant CLIC1 (NCC27) pHga bog'liq bo'lgan ikki holatli jarayon orqali lipid ikki qavatli qatlamda yig'ilib, xlorid ion kanallarini hosil qiladi, ular CLIC1 ni ifodalovchi xitoylik hamster tuxumdonlarida kuzatiladi". J. Biol. Kimyoviy. 277 (29): 26003–11. doi:10.1074 / jbc.M203666200. PMID 11978800.
Shanks RA, Larocca MC, Berryman M va boshq. (2002). "AKAP350 Golgi apparatida. II. AKAP350 ning yangi xlorid hujayra ichidagi kanal (CLIC) oila a'zosi bilan assotsiatsiyasi". J. Biol. Kimyoviy. 277 (43): 40973–80. doi:10.1074 / jbc.M112277200. PMID 12163479.
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH va boshq. (2003). "15000 dan ortiq to'liq uzunlikdagi odam va sichqonchani cDNA sekanslarini yaratish va dastlabki tahlil qilish". Proc. Natl. Akad. Ilmiy ish. AQSH. 99 (26): 16899–903. doi:10.1073 / pnas.242603899. PMC 139241. PMID 12477932.
Fan L, Yu V, Zhu X (2003). "Sedlinning xlorid hujayra ichidagi kanal oqsillari bilan o'zaro ta'siri". FEBS Lett. 540 (1–3): 77–80. doi:10.1016 / S0014-5793 (03) 00228-X. PMID 12681486. S2CID 8573651.
Mungall AJ, Palmer SA, Sims SK va boshqalar. (2003). "DNKning ketma-ketligi va inson xromosomasining tahlili 6". Tabiat. 425 (6960): 805–11. Bibcode:2003 yil natur.425..805M. doi:10.1038 / nature02055. PMID 14574404.
Littler DR, Harrop SJ, Fairlie WD va boshq. (2004). "CLIC1 hujayra ichidagi xlorli ion kanalli oqsil oksidlanish-qaytarilish bilan boshqariladigan tizimli o'tishdan o'tmoqda". J. Biol. Kimyoviy. 279 (10): 9298–305. doi:10.1074 / jbc.M308444200. PMID 14613939.
Singx X, amakivachcha MA, Eshli RH (2007). "CLIC1, CLIC4 va CLIC5 sutemizuvchilarning" xlorid hujayra ichidagi kanallari "ning funktsional qayta tiklanishi sitoskeletal aktin bilan differentsial regulyatsiyani aniqlaydi". FEBS J. 274 (24): 6306–6316. doi:10.1111 / j.1742-4658.2007.06145.x. PMID 18028448. S2CID 22494250.

Tashqi havolalar

CLIC1 + oqsil, + odam AQSh Milliy tibbiyot kutubxonasida Tibbiy mavzu sarlavhalari (MeSH)
Inson CLIC1 genom joylashuvi va CLIC1 gen tafsilotlari sahifasida UCSC Genome brauzeri.

Ushbu maqolada Amerika Qo'shma Shtatlarining Milliy tibbiyot kutubxonasiichida joylashgan jamoat mulki.

v t e PDB galereyasi
1k0m: 1.4 angstromda CLIC1 ning eruvchan monomerik shaklining kristalli tuzilishi 1k0n: Glutation bilan komplekslangan xlorid hujayra ichidagi 1-kanal (CLIC1) 1k0o: CLIC1 ning eruvchan shakli kristalli tuzilishi. Hujayra ichidagi xlorid ionli kanal 1rk4: Oksidlangan CLIC1 ning eruvchan dimerik shakli kristalli tuzilishi

Membranani tashiydigan oqsil: ion kanallari (TC 1A)

Ca²⁺: Kaltsiy kanali

Ligand darvozasi	Inositol trisfosfat retseptorlari 1 2 3 Ryanodin retseptorlari 1 2 3
Kuchlanish	L turi/Ca_va 1.1 1.2 1.3 1.4 N-turi/Ca_va2.2 P turi/Ca_va 2.1 Q turi/Ca_va2.1 R turi/Ca_va2.3 T turi/Ca_va 3.1 3.2 3.3 a₂b-kichik birliklar 1 2 b-kichik birliklar β1 β2 β3 β4 b-kichik birliklar γ1 γ2 γ3 γ4 Spermatozoidlarning kation kanallari 1 2 3 4 Ikki teshikli kanal 1 2

Na⁺: Natriy kanali

Konstitutsiyaviy ravishda faol	Epiteliya natriy kanali a β γ δ
Proton- eshik	Amiloridga sezgir kation kanali 1 2 3 4
Kuchlanish	Na_va 1.1 1.2 1.3 1.4 1.5 1.6 1.7 1.8 1.9 7A Na_vβ 1 2 3 4

K⁺: Kaliy kanali

Kaltsiy bilan faollashtirilgan	BK kanali a1 β1 β2 β3 β4 SK kanali SK1 SK2 SK3 IK kanali IK1 K_Ca 1.1 2.1 2.2 2.3 3.1 4.1 4.2 5.1
Ichkariga to'g'rilash moslamasi	K_ATP K_ir 1.1 2.1 2.2 2.3 2.4 2.6 QIZ/K_ir 3.1 3.2 3.3 3.4 K_ir 4.1 4.2 5.1 6.1 6.2 7.1
Tandem teshiklari domeni	K2P 1 2 3 4 5 6 7 9 10 12 13 15 16 17 18
Kuchlanish	K_va1-6 1.1 1.2 1.3 1.4 1.5 1.6 1.7 1.8 2.1 2.2 3.1 3.2 3.3 3.4 4.1 4.2 4.3 5.1 6.1 6.2 6.3 6.4 K_va7-12 7.1 7.2 7.3 7.4 7.5 8.1 8.2 9.1 9.2 9.3 10.1 10.2 11.1 / hERG 11.2 11.3 12.1 12.2 12.3 K_vβ 1 2 3 KCNIP 1 2 3 4 minK / ISK minK / ISKga o'xshash MiRP 1 2 3 Shaker (gen)

Turli xil

Cl⁻: Xlorli kanal	Kaltsiy bilan faollashtirilgan xlorli kanallar Anoktamin ANO1 Bestrophin 1 2 Xlorli kanal aksessuari 1 2 3 4 CFTR CLCN 1 2 3 4 5 6 7 KA KB CLIC 1 2 3 4 5 6 L1 CLNS 1A 1B
H⁺: Proton kanali	HVCN1
M⁺: CNG kationlari kanali	a 1 2 3 4 β 1 2 3 HCN FK 1 2 3 4
M⁺: TRP kation kanali	TRPA (1) TRPC 1 2 3 4 4AP 5 6 7 TRPM 1 2 3 4 5 6 7 8 TRPML 1 2 3 TRPN TRPP 1 2 TRPV 1 2 3 4 5 6
H₂O (+ eritilgan): Porin	Akvaparin 0 1 2 3 4 5 6 7 8 9 Voltajga bog'liq bo'lgan anion kanali 1 2 3 Umumiy bakterial porinlar oilasi
Sitoplazma: Bo'shliq birikmasi	Konnexin A GJA1 GJA3 GJA4 GJA5 GJA8 GJA9 GJA10 B GJB1 GJB2 GJB3 GJB4 GJB5 GJB6 GJB7 C GJC1 GJC2 GJC3 D. GJD2 GJD3 GJD4 Innexin

Darvoza mexanizmi orqali

Ion kanal sinfi	Ligand darvozasi Yengil eshik Kuchlanish Stretch faollashtirilgan

Shuningdek qarang buzilishlar

Bu membrana oqsili- tegishli maqola a naycha. Siz Vikipediyaga yordam berishingiz mumkin uni kengaytirish.